基于全基因组关联性分析的酒酒球菌抗酸基因研究
| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-19页 |
| 1.1 简介 | 第11页 |
| 1.2 葡萄酒中的乳酸菌 | 第11-12页 |
| 1.3 酒球菌属多样性 | 第12页 |
| 1.4 抗酸机制研究进展 | 第12-15页 |
| 1.4.1 革兰氏阳性细菌抗酸机制研究进展 | 第12-13页 |
| 1.4.2 酒酒球菌酸胁迫机制研究进展 | 第13-15页 |
| 1.5 酒酒球菌抗酸/酸敏菌株RAPD标记 | 第15页 |
| 1.6 全基因组关联分析研究进展 | 第15-16页 |
| 1.7 离子注入诱变育种 | 第16页 |
| 1.8 研究目的及意义 | 第16-17页 |
| 1.9 研究内容及技术路线 | 第17-19页 |
| 1.9.1 研究内容 | 第17-18页 |
| 1.9.2 技术路线 | 第18-19页 |
| 第二章 抗酸差异表型菌株的筛选 | 第19-25页 |
| 2.1 试验材料 | 第19-20页 |
| 2.1.1 试验菌株 | 第19页 |
| 2.1.2 试验仪器与设备 | 第19页 |
| 2.1.3 培养基配置 | 第19-20页 |
| 2.2 试验方法 | 第20-21页 |
| 2.2.1 菌株初步筛选 | 第20页 |
| 2.2.2 离子注入诱变育种 | 第20-21页 |
| 2.3 试验结果及分析 | 第21-25页 |
| 2.3.1 菌株初筛 | 第21-24页 |
| 2.3.3 小结 | 第24-25页 |
| 第三章 突变酒酒球菌表型差异比较分析 | 第25-31页 |
| 3.1 试验材料 | 第25-26页 |
| 3.1.1 试验仪器与试剂 | 第25页 |
| 3.1.2 试验菌株与培养基配置 | 第25-26页 |
| 3.2 试验方法 | 第26-27页 |
| 3.2.1 样品的制备 | 第26页 |
| 3.2.2 β-葡萄糖苷酶活性测定方法 | 第26页 |
| 3.2.3 对硝基苯酚标准曲线 | 第26页 |
| 3.2.4 苹果酸降解试验 | 第26-27页 |
| 3.3 统计分析 | 第27页 |
| 3.4 试验结果与分析 | 第27-31页 |
| 3.4.1 pH 3.0 下菌株的生长曲线 | 第27-28页 |
| 3.4.2 β-葡萄糖苷酶活性测定 | 第28-29页 |
| 3.4.3 苹果酸降解试验 | 第29-30页 |
| 3.4.4 小结 | 第30-31页 |
| 第四章 全基因组关联性分析 | 第31-46页 |
| 4.1 试验材料 | 第31页 |
| 4.1.1 试验菌株 | 第31页 |
| 4.1.2 主要试剂 | 第31页 |
| 4.1.3 主要仪器和设备 | 第31页 |
| 4.2 试验方法 | 第31-32页 |
| 4.2.1 菌株活化 | 第31页 |
| 4.2.2 DNA提取 | 第31页 |
| 4.2.3 DNA检测 | 第31页 |
| 4.2.4 测序及生物信息分析 | 第31-32页 |
| 4.3 结果与分析 | 第32-46页 |
| 4.3.1 送样菌株DNA提取浓度、纯度分析 | 第32-33页 |
| 4.3.2 测序数据质量统计 | 第33-34页 |
| 4.3.3 编码基因预测 | 第34页 |
| 4.3.4 重复序列统计分析 | 第34-38页 |
| 4.3.5 NR数据库注释 | 第38-39页 |
| 4.3.6 共有和特有基因分析 | 第39-40页 |
| 4.3.7 SNP统计与注释 | 第40-42页 |
| 4.3.8 GWAS统计分析 | 第42页 |
| 4.3.9 统计基因的GO分类和KEGG功能富集 | 第42-44页 |
| 4.3.10 小结 | 第44-46页 |
| 第五章 结论与展望 | 第46-48页 |
| 5.1 结论 | 第46页 |
| 5.2 主要创新点 | 第46页 |
| 5.3 展望 | 第46-48页 |
| 参考文献 | 第48-53页 |
| 附录1 | 第53-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 作者简介 | 第63页 |
