| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 1 引言 | 第7-15页 |
| 1.1 乳酸菌 | 第7页 |
| 1.2 植物乳杆菌 | 第7-8页 |
| 1.3 细菌分型方法及其在乳酸菌分型鉴定中的应用 | 第8-13页 |
| 1.3.1 表型分型方法 | 第8-10页 |
| 1.3.2 基于16S rRNA基因序列的分型方法 | 第10页 |
| 1.3.3 脉冲场凝胶电泳 | 第10-11页 |
| 1.3.4 随机扩增多态性片段 | 第11页 |
| 1.3.5 多位点序列分型研究及应用 | 第11-13页 |
| 1.4 植物乳杆菌的分型和遗传进化研究 | 第13-14页 |
| 1.5 立题意义与研究内容 | 第14-15页 |
| 2 材料与方法 | 第15-20页 |
| 2.1 试验材料 | 第15-16页 |
| 2.1.1 菌株来源 | 第15页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第15页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第15-16页 |
| 2.2 试验方法 | 第16-20页 |
| 2.2.1 菌株的活化与培养 | 第16页 |
| 2.2.2 试验菌株DNA提取 | 第16页 |
| 2.2.3 看家基因的PCR扩增 | 第16-17页 |
| 2.2.4 看家基因的引物设计 | 第17页 |
| 2.2.5 看家基因的扩增 | 第17-18页 |
| 2.2.6 扩增产物检测 | 第18页 |
| 2.2.7 植物乳杆菌分离株MLST数据分析 | 第18-20页 |
| 3 结果分析与讨论 | 第20-39页 |
| 3.1 菌株DNA提取结果 | 第20页 |
| 3.2 看家基因扩增结果 | 第20-21页 |
| 3.3 生物信息学分析结果 | 第21-39页 |
| 3.3.1 等位基因多样性分析 | 第21-22页 |
| 3.3.2 MLST分型结果 | 第22-31页 |
| 3.3.3 等位基因序列重组分析 | 第31-33页 |
| 3.3.4 植物乳杆菌株种群结构分析 | 第33-34页 |
| 3.3.5 eBURST分析结果 | 第34-36页 |
| 3.3.6 不同序列型最小生成树分析 | 第36-39页 |
| 4 结论 | 第39-40页 |
| 致谢 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-47页 |
| 作者简介 | 第47页 |