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生物演化与发展
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进化论、生物系统发育
利用数字进化研究大灭绝对群落稳定性和协调停滞现象出现的影响
章太炎的进化论思想研究
生物进化中的n-性别种群及其特点与推广
公众理解进化论研究中的认知风格
势函数在进化动力学中的应用
转基因技术对生物进化论的挑战
达尔文生物进化论发展过程研究--基于科学思想史的视角
基于生物学思想史的道德演化论比较：达尔文与迈尔之间
论休谟思想对达尔文“生物共同由来说”的影响
进化非决定论问题的研究
Digevol数字生物平台的设计、建立和在生物进化模拟实验中的初步应用
进化的势与流地貌理论
《物种起源》第一版与第六版之比较
华莱士与达尔文的自然选择理论之比较
自然种类的本质问题研究
技术进化的达尔文主义解读
系统发育树构建中的EM算法
达尔文的生态学思想述评
组份距离方法构建基于两组蛋白质的原核生物亲缘树
生命的信息本质与生物进化机制的哲学探索
恩斯特·迈尔进化论思想研究
进化论学说在新中国的传播研究--以《人民日报》（1949-2009）为例
达尔文的进化论与全球化
达尔文的进化论与社会达尔文主义
从道金斯与古尔德之争看达尔文主义的未来发展及意义
论进化生物学的统一
从《物种起源》到《人类的由来》--达尔文生态思想的进化分析
生物进化论在中国的传播（1873-1937）
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