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冰川微生物Rahnella sp.R3产低温β-半乳糖苷酶的结构及性质研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
中英文缩写词对照表第8-13页
第一章 绪论第13-24页
    1.1 低温微生物和低温酶第13页
        1.1.1 低温微生物的分布第13页
        1.1.2 低温微生物与低温酶第13页
    1.2 低温 β-半乳糖苷酶第13-17页
        1.2.1 β-半乳糖苷酶第13-14页
        1.2.2 β-半乳糖苷酶的研究现状第14-15页
        1.2.3 低温 β-半乳糖苷酶的微生物来源及外源表达第15-16页
        1.2.4 低温 β-半乳糖苷酶固定化第16-17页
    1.3 蛋白质的结构研究第17-20页
        1.3.1 蛋白质结晶原理及技术第17-18页
        1.3.2 蛋白质晶体衍射第18页
        1.3.3 蛋白质晶体结构的解析第18-19页
        1.3.4 低温酶的晶体结构第19-20页
    1.4 β-半乳糖苷酶结构特点第20-22页
        1.4.1 结构特点第20页
        1.4.2 催化结构域第20-21页
        1.4.3 热稳定性第21-22页
    1.5 立题依据与研究意义第22-23页
    1.6 主要研究内容第23-24页
第二章 Rahnella sp. R3低温 β-半乳糖苷酶基因的克隆表达第24-48页
    2.1 前言第24页
    2.2 材料与设备第24-27页
        2.2.1 菌株及质粒第24-25页
        2.2.2 主要试剂第25页
        2.2.3 主要仪器和设备第25-26页
        2.2.4 培养基第26-27页
        2.2.5 主要溶液第27页
        2.2.6 数据库与软件第27页
    2.3 实验方法第27-37页
        2.3.1 Rahnella sp. R3基因组DNA的分离第27页
        2.3.2 R3-bgal基因片段的扩增第27-30页
        2.3.3 基因全长的扩增第30-31页
        2.3.4 表达载体构建和转化第31-35页
        2.3.5 诱导条件优化第35-36页
        2.3.6 β-半乳糖苷酶活力的测定第36-37页
    2.4 结果与讨论第37-47页
        2.4.1 氨基酸序列比对与引物设计第37页
        2.4.2 R3-bgal基因片段扩增第37-38页
        2.4.3 R3-bgal的全长扩增第38页
        2.4.4 R3-bgal序列生物信息学分析第38-41页
        2.4.5 表达载体的构建第41-43页
        2.4.6 转化、阳性克隆的筛选及鉴定第43页
        2.4.7 重组蛋白质的诱导表达第43-47页
    2.5 本章小结第47-48页
第三章 重组低温 β-半乳糖苷酶的分离纯化及酶学性质研究第48-61页
    3.1 前言第48页
    3.2 材料与设备第48-49页
        3.2.1 菌株第48页
        3.2.2 主要试剂第48-49页
        3.2.3 主要仪器和设备第49页
    3.3 实验方法第49-51页
        3.3.1 重组低温 β-半乳糖苷酶的分离纯化第49-50页
        3.3.2 SDS-PAGE电泳鉴定第50页
        3.3.3 β-半乳糖苷酶活力的测定第50页
        3.3.4 R3-bgal 酶学性质分析第50-51页
    3.4 结果与讨论第51-60页
        3.4.1 重组酶的分离纯化第51-53页
        3.4.2 R3-bgal相对分子量的测定第53页
        3.4.3 R3-bgal的最适作用温度和最适作用pH第53-55页
        3.4.4 R3-bgal的热稳定性第55页
        3.4.5 金属离子对R3-bgal的活性及二级结构的影响第55-57页
        3.4.6 温度和pH对R3-bgal二级结构的影响第57-58页
        3.4.7 R3-bgal米氏动力学第58-59页
        3.4.8 R3-bgal反应抑制动力学第59-60页
    3.5 本章小结第60-61页
第四章 Rahnella sp. R3低温 β-半乳糖苷酶的结晶及晶体结构解析第61-74页
    4.1 前言第61页
    4.2 材料与设备第61-62页
        4.2.1 菌株及质粒第61-62页
        4.2.2 主要试剂第62页
        4.2.3 主要仪器和设备第62页
        4.2.4 软件和在线分析网站第62页
    4.3 实验方法第62-66页
        4.3.1 蛋白质分离纯化第62-63页
        4.3.2 晶体生长条件初筛第63页
        4.3.3 晶体生长条件优化第63页
        4.3.4 X射线晶体衍射数据收集与处理第63-64页
        4.3.5 晶体结构解析第64-65页
        4.3.6 定点突变第65-66页
        4.3.7 突变酶的表达、分离和纯化第66页
        4.3.8 突变酶的二级结构第66页
    4.4 结果与讨论第66-73页
        4.4.1 蛋白质的分离纯化第66-67页
        4.4.2 R3-bgal结晶条件筛选及优化第67-68页
        4.4.3 R3-bgal结晶数据收集与处理第68-69页
        4.4.4 R3-bgal晶体模型构建和精修第69-70页
        4.4.5 R3-bgal三维结构第70-71页
        4.4.6 催化位点验证第71-73页
    4.5 本章小结第73-74页
第五章 R3-bgal结构域分析及耐冷机制第74-85页
    5.1 前言第74页
    5.2 材料与设备第74-75页
        5.2.1 菌株及质粒第74页
        5.2.2 主要试剂第74页
        5.2.3 主要仪器和设备第74页
        5.2.4 软件和在线分析网站第74-75页
    5.3 实验方法第75-76页
        5.3.1 引物设计第75页
        5.3.2 PCR反应体系和程序第75页
        5.3.3 目的片段与表达载体的连接第75-76页
        5.3.4 重组质粒的转化和表达第76页
    5.4 结果与讨论第76-83页
        5.4.1 R3-bgal结构域及结构域功能第76-80页
        5.4.2 R3-bgal活性中心与功能第80-81页
        5.4.3 R3-bgal耐冷机制分析第81-83页
    5.5 本章小结第83-85页
第六章 R3-bgal的微胶囊固定化第85-98页
    6.1 前言第85页
    6.2 材料与设备第85-86页
        6.2.1 主要试剂第85-86页
        6.2.2 主要仪器和设备第86页
    6.3 实验方法第86-88页
        6.3.1 R3-bgal的纯化及活性测定第86页
        6.3.2 结冷胶水凝胶的制备第86页
        6.3.3 温度、pH,金属离子的影响第86页
        6.3.4 固定化R3-bgal的反应动力学第86-87页
        6.3.5 结冷胶水凝胶的性质第87页
        6.3.6 结冷胶水凝胶表面和截面性质第87页
        6.3.7 固定化R3-bgal生产低乳糖牛乳第87-88页
        6.3.8 电子鼻分析第88页
    6.4 结果与讨论第88-96页
        6.4.1 水凝胶珠的制备第88-89页
        6.4.2 pH、温度和金属离子对酶活性的影响第89-91页
        6.4.3 固定化酶的动力学参数第91页
        6.4.4 酶的包埋率和泄漏率第91-92页
        6.4.5 固定化酶的重复使用稳定性第92-93页
        6.4.6 凝胶珠的形态结构第93-94页
        6.4.7 固定化R3-bgal生产低乳糖牛乳第94-95页
        6.4.8 电子鼻对不同样品的分析第95-96页
    6.5 本章小结第96-98页
论文主要结论与展望第98-101页
    主要结论第98-99页
    展望第99-101页
论文创新点第101-102页
致谢第102-103页
参考文献第103-114页
附录一:作者在攻读博士学位期间发表的论文第114-115页
附录二:PDB报告第115-119页
附录三:氨基酸序列比对第119-121页

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