| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第10-27页 |
| 1.1 课题背景 | 第10-11页 |
| 1.2 研究目的及意义 | 第11页 |
| 1.3 相关的理论和研究概况 | 第11-25页 |
| 1.3.1 传统酿酒窖泥的简介 | 第11-12页 |
| 1.3.2 窖泥功能微生物及其作用 | 第12-15页 |
| 1.3.3 浓香型白酒窖泥微生物群落的研究进展 | 第15-16页 |
| 1.3.4 窖泥微生物群落的研究方法 | 第16-18页 |
| 1.3.5 16S r RNA基因在微生物群落研究中的作用 | 第18-20页 |
| 1.3.6 二级数据库RDP Release 11及其主要功能 | 第20-22页 |
| 1.3.7 基于 16S r RNA序列的纲特异性引物的设计 | 第22-23页 |
| 1.3.8 实时定量PCR（q PCR）的应用 | 第23-25页 |
| 1.4 课题来源和研究内容 | 第25-27页 |
| 1.4.1 课题来源 | 第25页 |
| 1.4.2 研究内容 | 第25-27页 |
| 第2章 古井窖泥微生物群落结构多样性的研究 | 第27-45页 |
| 2.1 引言 | 第27页 |
| 2.2 材料和仪器 | 第27-34页 |
| 2.2.1 实验材料与仪器 | 第27-29页 |
| 2.2.2 实验方法 | 第29-34页 |
| 2.3 结果与分析 | 第34-42页 |
| 2.3.1 古井窖泥基因组检测和扩增结果 | 第34页 |
| 2.3.2 古井窖泥微生物群落多样性分析 | 第34-37页 |
| 2.3.3 古井窖泥低置信度（96%）菌株的初步分子鉴定 | 第37-38页 |
| 2.3.4 古井窖泥中基于 16S序列的物种进化关系 | 第38-40页 |
| 2.3.5 古井窖泥 16S r RNA基因SNP位点的统计 | 第40-42页 |
| 2.3.6 古井窖泥物种分类学上的统计 | 第42页 |
| 2.4 讨论 | 第42-43页 |
| 2.5 本章小结 | 第43-45页 |
| 第3章 古井窖泥纲特异性引物的设计和检测 | 第45-72页 |
| 3.1 引言 | 第45页 |
| 3.2 材料与方法 | 第45-49页 |
| 3.2.1 实验材料与仪器 | 第45-46页 |
| 3.2.2 实验方法 | 第46-49页 |
| 3.3 结果与分析 | 第49-69页 |
| 3.3.1 基于 16S r RNA基因序列的纲特异性引物设计结果 | 第49-58页 |
| 3.3.2 古井窖泥纲特异性引物的理论评估 | 第58-60页 |
| 3.3.3 重组质粒的提取与稀释 | 第60-62页 |
| 3.3.4 纲特异性引物的合成与稀释 | 第62-63页 |
| 3.3.5 纲特异性引物的初步检测 | 第63-66页 |
| 3.3.6 PCR实验条件的优化及结果 | 第66-69页 |
| 3.4 讨论 | 第69-70页 |
| 3.5 本章小结 | 第70-72页 |
| 第4章 古井窖泥纲分类层级上的定量识别 | 第72-98页 |
| 4.1 引言 | 第72页 |
| 4.2 材料与方法 | 第72-74页 |
| 4.2.1 实验材料与仪器 | 第72-73页 |
| 4.2.2 实验方法 | 第73-74页 |
| 4.3 结果与分析 | 第74-95页 |
| 4.3.1 纲特异性引物在混合模板中的q PCR检测实验 | 第74-83页 |
| 4.3.2 纲特异性引物用于古井窖泥微生物宏基因组的定量分析 | 第83-95页 |
| 4.4 讨论 | 第95-96页 |
| 4.5 本章小结 | 第96-98页 |
| 结论 | 第98-100页 |
| 参考文献 | 第100-105页 |
| 附录 | 第105-114页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第114-116页 |
| 致谢 | 第116页 |
