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木糖代谢关键酶基因的克隆及其在酿酒酵母中的表达

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
目录第9-13页
第一章 绪论第13-27页
    1.1 纤维素燃料乙醇及木糖发酵第13-14页
    1.2 发酵木糖的微生物及基因工程菌第14-18页
        1.2.1 木糖代谢途径第14-15页
        1.2.2 细菌的木糖发酵第15-17页
        1.2.3 酵母的木糖发酵第17-18页
        1.2.4 丝状真菌的木糖发酵第18页
    1.3 酿酒酵母作为木糖发酵宿主的研究进展第18-19页
    1.4 提高木糖发酵能力的策略及挑战第19-24页
        1.4.1 木糖运输第20-21页
        1.4.2 关键酶的辅酶特异性及氧化还原平衡第21-22页
        1.4.3 磷酸戊糖途径第22-23页
        1.4.4 木质纤维素水解物的抑制因子第23页
        1.4.5 传统育种方法第23-24页
    1.5 新型关键酶基因的克隆和表达研究进展第24-25页
    1.6 本论文的研究内容与目标第25-27页
第二章 木糖代谢关键酶基因的克隆第27-43页
    2.1 实验材料第27-31页
        2.1.1 菌株和质粒第27页
        2.1.2 分子克隆用酶和试剂第27-28页
        2.1.3 主要试剂第28-29页
        2.1.4 培养基第29页
        2.1.5 仪器设备第29-30页
        2.1.6 引物设计第30-31页
    2.2 实验方法第31-36页
        2.2.1 拟筛选菌株的亲缘关系分析第31页
        2.2.2 酵母总 RNA的提取纯化第31-32页
        2.2.3 基因局部序列扩增第32-33页
        2.2.4 琼脂糖凝胶电泳第33页
        2.2.5 DNA片段切胶回收第33页
        2.2.6 扩增产物连接克隆载体(TA克隆)及测序第33-34页
        2.2.7 3`RACE 实验第34-35页
        2.2.8 5`RACE 实验(SMART RACE)第35页
        2.2.9 XYL1、XYL2 基因全长 cDNA的获得第35页
        2.2.10 基因序列比较第35-36页
    2.3 结果与讨论第36-41页
        2.3.1 亲缘关系分析第36-37页
        2.3.2 酵母细胞总 RNA提取第37页
        2.3.3 简并引物扩增结果第37-38页
        2.3.4 RACE 实验结果第38-39页
        2.3.5 进化关系分析第39-41页
    2.4 本章小结第41-43页
第三章 关键酶基因在大肠杆菌中的表达第43-55页
    3.1 实验材料第43-45页
        3.1.1 菌株和质粒第43页
        3.1.2 分子克隆用酶和试剂第43-44页
        3.1.3 主要试剂第44页
        3.1.4 培养基第44页
        3.1.5 仪器设备第44页
        3.1.6 引物设计第44-45页
    3.2 实验方法第45-50页
        3.2.1 嗜热厌氧杆菌基因组 DNA提取第45-46页
        3.2.2 大肠杆菌质粒提取第46页
        3.2.3 表达载体构建第46-47页
        3.2.4 转化表达宿主菌第47页
        3.2.5 诱导表达及粗酶液制备第47-48页
        3.2.6 蛋白电泳分析第48页
        3.2.7 酶活测定第48-49页
        3.2.8 蛋白含量测定第49-50页
    3.3 实验结果第50-53页
        3.3.1 表达载体构建第50-51页
        3.3.2 质粒提取并转化大肠杆菌 BL21(DE3)第51页
        3.3.3 SDS-PAGE电泳结果第51-52页
        3.3.4 酶活测定第52-53页
    3.4 本章小结第53-55页
第四章 在酿酒酵母中构建木糖代谢途径第55-73页
    4.1 实验材料第55-57页
        4.1.1 菌株和载体第55页
        4.1.2 分子克隆用酶和试剂第55-56页
        4.1.3 主要试剂第56页
        4.1.4 培养基第56页
        4.1.5 仪器设备第56页
        4.1.6 引物设计第56-57页
    4.2 实验方法第57-64页
        4.2.1 酵母基因组提取第57-58页
        4.2.2 PCR 扩增反应第58-59页
        4.2.3 DNA限制酶消化第59-60页
        4.2.4 DNA的连接反应第60页
        4.2.5 质粒提取第60页
        4.2.6 两步基因置换法插入 pPGK1启动子第60-62页
        4.2.7 酿酒酵母电转化及筛选第62-63页
        4.2.8 酿酒酵母菌落 PCR鉴定重组子第63-64页
    4.3 结果与讨论第64-70页
        4.3.1 质粒 YIplac211-dpXKS构建第64-66页
        4.3.2 在酿酒酵母 XKS1 基因前插入 pPGK1启动子第66页
        4.3.3 质粒 pOJ02、pOJ03 的构建第66-68页
        4.3.4 质粒 pOJ04的构建第68-70页
        4.3.5 在酿酒酵母中转入关键酶基因第70页
    4.4 本章小结第70-73页
第五章 酿酒酵母工程菌的酶活测定及发酵性能研究第73-89页
    5.1 实验材料第73-74页
        5.1.1 实验菌株第73页
        5.1.2 主要试剂第73-74页
        5.1.3 培养基第74页
        5.1.4 仪器设备第74页
    5.2 实验方法第74-76页
        5.2.1 粗酶液制备第74-75页
        5.2.2 酶活测定第75页
        5.2.3 蛋白含量测定第75-76页
        5.2.4 发酵条件第76页
        5.2.5 HPLC 测定发酵液成分第76页
    5.3 实验结果第76-87页
        5.3.1 XR、XDH、XK 及 XI酶活测定第76-78页
        5.3.2 XR-XDH重组菌的好氧发酵第78-80页
        5.3.3 XR-XDH重组菌的限氧发酵第80-82页
        5.3.4 XR-XDH重组菌的厌氧发酵第82-84页
        5.3.5 XI重组菌的厌氧发酵第84-85页
        5.3.6 不同条件的发酵特性比较第85-87页
    5.4 本章小结第87-89页
结论与展望第89-91页
    一、结论第89-90页
    二、展望第90-91页
参考文献第91-105页
攻读硕士学位期间取得的研究成果第105-106页
致谢第106-107页
附件第107页

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