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基于解折叠自由能预测的胆固醇氧化酶热稳定性改造

摘要第1-4页
Abstract第4-7页
第一章 绪论第7-14页
   ·胆固醇氧化酶研究进展简介第7-9页
     ·COD的特性及稳定性现状第7-8页
     ·COD的分子改造及稳定性研究第8-9页
   ·影响蛋白质热稳定的因素第9-11页
     ·分子内相互作用第9-10页
     ·构象因素第10-11页
   ·应用生物信息学辅助设计蛋白质稳定性改造的策略第11-12页
     ·同源比对的改造策略第11页
     ·结合蛋白质解折叠自由能的改造策略第11-12页
     ·结合温度因子的改造策略第12页
     ·设计二硫键的改造策略第12页
     ·优化表面电荷的策略第12页
   ·本课题研究的主要内容第12-14页
第二章 材料与方法第14-23页
   ·实验材料第14-17页
     ·菌株第14页
     ·质粒第14页
     ·引物第14-15页
     ·主要试剂第15-16页
     ·主要仪器第16页
     ·培养基第16页
     ·常用溶液配方第16-17页
   ·实验方法第17-23页
     ·质粒DNA的提取第17页
     ·突变株的构建第17-18页
     ·粗酶液的制备及纯化第18-20页
     ·酶活及酶学性质的测定第20-21页
     ·圆二色谱检测蛋白二级结构的变化及Tm值的确定第21页
     ·序列比对第21页
     ·同源模拟CODr及突变株三维结构第21-22页
     ·采用Rosetta进行突变位点预测第22-23页
第三章 结果与讨论第23-41页
   ·CODr关键部位lid区域的理性改造第23-27页
     ·CODr lid区域同源比对及待突变位点的确定第23-24页
     ·lid区域的分子改造第24-25页
     ·突变酶的热稳定性及底物特异性第25-27页
   ·基于解折叠自由能的计算,设计并筛选热稳定性提高的正突变株第27-36页
     ·解折叠自由能的解读及CODr突变位点的理性取代第27-31页
     ·定点突变和组合突变提高CODr热稳定性第31-34页
     ·突变酶酶学性质研究第34-36页
   ·突变酶的结构分析并诠释热稳定性提高的分子机理第36-41页
     ·圆二色谱(CD)检测突变酶的二级结构变化第36-37页
     ·N86 位点的突变酶结构解析第37-38页
     ·其他正向突变酶相关位点的结构分析第38-41页
主要结论及展望第41-43页
致谢第43-44页
参考文献第44-49页
附录:作者在攻读硕士学位期间发表的论文第49页

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