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马奶酒样乳杆菌ZW3基因WANG1108与WANG0840特性及功能的初步研究

摘要第4-5页
ABSTRACT第5页
1 前言第9-21页
    1.1 乳酸菌与其胞外多糖第9-16页
        1.1.1 乳酸菌胞外多糖的生物活性第9-11页
        1.1.2 胞外多糖在食品工业中的应用第11-12页
        1.1.3 乳酸菌胞外多糖的生物合成第12-14页
        1.1.4 乳酸菌胞外多糖生物合成的基因调控研究第14-16页
    1.2 马奶酒样乳杆菌与其胞外多糖研究概况第16-18页
        1.2.1 马奶酒样乳杆菌的起源及生物学特性第16-17页
        1.2.2 马奶酒样乳杆菌胞外多糖第17页
        1.2.3 马奶酒样乳杆菌ZW3第17-18页
    1.3 第二代高通量测序第18页
    1.4 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(STPK)与UDP-N-乙酰胞壁酸-L-丙氨酸:D-谷氨酸连接酶(MurD)第18页
    1.5 本论文研究的意义及主要内容第18-21页
        1.5.1 本论文研究的意义第19页
        1.5.2 本论文主要研究内容第19-21页
2 材料与方法第21-38页
    2.1 实验材料第21-27页
        2.1.1 实验用菌种及质粒第21页
        2.1.2 工具酶及DNA、蛋白质Marker第21-22页
        2.1.3 抗生素第22页
        2.1.4 实验用引物第22-23页
        2.1.5 试剂第23-24页
        2.1.6 主要仪器及设备第24-25页
        2.1.7 培养基第25-26页
        2.1.8 标准溶液的配制第26-27页
    2.2 实验方法第27-38页
        2.2.1 实验技术路线第27-28页
        2.2.2 利用转座技术获得2~第28-30页
        2.2.3 苯酚-硫酸法胞外多糖(EPS)产量的测定第30页
        2.2.4 2~第30-31页
        2.2.5 与产胞外多糖相关基因的荧光定量PCR分析第31-33页
        2.2.6 WANG-1108与WANG-0840生物信息学分析第33页
        2.2.7 重组质粒 pET28a-ZW3/2~第33-34页
        2.2.8 基因片段与质粒pET28a的双酶切与连接第34-35页
        2.2.9 大肠杆菌DH5α (pET28a-1108/pET28a-0840)转化子的制备第35-36页
        2.2.10 重组菌株蛋白的诱导表达及酶活测定第36-37页
        2.2.11 WANG_1108丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶酶活的测定第37-38页
3 结果与讨论第38-65页
    3.1 利用Mp转座技术获得2~第38页
        3.1.1 Mμ转座DNA的制备第38页
        3.1.2 验证突变株第38页
    3.2 马奶酒样乳杆菌ZW3及其2~第38-40页
    3.3 2~第40-43页
        3.3.1 二羟丙酮激酶(WANG_0175)与EPS产量的相关分析第41-42页
        3.3.2 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(WANG_1108)与EPS产量的相关分析第42页
        3.3.3 UDP-N-乙酰胞壁酸-L-丙氨酸:D-谷氨酸连接酶(MurD)与EPS产量的相关分析第42-43页
    3.4 与产胞外多糖相关的突变基因的荧光定量PCR分析第43-48页
        3.4.1 ZW3与2~第43-44页
        3.4.2 RT-qPCR引物特异性及扩增效率第44-46页
        3.4.3 突变基因荧光定量PCR分析第46-48页
    3.5 WANG_1108与WANG_0840生物信息学分析第48-57页
        3.5.1 核酸序列的组成及特征第48-49页
        3.5.2 稀有密码子分析第49-50页
        3.5.3 酶切位点分析第50-51页
        3.5.4 氨基酸序列基本理化特性分析第51-52页
        3.5.5 蛋白信号肽分析第52-54页
        3.5.6 跨膜结构域分析第54-55页
        3.5.7 蛋白二级结构预测第55-56页
        3.5.8 蛋白三级结构预测第56页
        3.5.9 保守结构域和活性位点分析第56-57页
    3.6 重组质粒 pET28a-ZW3/2~(第57-60页
        3.6.1 扩增基因片段第57-58页
        3.6.2 重组质粒 pET28a-ZW3/2~(第58页
        3.6.3 重组质粒验证第58-59页
        3.6.4 重组质粒测序结果第59-60页
    3.7 重组蛋白的诱导表达及酶活测定第60-63页
        3.7.1 重组质粒转至大肠杆菌表达菌株E.coli BL21(DE3)第60-61页
        3.7.2 重组子蛋白的诱导表达及丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶酶活测定第61-63页
    3.8 讨论第63-65页
4 结论第65-66页
5 展望第66-67页
6 参考文献第67-76页
7 攻读硕士期间发表论文情况第76-77页
8 致谢第77-78页
附录第78-81页

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