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植物乳杆菌WU14的GlnR调控蛋白与NiR相互作用的研究

摘要第7-8页
Abstract第8-9页
英文缩略表第10-11页
第一章 绪论第11-18页
    1.1 GlnR调控因子第11-13页
        1.1.1 GlnR调控因子简介第11页
        1.1.2 GlnR调控因子对氮源的调控作用第11-13页
    1.2 亚硝酸还原酶第13-14页
        1.2.1 亚硝酸盐的来源与危害第13页
        1.2.2 亚硝酸还原酶的分类第13-14页
    1.3 植物乳杆菌第14-16页
        1.3.1 植物乳杆菌的介绍第14-15页
        1.3.2 植物乳杆菌的应用第15-16页
        1.3.3 植物乳杆菌与亚硝酸盐的关系第16页
    1.4 课题出处、研究目的和意义第16-18页
        1.4.1 本课题出处第16页
        1.4.2 论文研究的目的和意义第16-18页
第二章 凝胶阻滞验证GlnR蛋白与NiR有相互作用第18-39页
    2.1 实验材料第18-20页
        2.1.1 菌株及质粒第18页
        2.1.2 仪器第18页
        2.1.3 主要培养基和试剂第18-20页
    2.2 实验方法第20-32页
        2.2.1 PCR扩增GlnR基因第20-21页
        2.2.2 T3-GlnR克隆载体的构建第21-23页
        2.2.3 重组表达载体pPIC9-GlnR和pET30a-GlnR的构建第23-25页
        2.2.4 .GlnR的毕赤酵母表达与纯化第25-26页
        2.2.5 SDS-PAGE分析重组载体pPIC9-GlnR的表达产物第26-27页
        2.2.6 GlnR蛋白的大肠诱导表达和纯化第27-28页
        2.2.7 .SDS-PAGE分析GlnR蛋白第28页
        2.2.8 凝胶阻滞分析GlnR蛋白与Pnir互作第28-32页
    2.3 结果与分析第32-37页
        2.3.1 PCR扩增GlnR基因第32-34页
        2.3.2 pPIC9-GlnR表达载体的构建第34-35页
        2.3.3 SDS-PAGE分析重组载体pPIC9-GlnR的表达产物第35页
        2.3.4 pET30a-GlnR表达载体的构建第35-36页
        2.3.5 GlnR蛋白的诱导表达与纯化第36页
        2.3.6 GlnR蛋白与亚硝酸还原酶NiR的相互作用第36-37页
    2.4 小结与讨论第37-39页
第三章 利用酵母双杂交和qRT-PCR研究GlnR与NiR的相互作用与调控机制第39-51页
    3.1 材料和方法第39-40页
        3.1.1 菌株和质粒第39页
        3.1.2 试剂和工具酶第39页
        3.1.3 培养基的配制第39-40页
    3.2 实验方法第40-45页
        3.2.1 GlnR和NiR基因的克隆第40-41页
        3.2.2 GlnR-pGBKT7诱饵载体和报告载体NiR-pGADT7的构建第41-42页
        3.2.3 融合载体对宿主细胞毒性及自激活的检测第42-44页
        3.2.4 亚硝酸还原酶NiR和GlnR蛋白的酵母双杂交第44页
        3.2.5 L.plantarumWU14总RNA的提取第44页
        3.2.6 荧光定量RT-PCR第44-45页
    3.3 结果与分析第45-49页
        3.3.1 亚硝酸还原酶(NiR)和GlnR基因的克隆第45页
        3.3.2 GlnR-pGBKT7诱饵载体和报告载体NiR-pGADT7的构建第45-46页
        3.3.3 菌落PCR检测重组载体pAD-NiR和pBD-GlnR第46页
        3.3.4 融合载体的自激活和毒性检测第46-47页
        3.3.5 亚硝酸还原酶(NiR)和调控蛋白GlnR相互作用分析第47-48页
        3.3.6 L.plantarumWU14RNA的提取第48-49页
        3.3.7 qRT-PCR分析GlnR与NiR基因转录调控机制第49页
    3.4 小结与讨论第49-51页
第四章 NiR的基因敲除第51-66页
    4.1 材料和方法第51页
        4.1.1 质粒第51页
        4.1.2 工具酶及器材第51页
        4.1.3 主要培养基和试剂第51页
    4.2 实验方法第51-58页
        4.2.1 L.plantarumWU14基因组的提取第51-52页
        4.2.2 基因敲除克隆载体的构建第52-55页
        4.2.3 .连接产物的转化第55页
        4.2.4 .菌落PCR检测重组载体T3/Nir5’-kan-Nir3’第55页
        4.2.5 基因敲除载体pSUP202-Nir5’-kan-Nir3’的构建第55-57页
        4.2.6 L.plantarumWU14感受态的制备及重组质粒的电转第57-58页
        4.2.7 L.plantarumWU14的第一轮菌落PCR分析第58页
        4.2.8 L.plantarumWU14的第二轮菌落PCR分析第58页
    4.3 结果和分析第58-65页
        4.3.1 L.plantarumWU14基因组的提取第58-59页
        4.3.2 亚硝酸还原酶上游同源臂Nir5’及Kan抗性基因的扩增第59页
        4.3.3 NiR上游同源臂与Kan的PCR连接(NiR5’-Kan)第59-60页
        4.3.4 NiR下游同源臂与NiR5’-Kan的PCR连接第60页
        4.3.5 基因敲除载体pSUP202-Nir5’-kan-Nir3’的构建第60-63页
        4.3.6 .菌落PCR验证重组质粒第63页
        4.3.7 植物乳杆菌基因组的提取第63-64页
        4.3.8 L.plantarumWU14的第一代菌落PCR验证第64-65页
    4.4 小结与讨论第65-66页
第五章 全文总结及展望第66-67页
参考文献第67-73页
致谢第73-74页
作者简历第74-75页
附录第75页

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