| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第12-22页 |
| 1.1 金黄色葡萄球菌概述 | 第12-15页 |
| 1.1.1 金葡菌的生物学特性 | 第12页 |
| 1.1.2 金葡菌的生物被膜 | 第12-13页 |
| 1.1.3 金葡菌生物被膜相关基因的调控 | 第13-15页 |
| 1.2 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 | 第15页 |
| 1.3 SCCmec基因组岛概述 | 第15-18页 |
| 1.4 金葡菌基因组的流行与变迁 | 第18-20页 |
| 1.4.1 随机扩增多态性DNA技术 | 第19页 |
| 1.4.2 多位点序列分型 | 第19-20页 |
| 1.4.3 表面蛋白A基因多态性分型 | 第20页 |
| 1.5 本课题的研究背景、意义和内容 | 第20-22页 |
| 1.5.1 本课题的研究背景和意义 | 第20页 |
| 1.5.2 主要研究内容 | 第20-22页 |
| 第二章 生物被膜基因型的分型 | 第22-38页 |
| 2.1 前言 | 第22页 |
| 2.2 实验材料与设备 | 第22-24页 |
| 2.2.1 实验菌株 | 第22页 |
| 2.2.2 实验试剂及材料 | 第22-23页 |
| 2.2.3 实验仪器与设备 | 第23-24页 |
| 2.2.4 培养基和常用溶液的配制 | 第24页 |
| 2.3 实验过程方法 | 第24-28页 |
| 2.3.1 全基因组DNA提取 | 第24-26页 |
| 2.3.2 PCR引物的设计与合成 | 第26页 |
| 2.3.3 葡萄球菌生物被膜相关基因型分析 | 第26-28页 |
| 2.4 实验结果与讨论 | 第28-36页 |
| 2.4.1 生物被膜初始黏附阶段附着基因atl的研究与分析 | 第28-29页 |
| 2.4.2 生物被膜成熟阶段胞内ica操纵子的研究与分析 | 第29-32页 |
| 2.4.3 生物被膜成熟阶段聚集效应基因aap的研究与分析 | 第32-33页 |
| 2.4.4 生物被膜成熟与分化调控基因agr的研究与分析 | 第33-34页 |
| 2.4.5 生物被膜基因型相互作用分析 | 第34-36页 |
| 2.5 本章小结 | 第36-38页 |
| 第三章 基因组岛SCCmec与生物被膜基因型的相关性 | 第38-59页 |
| 3.1 前言 | 第38页 |
| 3.2 实验材料与设备 | 第38-40页 |
| 3.2.1 实验菌种 | 第38页 |
| 3.2.2 试剂 | 第38-39页 |
| 3.2.3 实验仪器与设备 | 第39-40页 |
| 3.2.4 培养基和常用溶液的配制 | 第40页 |
| 3.3 实验过程与方法 | 第40-45页 |
| 3.3.1 多重PCR方法检测金葡菌种属特性检测 | 第40-42页 |
| 3.3.2 SCCmec关键边界因子orf- X的检测 | 第42-43页 |
| 3.3.3 ccr复合物分型 | 第43页 |
| 3.3.4 mec复合物分型 | 第43-45页 |
| 3.3.5 SCCmec的生物信息学分析 | 第45页 |
| 3.4 实验结果与讨论 | 第45-58页 |
| 3.4.1 SCCmec基因组岛分型与生物信息学分析 | 第45-52页 |
| 3.4.2 生物被膜基因型与SCCmec相关性的研究与分析 | 第52-58页 |
| 3.5 本章小结 | 第58-59页 |
| 第四章 金葡菌基因组背景解析 | 第59-80页 |
| 4.1 前言 | 第59页 |
| 4.2 实验材料与设备 | 第59-60页 |
| 4.2.1 实验菌株 | 第59页 |
| 4.2.2 实验试剂 | 第59-60页 |
| 4.2.3 实验设备 | 第60页 |
| 4.2.4 培养基和常用溶液的配制 | 第60页 |
| 4.3 实验过程与方法 | 第60-66页 |
| 4.3.1 全基因组DNA提取 | 第60页 |
| 4.3.2 葡萄球菌指纹图谱及基因相似性分析 | 第60-62页 |
| 4.3.3 金葡菌的多位点序列分型 | 第62-65页 |
| 4.3.4 金葡菌表面蛋白A分型 | 第65-66页 |
| 4.4 实验结果与讨论 | 第66-78页 |
| 4.4.1 葡萄球菌指纹图谱和基因相似性分析 | 第66-70页 |
| 4.4.2 金葡菌克隆株与生物被膜相关性研究 | 第70-76页 |
| 4.4.3 金葡菌进化过程对生物被膜基因型的影响 | 第76-78页 |
| 4.5 本章小结 | 第78-80页 |
| 结论与展望 | 第80-82页 |
| 一、结论 | 第80-81页 |
| 二、本课题主要创新点 | 第81页 |
| 三、展望 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-94页 |
| 附录 | 第94-104页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第104-105页 |
| 致谢 | 第105-107页 |
| 附件 | 第107页 |
