摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-8页 |
第一章 绪论 | 第9-15页 |
1.1 立题背景 | 第9-12页 |
1.1.1 概述 | 第9页 |
1.1.2 菌群微生物研究方法 | 第9-11页 |
1.1.3 酱香型高温大曲制曲微生物菌群结构 | 第11-12页 |
1.1.3.1 酱香高温大曲细菌微生物菌群结构 | 第11页 |
1.1.3.2 酱香高温大曲真菌微生物菌群结构 | 第11-12页 |
1.2 主要内容和意义 | 第12-15页 |
1.2.1 主要内容 | 第12-13页 |
1.2.2 研究意义 | 第13-14页 |
1.2.3 技术路线 | 第14-15页 |
第二章 传统和机械制曲细菌群落结构分析 | 第15-34页 |
2.1 材料与方法 | 第15-19页 |
2.1.1 材料 | 第15-16页 |
2.1.1.1 样品采集 | 第15-16页 |
2.1.1.2 主要试剂 | 第16页 |
2.1.1.3 主要仪器 | 第16页 |
2.1.2 实验方法 | 第16-19页 |
2.1.2.1 样品的预处理 | 第16-17页 |
2.1.2.2 样品总DNA提取 | 第17页 |
2.1.2.3 DNA测序 | 第17-19页 |
2.1.2.4 菌群结构分析 | 第19页 |
2.2 结果与分析 | 第19-33页 |
2.2.1 制曲过程中细菌群落结构分析 | 第19-24页 |
2.2.1.1 基于OTU聚类分析 | 第19-21页 |
2.2.1.2 物种组成结构及其变化 | 第21-24页 |
2.2.2 细菌群落生态结构差异性 | 第24-29页 |
2.2.2.1 细菌生态结构NMDS分析 | 第24-25页 |
2.2.2.2 细菌菌群生态结构热谱图(Heatmap) | 第25-27页 |
2.2.2.3 细菌群落LEfSe分析 | 第27-29页 |
2.2.3 环境因子对曲胚中细菌生态多样性的影响 | 第29-33页 |
2.2.3.1 细菌群落RDA分析 | 第29-31页 |
2.2.3.2 细菌生态结构中物种相关性热图分析 | 第31-33页 |
2.3 小结 | 第33-34页 |
第三章 传统和机械制曲真菌群落结构分析 | 第34-48页 |
3.1 材料与方法 | 第34-35页 |
3.1.1 材料 | 第34页 |
3.1.1.1 大曲样品 | 第34页 |
3.1.1.2 主要试剂 | 第34页 |
3.1.1.3 主要仪器 | 第34页 |
3.1.2 方法 | 第34-35页 |
3.1.2.1 样品的预处理 | 第34页 |
3.1.2.2 样品总DNA提取 | 第34-35页 |
3.1.2.3 DNA测序 | 第35页 |
3.1.2.4 群落结构分析 | 第35页 |
3.2 结果与分析 | 第35-47页 |
3.2.1 真菌群落结构组成 | 第35-39页 |
3.2.1.1 基于OTU的聚类分析 | 第35-37页 |
3.2.1.2 真菌物种组成结构 | 第37-39页 |
3.2.2 真菌群落结构差异性 | 第39-44页 |
3.2.2.1 微生态NMDS分析 | 第39-41页 |
3.2.2.2 真菌生态结构的热谱图(Heatmap) | 第41-42页 |
3.2.2.3 真菌群落LEfSe分析 | 第42-44页 |
3.2.3 环境因子对曲胚中真菌生态多样性的影响 | 第44-47页 |
3.2.3.1 真菌菌落RDA分析 | 第44-45页 |
3.2.3.2 真菌物种相关性热图分析 | 第45-47页 |
3.3 小结 | 第47-48页 |
第四章 主要微生物变化规律分析 | 第48-63页 |
4.1 材料与方法 | 第48-49页 |
4.1.1 材料 | 第48页 |
4.1.1.1 大曲样品 | 第48页 |
4.1.1.2 主要试剂 | 第48页 |
4.1.1.3 主要仪器 | 第48页 |
4.1.2 方法 | 第48-49页 |
4.1.2.1 样品的预处理 | 第48页 |
4.1.2.2 样品总DNA提取 | 第48页 |
4.1.2.3 DNA测序 | 第48-49页 |
4.1.2.4 群落结构分析 | 第49页 |
4.2 结果与分析 | 第49-62页 |
4.2.1 主要细菌菌群结构变化 | 第49-56页 |
4.2.1.1 样本与物种共线性分析 | 第49-52页 |
4.2.1.2 优势细菌属相对丰度的变化 | 第52-56页 |
4.2.2 主要真菌菌群结构变化 | 第56-62页 |
4.2.2.1 样本与物种共线性分析 | 第56-58页 |
4.2.2.2 主要优势真菌属相对丰度的变化 | 第58-62页 |
4.3 小结 | 第62-63页 |
第五章 结论与展望 | 第63-65页 |
5.1 结论 | 第63-64页 |
5.2 展望 | 第64-65页 |
参考文献 | 第65-73页 |
致谢 | 第73-74页 |
附录 | 第74-76页 |