| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 引言 | 第10-11页 |
| 中英文对照缩略词表 | 第11-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-24页 |
| 1.1 鲜味肽概述 | 第12页 |
| 1.2 鲜味受体研究进展 | 第12-14页 |
| 1.3 分子模拟 | 第14-22页 |
| 1.3.1 同源建模 | 第15-16页 |
| 1.3.2 分子对接 | 第16-18页 |
| 1.3.3 分子动力学 | 第18-19页 |
| 1.3.4 结合自由能计算 | 第19-22页 |
| 1.4 课题立题依据和主要研究内容 | 第22-24页 |
| 1.4.1 立题依据 | 第22-23页 |
| 1.4.2 研究内容 | 第23-24页 |
| 第二章 鲜味受体同源建模 | 第24-29页 |
| 2.1 实验材料 | 第24页 |
| 2.2 计算平台 | 第24-25页 |
| 2.2.1 硬件平台 | 第24页 |
| 2.2.2 软件平台 | 第24-25页 |
| 2.3 实验方法 | 第25-27页 |
| 2.3.1 模型构建 | 第26页 |
| 2.3.2 模型优化 | 第26页 |
| 2.3.3 模型评估 | 第26-27页 |
| 2.4 结果与讨论 | 第27-28页 |
| 2.4.1 鲜味受体T1R1/T1R3胞外建模模型 | 第27页 |
| 2.4.2 鲜味受体模型评估 | 第27-28页 |
| 2.5 本章小结 | 第28-29页 |
| 第三章 鲜味六肽与鲜味受体的分子对接 | 第29-40页 |
| 3.1 实验材料 | 第29-30页 |
| 3.2 计算平台 | 第30页 |
| 3.3 实验方法 | 第30-31页 |
| 3.3.1 鲜味六肽结构确定 | 第30页 |
| 3.3.2 鲜味六肽与鲜味受体的分子对接 | 第30-31页 |
| 3.4 结果与讨论 | 第31-39页 |
| 3.4.1 优化后的鲜味六肽 | 第31-34页 |
| 3.4.2 鲜味六肽与鲜味受体的分子对接 | 第34-39页 |
| 3.5 本章小结 | 第39-40页 |
| 第四章 鲜味六肽与鲜味受体复合物的分子动力学模拟 | 第40-51页 |
| 4.1 实验材料 | 第40-41页 |
| 4.2 计算平台 | 第41页 |
| 4.3 实验方法 | 第41-42页 |
| 4.3.1 复合物的分子动力学模拟 | 第41-42页 |
| 4.3.2 结合自由能计算 | 第42页 |
| 4.4 结果与讨论 | 第42-50页 |
| 4.4.1 MD模拟过程中体系的稳定性 | 第42-44页 |
| 4.4.2 鲜味受体与六肽的相互作用分析 | 第44-48页 |
| 4.4.3 构象变化分析 | 第48-49页 |
| 4.4.4 结合能分析 | 第49-50页 |
| 4.5 本章小结 | 第50-51页 |
| 第五章 总结和展望 | 第51-53页 |
| 5.1 结论 | 第51页 |
| 5.2 展望 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-58页 |
| 附录 | 第58-63页 |
| 附录1 | 第58-61页 |
| 附录2 | 第61-62页 |
| 附录3 | 第62-63页 |
| 致谢 | 第63页 |