摘要 | 第4-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
第1章绪论 | 第10-25页 |
1.1 蛋白质数据库介绍 | 第11-15页 |
1.1.1 蛋白质一级数据库 | 第11-13页 |
1.1.2 蛋白质二级数据库 | 第13页 |
1.1.3 蛋白质三维结构数据库 | 第13-15页 |
1.1.4 其他相关数据库 | 第15页 |
1.2 蛋白质序列比对 | 第15-19页 |
1.2.1 序列两两比对 | 第16-17页 |
1.2.2 多序列比对 | 第17-18页 |
1.2.3 多序列比对的定义 | 第18-19页 |
1.3 蛋白质的结构预测 | 第19-22页 |
1.3.1 基于氨基酸残基特性的蛋白质功能性质分析 | 第19页 |
1.3.2 基于氨基酸残基特性的蛋白质物质性质预测 | 第19-20页 |
1.3.3 基于氨基酸残基特性的蛋白质二级结构预测 | 第20页 |
1.3.4 基于氨基酸残基特性的蛋白质特殊局部结构预测 | 第20页 |
1.3.5 基于氨基酸序列的同源性的蛋白质三维结构预测 | 第20-21页 |
1.3.6 蛋白质的结构预测的发展 | 第21-22页 |
1.4 课题研究依据及意义 | 第22-23页 |
1.5 课题研究内容与创新点 | 第23-25页 |
1.5.1 主要研究内容 | 第23页 |
1.5.2 创新点 | 第23-25页 |
第2章 咖啡豆α-半乳糖苷酶的一级、二级结构预测 | 第25-31页 |
2.1 试验材料 | 第25页 |
2.1.1 材料 | 第25页 |
2.2 试验方法 | 第25-26页 |
2.2.1 咖啡豆α-半乳糖苷酶的一级结构预测 | 第25-26页 |
2.2.2 咖啡豆α-半乳糖苷酶二级结构预测 | 第26页 |
2.3 结果与分析 | 第26-30页 |
2.3.1 咖啡豆α-半乳糖苷酶一级结构分析 | 第26-30页 |
2.3.2 咖啡豆α-半乳糖苷酶二级结构预测 | 第30页 |
2.4 本章小结 | 第30-31页 |
第3章 咖啡豆α-半乳糖苷酶的三级结构预测及评估 | 第31-38页 |
3.1 试验材料 | 第31页 |
3.1.1 软件与设备 | 第31页 |
3.2 试验方法 | 第31-32页 |
3.2.1 咖啡豆α-半乳糖苷酶三级结构预测方法 | 第31页 |
3.2.2 咖啡豆α-半乳糖苷酶三级结构评估方法 | 第31-32页 |
3.3 结果与分析 | 第32-37页 |
3.3.1 选择模版 | 第32页 |
3.3.2 同源建模 | 第32-35页 |
3.3.3 咖啡豆α-半乳糖苷酶三级结构评估 | 第35-37页 |
3.4 本章小结 | 第37-38页 |
第4章 环糊精与咖啡豆α-半乳糖苷酶的分子对接研究 | 第38-50页 |
4.1 试验材料 | 第39页 |
4.1.1 软件与设备 | 第39页 |
4.2 试验方法 | 第39-41页 |
4.2.1 受体蛋白准备 | 第39页 |
4.2.2 活性位点的定位 | 第39页 |
4.2.3 小分子准备 | 第39-41页 |
4.2.4 分子对接 | 第41页 |
4.3 结果与分析 | 第41-49页 |
4.3.1 环糊精与咖啡豆α-半乳糖苷酶的对接结果 | 第41-48页 |
4.3.2 环糊精与咖啡豆α-半乳糖苷酶的对接结果汇总 | 第48-49页 |
4.3.3 环糊精与咖啡豆α-半乳糖苷酶的对接结果打分 | 第49页 |
4.4 本章小结 | 第49-50页 |
第5章 结论与展望 | 第50-53页 |
5.1 结论 | 第50-51页 |
5.2 展望 | 第51-53页 |
参考文献 | 第53-56页 |
致谢 | 第56-57页 |
攻读学位期间的研究成果 | 第57页 |