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自然发酵豆酱酱醅微生物多样性分析

摘要第10-12页
Abstract第12-13页
第一章 前言第14-20页
    1.1 豆酱概述第14页
    1.2 微生物多样性研究常用的方法第14-17页
        1.2.1 纯培养技术第14-15页
        1.2.2 rDNA文库构建技术第15页
        1.2.3 变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术第15-16页
        1.2.4 高通量测序技术第16-17页
    1.3 宏蛋白质组学概述第17-19页
        1.3.1 宏蛋白质组学定义第17页
        1.3.2 宏蛋白质组学的基本策略第17-18页
        1.3.3 宏蛋白质组学的应用第18-19页
    1.4 研究的意义及内容第19-20页
        1.4.1 研究意义第19页
        1.4.2 研究内容第19-20页
第二章 辽宁省不同地区自然发酵豆酱酱醅的微生物多样性分析第20-33页
    2.1 试验材料第20-21页
        2.1.1 样品采集第20页
        2.1.2 主要试验设备和试剂第20-21页
    2.2 试验方法第21-22页
        2.2.1 样品总DNA的提取第21页
        2.2.2 PCR扩增第21页
        2.2.3 MetaVx文库构建第21页
        2.2.4 Illumina MiSeq测序第21页
        2.2.5 生物信息分析第21-22页
    2.3 结果与分析第22-33页
        2.3.1 测序数据质量优化第22-23页
        2.3.2 OTU分析第23-24页
        2.3.3 Alpha多样性分析第24-26页
        2.3.4 稀释曲线第26页
        2.3.5 门水平上豆酱酱醅菌群的结构分析第26-28页
        2.3.6 属水平上豆酱酱醅菌群的结构分析第28-33页
第三章 自然发酵豆酱酱醅发酵不同阶段微生物多样性分析第33-43页
    3.1 试验材料第33页
        3.1.1 样品采集第33页
        3.1.2 主要试验设备和试剂第33页
    3.2 试验方法第33页
    3.3 结果与分析第33-43页
        3.3.1 测序数据质量优化第33-34页
        3.3.2 OTU分析第34页
        3.3.3 Alpha多样性分析第34-35页
        3.3.4 稀释曲线第35-36页
        3.3.5 门水平上发酵不同阶段豆酱酱醅菌群的结构分析第36-38页
        3.3.6 属水平上发酵不同阶段豆酱酱醅菌群的结构分析第38-40页
        3.3.7 OTU的维恩氏图第40-43页
第四章 自然发酵豆酱酱醅宏蛋白质组学分析第43-57页
    4.1 试验材料第43-44页
        4.1.1 样品采集第43页
        4.1.2 试剂第43页
        4.1.3 仪器与设备第43-44页
    4.2 试验方法第44-47页
        4.2.1 蛋白质提取第44-45页
        4.2.2 Bradford蛋白定量第45页
        4.2.3 SDS-PAGE电泳第45页
        4.2.4 蛋白还原烷基化及Trypsin酶解第45页
        4.2.5 质谱分析第45-46页
        4.2.6 质谱鉴定第46页
        4.2.7 数据分析第46-47页
    4.3 结果与分析第47-57页
        4.3.1 定量结果第47页
        4.3.2 SDS-PAGE电泳结果第47-48页
        4.3.3 肽段长度分布第48页
        4.3.4 蛋白质鉴定结果第48-49页
        4.3.5 物种注释第49-50页
        4.3.6 功能分析第50-57页
第五章 讨论与结论第57-60页
    5.1 讨论第57-59页
        5.1.1 豆酱酱醅中的细菌多样性分析第57-58页
        5.1.2 豆酱酱醅中的真菌多样性分析第58-59页
    5.2 结论第59-60页
参考文献第60-65页
附录第65-70页
致谢第70-71页
攻读学位论文期间发表文章第71页

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