| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-15页 |
| ·根霉微生物及其工业应用 | 第8-10页 |
| ·根霉微生物及应用概况 | 第8页 |
| ·根霉及其应用研究中的问题 | 第8-10页 |
| ·真菌基因组研究现状 | 第10-12页 |
| ·华根霉的研究背景与基础 | 第12-13页 |
| ·本课题的意义与主要研究内容 | 第13-15页 |
| ·本课题的研究意义 | 第13页 |
| ·主要研究内容 | 第13-15页 |
| 第二章 材料与方法 | 第15-20页 |
| ·材料 | 第15-16页 |
| ·菌种 | 第15页 |
| ·试剂 | 第15页 |
| ·主要仪器 | 第15页 |
| ·培养基 | 第15-16页 |
| ·方法 | 第16-20页 |
| ·华根霉菌体培养与收集 | 第16页 |
| ·华根霉基因组提取 | 第16页 |
| ·华根霉基因组测序与拼接 | 第16-17页 |
| ·华根霉基因预测与基因组注释 | 第17页 |
| ·系统发育进化树分析 | 第17页 |
| ·基因家族分析 | 第17页 |
| ·同源基因分析与基因组比较 | 第17页 |
| ·蛋白功能分类 | 第17-18页 |
| ·糖酶 CAZy 分析 | 第18页 |
| ·代谢途径分析 | 第18页 |
| ·蛋白质疏水性分析 | 第18页 |
| ·蛋白质同源建模 | 第18页 |
| ·华根霉基因组数据验证 | 第18-20页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第20-42页 |
| ·华根霉基因组数据基本信息与初步分析 | 第20-26页 |
| ·华根霉基因组拼接结果与基本信息 | 第20-22页 |
| ·系统发育进化树分析 | 第22-23页 |
| ·基因功能 COGs 分类 | 第23-24页 |
| ·华根霉 KEGG 代谢途径注释分析 | 第24-25页 |
| ·华根霉糖酶的 CAZy 分析 | 第25-26页 |
| ·基于基因组信息的根霉脂肪酶比较分析 | 第26-37页 |
| ·华根霉脂肪酶 RCL 与米根霉脂肪酶 ROL 序列比较分析 | 第26-33页 |
| ·华根霉脂肪酶 RCL 与米根霉脂肪酶 ROL 所在基因簇对比分析 | 第33-37页 |
| ·华根霉真菌毒素相关的安全性分析 | 第37-42页 |
| ·聚酮代谢与非核糖体多肽类真菌毒素合成途径及基因分析 | 第38-39页 |
| ·萜类化合物代谢合成真菌毒素的途径分析 | 第39-40页 |
| ·其他次级代谢分析 | 第40-42页 |
| 主要结论与展望 | 第42-43页 |
| 主要结论 | 第42页 |
| 展望 | 第42-43页 |
| 致谢 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-49页 |
| 附录：作者在攻读硕士学位期间发表的论文 | 第49页 |
