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多基因转化构建重组工业酿酒酵母及其在木薯酒精发酵中的应用研究

摘要第1-6页
Abstract第6-12页
第一章 文献综述第12-30页
   ·燃料乙醇概述第12-14页
     ·燃料乙醇是优良的可再生能源第12-13页
     ·木薯是重要的非粮生物燃料乙醇原料第13-14页
   ·酿酒酵母表达系统第14-20页
     ·酿酒酵母遗传工程第14-15页
       ·拓展酵母的底物利用范围第14-15页
       ·增加酵母对营养物质的利用第15页
       ·基因敲除第15页
       ·存在问题第15页
     ·表达载体第15-16页
       ·整合型载体(yeast intergration plasmid,YIp)第15-16页
       ·附加型载体(yeast episomal plasmid,YEp)第16页
       ·酿酒酵母表达载体展望第16页
     ·启动子第16-17页
     ·信号肽第17页
     ·筛选标记第17-18页
     ·转化方法第18-19页
     ·多拷贝策略——rDNA整合第19-20页
   ·多基因转化策略改善生物遗传性状第20-21页
     ·多个表达载体多次转化法第20页
     ·多个表达载体共转化法第20页
     ·多基因单表达载体一次转化法第20-21页
   ·酒精发酵原理与工艺第21-25页
     ·原理第21页
     ·淀粉质基质酒精发酵工艺第21-25页
       ·蒸煮糊化第22-23页
       ·液化与糖化第23-24页
       ·酒精发酵第24页
       ·同步糖化发酵与先糖化后发酵第24-25页
   ·纤维素酶第25-27页
     ·内切葡聚糖酶Ⅲ第26-27页
     ·外切葡聚糖苷酶第27页
     ·β-葡萄糖苷酶Ⅰ第27页
   ·葡萄糖淀粉酶Ⅰ第27-28页
   ·木薯乙醇发酵中亟待解决的关键问题第28页
   ·本论文的研究内容第28-30页
第二章 材料与方法第30-56页
   ·实验材料第30-36页
     ·菌株和质粒第30-31页
     ·引物第31-34页
     ·仪器与设备第34页
     ·试剂与工具酶第34-35页
     ·培养基第35-36页
   ·实验方法第36-56页
     ·技术路线第36-37页
     ·常规试剂配置第37页
     ·真菌总RNA提取第37-38页
     ·酵母基因组DNA提取第38-39页
     ·基因克隆及重组质粒PCR鉴定第39-42页
       ·PCR体系第39-40页
       ·PCR扩增条件第40-42页
     ·连接第42-43页
     ·大肠杆菌转化方法第43页
     ·E.coli质粒提取第43-44页
     ·酵母感受态制备第44-45页
     ·酵母电转化第45页
     ·酵母转化子铜抗性筛选方法的建立第45页
     ·酵母转化子PCR鉴定第45-46页
     ·酵母转化子分泌表达酶的定性鉴定第46页
     ·酶活测定第46-47页
     ·SDS-PAGE凝胶电泳第47-48页
       ·酶蛋白制备——三氯醋酸沉淀法第47页
       ·重组蛋白SDS-PAGE电泳鉴定第47-48页
     ·葡萄糖淀粉酶基因ga1的RT-PCR第48页
     ·葡萄糖淀粉酶基因ga1点突变第48-49页
     ·DNA琼脂糖凝胶电泳及其DNA片段回收第49页
     ·pYES2M Sph Ⅰ位点去除第49-51页
     ·重组质粒的酶切鉴定第51-54页
     ·酒精发酵第54-55页
     ·成分测定第55-56页
第三章 整合型表达载体pYES2M的构建第56-70页
   ·信号肽a-MF基因克隆第56-58页
   ·启动子Ppgk基因克隆第58-60页
   ·rDNA基因克隆第60-61页
   ·CUP1基因克隆第61-63页
   ·整合型表达载体pYES2M的构建第63-69页
     ·启动子Ppgk与pYES2连接第63页
     ·信号肽α-MF与pYES2-Ppgk连接第63-65页
     ·rDNA与pYES2-PMF连接第65-67页
     ·抗铜蛋白基因CUP1与pYES2-PMF-rDNA连接第67-68页
     ·点突变去除pYES2M多克隆位点Sph Ⅰ位点第68-69页
   ·本章小结第69-70页
第四章 酿酒酵母转化子筛选方法的建立第70-76页
   ·酿酒酵母转化子筛选方法的建立——铜抗性标记法第70-71页
   ·酿酒酵母快速菌落PCR鉴定方法的建立第71-75页
     ·不同破壁方法处理后酵母菌落PCR结果第71-72页
     ·微珠涡旋法破壁效果的验证第72-73页
     ·SDS法的验证与SDS-微珠法菌落PCR结果第73-74页
     ·菌落PCR体系中破壁产物体积的确定第74-75页
   ·本章小结第75-76页
第五章 葡萄糖淀粉酶、葡聚糖内切酶和β-葡萄糖苷酶基因的克隆第76-86页
   ·泡盛曲霉葡萄糖淀粉酶基因ga1的克隆第76-79页
     ·ga1的克隆第76-78页
     ·ga1点突变第78-79页
   ·里氏木霉葡聚糖内切酶基因eg3的克隆第79-82页
     ·eg3的克隆第79-81页
     ·eg3内含子的去除第81-82页
   ·绿色木霉β-葡萄糖苷酶基因bgI1的克隆第82-84页
     ·bgI1基因克隆第82-83页
     ·bgI1内含子去除第83-84页
   ·本章小结第84-86页
第六章 多基因整合型表达载体的构建及其在工业酿酒酵母中的共表达第86-110页
   ·单价载体pYES2M-ga1的构建、对酿酒酵母的转化和鉴定第86-89页
     ·表达载体pYES2M-ga1的构建第86-87页
     ·重组载体pYES2M-ga1对酿酒酵母的转化及转化子PCR鉴定与功能鉴定第87-89页
   ·单价载体pYES2M-ga1的构建、对酿酒酵母的转化和鉴定第89-91页
     ·表达载体pYES2M-eg3的构建第89-90页
     ·pYES2M-eg3转化酿酒酵母及转化子鉴定第90-91页
   ·单价载体pYES2M-bgI1的构建、对酿酒酵母的转化和鉴定第91-94页
     ·表达载体pYES2M-bgI1的构建第91-93页
     ·pYES2M-bgI1对酿酒酵母的转化和鉴定第93-94页
   ·双价载体pYES2M-eg3-ga1的构建、对酿酒酵母的转化和鉴定第94-99页
     ·表达载体pYES2M-eg3-ga1的构建第94-99页
     ·pYES2M-eg3-ga1对酿酒酵母的转化和鉴定第99页
   ·双价载体pYES2M-eg3-bgI1的构建、对酿酒酵母的转化和鉴定第99-103页
     ·扩增PMFbgI1片段第99-101页
     ·表达载体pYES2M-eg3-bgI1的构建第101-102页
     ·pYES2M-eg3-bgI1对酿酒酵母的转化和鉴定第102-103页
   ·三价载体pYES2M-eg3-ga1-bgI1的构建、对酿酒酵母的转化和鉴定第103-107页
     ·表达载体pYES2M-eg3-ga1-bgI1的构建第103-107页
     ·pYES2M-eg3-ga1-bgI1转化酿酒酵母与转化子的鉴定第107页
   ·pYES2M转化NY-K及转化子鉴定第107-108页
   ·本章小结第108-110页
第七章 重组工业酿酒酵母对纯底物和粗木薯粉的酒精发酵第110-120页
   ·重组酶SDS-PAGE凝胶电泳第110-111页
   ·重组葡萄糖淀粉酶的酶学特征第111-112页
     ·重组葡萄糖淀粉酶(GAI)酶活测定第111页
     ·GAⅠ最适温度、pH测定第111-112页
     ·GAⅠ最适温度和pH验证第112页
   ·重组葡聚糖内切酶的酶学特征第112-113页
     ·重组葡葡聚糖内切酶(EGⅢ)酶活测定第112页
     ·EGⅢ最适温度、pH测定第112-113页
     ·EGⅢ最适温度和pH验证第113页
   ·重组β-葡萄糖苷酶的酶学特征第113-115页
     ·重组β-葡萄糖苷酶(BGLⅠ)酶活测定第113-114页
     ·BGLⅠ最适温度、pH测定第114页
     ·BGLⅠ最适温度和pH验证第114-115页
   ·重组酿酒酵母对纯底物的酒精发酵第115-116页
     ·重组酿酒酵母对可溶性淀粉的酒精发酵第115页
     ·重组酿酒酵母对羧甲基纤维素的酒精发酵第115-116页
     ·重组酿酒酵母对纤维二糖的酒精发酵第116页
   ·重组酿酒酵母对粗木薯粉的酒精发酵第116-119页
     ·不添加酶制剂时重组酿酒酵母对粗木薯粉的酒精发酵第116-117页
     ·添加酶制剂时重组酿酒酵母对粗木薯粉的酒精发酵第117-118页
     ·重组酿酒酵母NY-K/pYES2M-eg3-ga1-bI1对木薯粉的酒精发酵——SSF和SHF第118-119页
   ·本章小结第119-120页
第八章 结论与展望第120-124页
 主要研究结论第120-121页
 论文创新点第121-122页
 展望第122-124页
参考文献第124-132页
论文发表第132-133页
附录1 整合型载体pYES2M构建示意图第133-137页
附录2 单价载体构建示意图第137-140页
附录3 双价载体pYES2M-eg3-ga1建示意图第140-143页
附录4 双价载体pYES2M-eg3-bgI1构建示意图第143-144页
附录5 三价载体pYES2M-eg3-ga1-bgI1构建示意图第144-145页
附录6 Ppgk在GenBank登陆号(FJ415226)与内容第145-147页
附录7 Ppgk测序结果第147页
附录8 α-MF测序结果第147页
附录9 rDNA测序结果第147-148页
附录10 CUP1测序结果第148-149页
附录11 ga1测序结果第149-150页
附录12 eg3测序结果第150页
附录13 bgI1测序结果第150-152页
附录14 英文缩写(Abbreviation)第152-153页
致谢第153页

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