| 摘要 | 第10-12页 |
| Abstract | 第12-13页 |
| 1 引言 | 第14-24页 |
| 1.1 短乳杆菌的介绍 | 第14-17页 |
| 1.1.1 短乳杆菌基本信息 | 第14页 |
| 1.1.2 短乳杆菌生物学功能 | 第14-16页 |
| 1.1.3 短乳杆菌的实际应用 | 第16-17页 |
| 1.2 元素硒的介绍 | 第17-18页 |
| 1.2.1 硒的存在形式与性质 | 第17页 |
| 1.2.2 硒的生理学功能 | 第17-18页 |
| 1.3 微生物代谢无机硒的研究进展 | 第18-21页 |
| 1.3.1 耐受无机硒的微生物 | 第18-19页 |
| 1.3.2 微生物代谢无机硒机理 | 第19-20页 |
| 1.3.3 转录组水平研究微生物代谢无机硒 | 第20-21页 |
| 1.4 研究目的与意义 | 第21-22页 |
| 1.5 研究内容 | 第22-24页 |
| 2 材料与方法 | 第24-36页 |
| 2.1 材料与仪器 | 第24-27页 |
| 2.1.1 实验菌株 | 第24页 |
| 2.1.2 主要生化试剂 | 第24-25页 |
| 2.1.3 主要仪器设备与分析软件 | 第25-26页 |
| 2.1.4 实验用培养基及溶液的配置 | 第26-27页 |
| 2.2 菌株活化与鉴定 | 第27-28页 |
| 2.2.1 菌株的活化与纯化 | 第27页 |
| 2.2.2 菌株的鉴定 | 第27-28页 |
| 2.3 菌体生物量测定 | 第28页 |
| 2.4 亚硒酸钠对菌体膜损伤的研究 | 第28-30页 |
| 2.4.1 菌体内ATP浓度变化的测定 | 第28-29页 |
| 2.4.2 菌体细胞膜电位变化的测定 | 第29页 |
| 2.4.3 菌体内pH值变化的测定 | 第29页 |
| 2.4.4 菌体细胞膜完整性的测定 | 第29-30页 |
| 2.5 电子显微镜菌体表面观察 | 第30页 |
| 2.5.1 样品制备 | 第30页 |
| 2.5.2 菌体表面元素测定 | 第30页 |
| 2.6 基于转录组学对短乳杆菌转化亚硒酸钠的途径预测 | 第30-35页 |
| 2.6.1 菌体总RNA提取 | 第30-31页 |
| 2.6.2 RNA完整性与纯度检测 | 第31页 |
| 2.6.3 cDNA文库构建 | 第31-32页 |
| 2.6.4 生物信息学分析 | 第32页 |
| 2.6.5 短乳杆菌转化亚硒酸钠产单质硒关键差异表达基因qRT-PCR验证 | 第32-35页 |
| 2.7 丙二醛测定 | 第35页 |
| 2.8 数据与图像处理 | 第35-36页 |
| 3 结果与分析 | 第36-67页 |
| 3.1 菌株鉴定 | 第36-37页 |
| 3.1.1 短乳杆菌CGMCC6683镜检 | 第36页 |
| 3.1.2 16SrDNA鉴定 | 第36-37页 |
| 3.1.3 16SrDNA扩增产物测序与序列比对 | 第37页 |
| 3.2 生物量测定 | 第37-38页 |
| 3.3 亚硒酸钠对菌体细胞膜影响 | 第38-40页 |
| 3.3.1 菌体内ATP浓度变化的测定 | 第38页 |
| 3.3.2 菌体膜电位变化的测定 | 第38页 |
| 3.3.3 菌体内pH变化的测定 | 第38-40页 |
| 3.3.4 菌体细胞膜完整性检测 | 第40页 |
| 3.4 电子显微镜下菌体形态学观察 | 第40-41页 |
| 3.4.1 透射电子显微镜观察 | 第40-41页 |
| 3.4.2 扫描电子显微镜观察 | 第41页 |
| 3.5 菌体表面颗粒元素组成 | 第41-42页 |
| 3.6 转录组测序结果与分析 | 第42-66页 |
| 3.6.1 RNA的质量鉴定 | 第42-44页 |
| 3.6.2 原始测序数据质量评估 | 第44-46页 |
| 3.6.3 参考基因组比对 | 第46-48页 |
| 3.6.4 基因表达水平分析 | 第48-49页 |
| 3.6.5 样品间相关性的分析 | 第49页 |
| 3.6.6 差异表达基因分析 | 第49-64页 |
| 3.6.7 关键差异表达基因qRT-PCR验证 | 第64-66页 |
| 3.7 丙二醛含量测定 | 第66-67页 |
| 4 讨论 | 第67-73页 |
| 4.1 亚硒酸钠对短乳杆菌生物量的影响 | 第67页 |
| 4.2 亚硒酸钠对短乳杆菌细胞膜的影响 | 第67-69页 |
| 4.2.1 显微镜观察 | 第67-68页 |
| 4.2.2 菌体生理生化指标的变化 | 第68-69页 |
| 4.3 短乳杆菌代谢亚硒酸钠的机理 | 第69-73页 |
| 4.3.1 丙酮酸盐代谢和脂肪酸生物合成 | 第69-70页 |
| 4.3.2 NOD样受体信号通路与硒化物代谢通路 | 第70-71页 |
| 4.3.3 与电子传递链相关差异表达基因 | 第71-72页 |
| 4.3.4 编码膜蛋白基因 | 第72-73页 |
| 5 结论 | 第73-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-85页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第85页 |