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应用焦磷酸测序技术对新疆地区传统发酵乳制品中微生物多样性的研究

摘要第3-4页
Abstract第4页
1 引言第10-15页
    1.1 新疆地区的传统发酵乳制品及种类第10页
    1.2 传统发酵乳制品主要菌群构成第10-11页
        1.2.1 乳酸菌第10-11页
        1.2.2 酵母菌第11页
    1.3 发酵乳制品微生物多样性研究方法第11-13页
        1.3.1 传统纯培养方法第11-12页
        1.3.2 非培养的研究方法第12-13页
    1.4 立题意义及研究内容第13-15页
        1.4.1 立题意义第13页
        1.4.2 研究内容第13-15页
2 材料与方法第15-21页
    2.1 试验材料第15-16页
        2.1.1 样品来源第15-16页
        2.1.2 主要试验试剂及药品第16页
        2.1.3 仪器与设备第16页
    2.2 试验方法第16-21页
        2.2.1 样品采集第16-17页
        2.2.2 基因组DNA的提取第17页
        2.2.3 基因组DNA纯度检测第17页
        2.2.4 细菌16S rRNA基因V3区及真菌18S rRNA基因ITS区的PCR扩增第17-19页
        2.2.5 PCR扩增产物定量及焦磷酸测序第19页
        2.2.6 高质量序列的提取第19页
        2.2.7 高质量序列的生物信息学处理第19页
        2.2.8 数据统计分析及图表绘制第19-20页
        2.2.9 核酸登录号第20-21页
3 结果与分析第21-34页
    3.1 样品基因组DNA提取结果第21页
    3.2 样品PCR扩增结果第21-22页
    3.3 酸牛奶样品中细菌菌群群落结构分析第22-29页
        3.3.1 细菌序列丰度和多样性分析第22-25页
        3.3.2 基于多元统计方法的酸牛奶样品细菌群落结构比较分析第25-27页
        3.3.3 样品中细菌相对含量和构成分析第27-29页
    3.4 酸牛奶样品中真菌菌群群落结构分析第29-34页
        3.4.1 真菌序列丰度和多样性分析第29-31页
        3.4.2 基于多元统计方法的酸牛奶样品真菌群落结构比较分析第31-32页
        3.4.3 样品中真菌相对含量和构成分析第32-34页
4 讨论第34-37页
    4.1 传统纯培养、PCR-DGGE、焦磷酸测序方法的比较第34-35页
    4.2 微生物多样性及丰度比较第35页
    4.3 微生物群落结构比较第35-37页
5 结论第37-38页
致谢第38-39页
参考文献第39-43页
附表第43-45页
作者简介第45页

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