肠球菌发酵食品分离株的抗生素抗性及相关耐药基因的研究
| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 引言 | 第11-19页 |
| 1.1 肠球菌属 | 第11-12页 |
| 1.1.1 肠球菌的特征 | 第11页 |
| 1.1.2 肠球菌的分类 | 第11页 |
| 1.1.3 肠球菌的应用 | 第11-12页 |
| 1.2 抗生素 | 第12-14页 |
| 1.2.1 抗生素的作用机制 | 第12-13页 |
| 1.2.2 抗生素抗性的出现和危害 | 第13-14页 |
| 1.3 肠球菌耐药性的研究 | 第14页 |
| 1.4 全基因组关联分析 | 第14-18页 |
| 1.4.1 全基因组关联分析的概念 | 第14页 |
| 1.4.2 关联分析的应用 | 第14-15页 |
| 1.4.3 影响关联分析的因素 | 第15-16页 |
| 1.4.4 关联分析常用软件 | 第16-17页 |
| 1.4.5 Pheno Link软件 | 第17页 |
| 1.4.6 Scoary软件 | 第17-18页 |
| 1.5 立题意义及研究内容 | 第18-19页 |
| 1.5.1 立题意义 | 第18页 |
| 1.5.2 研究内容 | 第18-19页 |
| 2 材料与方法 | 第19-28页 |
| 2.1 试验材料 | 第19-23页 |
| 2.1.1 菌株来源 | 第19-22页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第22页 |
| 2.1.3 主要仪器与设备 | 第22-23页 |
| 2.2 试验方法 | 第23-28页 |
| 2.2.1 菌株活化及培养 | 第23页 |
| 2.2.2 抗生素及其浓度范围 | 第23-24页 |
| 2.2.3 抗生素溶解及稀释 | 第24-25页 |
| 2.2.4 最低抑菌浓度的测定 | 第25-27页 |
| 2.2.5 耐药表型与全基因组关联 | 第27页 |
| 2.2.6 功能注释 | 第27-28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-45页 |
| 3.1 试验菌株的耐药性结果 | 第28-37页 |
| 3.1.1 屎肠球菌的耐药性结果 | 第28-32页 |
| 3.1.2 粪肠球菌的耐药性结果 | 第32页 |
| 3.1.3 肠球菌对不同抗生素耐药性分析 | 第32-37页 |
| 3.2 Pheno Link关联结果 | 第37-39页 |
| 3.3 Scoary关联结果 | 第39-40页 |
| 3.4 关联结果综合分析 | 第40-44页 |
| 3.3.1 基因Sec G的缺失与菌株的耐药性 | 第42-44页 |
| 3.3.2 基因EF-G与四环素的耐药性 | 第44页 |
| 3.5 表型-基因型的不一致性可能的原因 | 第44-45页 |
| 4 结论 | 第45-46页 |
| 致谢 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-54页 |
| 作者简介 | 第54页 |
