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基于高通量测序对酱香大曲制曲微生态多样性的研究

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
第一章 绪论第9-15页
    1.1 立题背景第9-12页
        1.1.1 概述第9页
        1.1.2 菌群微生物研究方法第9-11页
        1.1.3 酱香型高温大曲制曲微生物菌群结构第11-12页
            1.1.3.1 酱香高温大曲细菌微生物菌群结构第11页
            1.1.3.2 酱香高温大曲真菌微生物菌群结构第11-12页
    1.2 主要内容和意义第12-15页
        1.2.1 主要内容第12-13页
        1.2.2 研究意义第13-14页
        1.2.3 技术路线第14-15页
第二章 传统和机械制曲细菌群落结构分析第15-34页
    2.1 材料与方法第15-19页
        2.1.1 材料第15-16页
            2.1.1.1 样品采集第15-16页
            2.1.1.2 主要试剂第16页
            2.1.1.3 主要仪器第16页
        2.1.2 实验方法第16-19页
            2.1.2.1 样品的预处理第16-17页
            2.1.2.2 样品总DNA提取第17页
            2.1.2.3 DNA测序第17-19页
            2.1.2.4 菌群结构分析第19页
    2.2 结果与分析第19-33页
        2.2.1 制曲过程中细菌群落结构分析第19-24页
            2.2.1.1 基于OTU聚类分析第19-21页
            2.2.1.2 物种组成结构及其变化第21-24页
        2.2.2 细菌群落生态结构差异性第24-29页
            2.2.2.1 细菌生态结构NMDS分析第24-25页
            2.2.2.2 细菌菌群生态结构热谱图(Heatmap)第25-27页
            2.2.2.3 细菌群落LEfSe分析第27-29页
        2.2.3 环境因子对曲胚中细菌生态多样性的影响第29-33页
            2.2.3.1 细菌群落RDA分析第29-31页
            2.2.3.2 细菌生态结构中物种相关性热图分析第31-33页
    2.3 小结第33-34页
第三章 传统和机械制曲真菌群落结构分析第34-48页
    3.1 材料与方法第34-35页
        3.1.1 材料第34页
            3.1.1.1 大曲样品第34页
            3.1.1.2 主要试剂第34页
            3.1.1.3 主要仪器第34页
        3.1.2 方法第34-35页
            3.1.2.1 样品的预处理第34页
            3.1.2.2 样品总DNA提取第34-35页
            3.1.2.3 DNA测序第35页
            3.1.2.4 群落结构分析第35页
    3.2 结果与分析第35-47页
        3.2.1 真菌群落结构组成第35-39页
            3.2.1.1 基于OTU的聚类分析第35-37页
            3.2.1.2 真菌物种组成结构第37-39页
        3.2.2 真菌群落结构差异性第39-44页
            3.2.2.1 微生态NMDS分析第39-41页
            3.2.2.2 真菌生态结构的热谱图(Heatmap)第41-42页
            3.2.2.3 真菌群落LEfSe分析第42-44页
        3.2.3 环境因子对曲胚中真菌生态多样性的影响第44-47页
            3.2.3.1 真菌菌落RDA分析第44-45页
            3.2.3.2 真菌物种相关性热图分析第45-47页
    3.3 小结第47-48页
第四章 主要微生物变化规律分析第48-63页
    4.1 材料与方法第48-49页
        4.1.1 材料第48页
            4.1.1.1 大曲样品第48页
            4.1.1.2 主要试剂第48页
            4.1.1.3 主要仪器第48页
        4.1.2 方法第48-49页
            4.1.2.1 样品的预处理第48页
            4.1.2.2 样品总DNA提取第48页
            4.1.2.3 DNA测序第48-49页
            4.1.2.4 群落结构分析第49页
    4.2 结果与分析第49-62页
        4.2.1 主要细菌菌群结构变化第49-56页
            4.2.1.1 样本与物种共线性分析第49-52页
            4.2.1.2 优势细菌属相对丰度的变化第52-56页
        4.2.2 主要真菌菌群结构变化第56-62页
            4.2.2.1 样本与物种共线性分析第56-58页
            4.2.2.2 主要优势真菌属相对丰度的变化第58-62页
    4.3 小结第62-63页
第五章 结论与展望第63-65页
    5.1 结论第63-64页
    5.2 展望第64-65页
参考文献第65-73页
致谢第73-74页
附录第74-76页

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