| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第一章 绪论 | 第11-23页 |
| 1.1 浓香型白酒概述 | 第11页 |
| 1.2 浓香型白酒窖泥质量概述 | 第11-12页 |
| 1.3 浓香型白酒窖泥微生物概述 | 第12-21页 |
| 1.3.1 窖泥微生物群落多样性研究技术 | 第12-17页 |
| 1.3.2 梭菌纲微生物与窖泥 | 第17-19页 |
| 1.3.3 微生物之间相关性研究 | 第19-21页 |
| 1.4 本课题的研究内容与意义 | 第21-23页 |
| 1.4.1 本研究的立题依据及存在的科学问题 | 第21页 |
| 1.4.2 本论文的主要研究内容 | 第21-23页 |
| 第二章 不同质量窖泥中微生物群落结构及多样性变化规律 | 第23-43页 |
| 2.1 前言 | 第23页 |
| 2.2 材料与方法 | 第23-30页 |
| 2.2.1 样品采集 | 第23-24页 |
| 2.2.2 主要仪器及试剂 | 第24页 |
| 2.2.3 培养基及溶液配制 | 第24页 |
| 2.2.4 技术路线 | 第24-25页 |
| 2.2.5 理化指标检测 | 第25-26页 |
| 2.2.6 基因组提取 | 第26-27页 |
| 2.2.7 PCR扩增及Illumina Miseq测序 | 第27页 |
| 2.2.8 高通量测序的生物信息学分析 | 第27-29页 |
| 2.2.9 数据处理 | 第29-30页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第30-41页 |
| 2.3.1 不同质量窖泥中原核微生物群落组成与多样性变化规律 | 第30-34页 |
| 2.3.2 窖泥质量判定微生物指标的确定及验证 | 第34-35页 |
| 2.3.3 窖泥微生物之间相关性 | 第35-38页 |
| 2.3.4 不同质量梯度窖泥理化因子检测 | 第38-40页 |
| 2.3.5 环境因子对窖泥微生物群落多样性及结构的影响 | 第40-41页 |
| 2.4 本章小结 | 第41-43页 |
| 第三章 基于 16S rRNA基因特异性引物的梭菌群落定性及定量分析方法建立 | 第43-65页 |
| 3.1 前言 | 第43页 |
| 3.2 材料与方法 | 第43-50页 |
| 3.2.1 窖泥样品及菌株 | 第43-44页 |
| 3.2.2 主要仪器及试剂 | 第44页 |
| 3.2.3 培养基及溶液配制 | 第44页 |
| 3.2.4 菌株培养条件及其基因组提取 | 第44页 |
| 3.2.5 窖泥样品基因组提取 | 第44-45页 |
| 3.2.6 梭菌特异性引物设计及合成 | 第45-46页 |
| 3.2.7 PCR扩增条件优化 | 第46页 |
| 3.2.8 PCR-DGGE分析 | 第46-47页 |
| 3.2.9 系统发育分析 | 第47页 |
| 3.2.10 梭菌实时荧光定量方法（qPCR）的建立 | 第47-50页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第50-64页 |
| 3.3.1 梭菌纲特异性引物设计 | 第50-51页 |
| 3.3.2 梭菌引物的理论验证 | 第51-53页 |
| 3.3.3 PCR扩增条件优化及引物特异性验证 | 第53-55页 |
| 3.3.4 梭菌引物SJ-F/SJ-R在复杂微生物体系-窖泥中梭菌检测 | 第55-62页 |
| 3.3.5 窖泥梭菌菌群实时荧光定量方法的建立及应用 | 第62-64页 |
| 3.4 本章小结 | 第64-65页 |
| 第四章 窖泥中梭菌群落多样性及其时间特征研究 | 第65-75页 |
| 4.1 前言 | 第65页 |
| 4.2 材料与方法 | 第65-67页 |
| 4.2.1 样品采集 | 第65-66页 |
| 4.2.2 主要试剂及仪器 | 第66页 |
| 4.2.3 培养基及溶液配制 | 第66页 |
| 4.2.4 窖泥基因组提取 | 第66页 |
| 4.2.5 PCR扩增及Illumina Miseq测序 | 第66页 |
| 4.2.6 高通量测序的生物信息学分析 | 第66页 |
| 4.2.7 不同年份窖泥样品中梭菌定量 | 第66-67页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第67-73页 |
| 4.3.1 窖泥中梭菌群落物种多样性的演变规律 | 第67-68页 |
| 4.3.2 窖泥中梭菌群落组成演变规律 | 第68-69页 |
| 4.3.3 窖泥主要梭菌的系统发育分析 | 第69-73页 |
| 4.3.4 不同年份窖泥中梭菌菌群含量 | 第73页 |
| 4.4 本章小结 | 第73-75页 |
| 第五章 窖泥中产己酸梭菌Clostridum kluyveri的鉴定及其定量分析 | 第75-91页 |
| 5.1 前言 | 第75页 |
| 5.2 材料与方法 | 第75-79页 |
| 5.2.1 窖泥样品采集 | 第75页 |
| 5.2.2 主要仪器及试剂 | 第75页 |
| 5.2.3 培养基及溶液配制 | 第75-76页 |
| 5.2.4 厌氧芽孢杆菌筛选 | 第76页 |
| 5.2.5 构建产己酸及不产己酸微生物菌群 | 第76-77页 |
| 5.2.6 基因组提取及菌种鉴定 | 第77页 |
| 5.2.7 菌群基因组PCR扩增及DGGE分析 | 第77页 |
| 5.2.8 产己酸菌株N6挥发性代谢物定性分析 | 第77页 |
| 5.2.9 己酸定量分析 | 第77-78页 |
| 5.2.10 荧光定量PCR方法（qPCR）的建立 | 第78页 |
| 5.2.11 系统发育分析 | 第78-79页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第79-90页 |
| 5.3.1 可培养方法确定窖泥中主要产己酸细菌种属 | 第79-82页 |
| 5.3.2 菌株Clostridium kluyveri N6的形态及生理生化特征 | 第82-83页 |
| 5.3.3 菌株N6挥发性代谢物图谱 | 第83-85页 |
| 5.3.4 PCR-DGGE方法确定窖泥中主要己酸细菌种属 | 第85-87页 |
| 5.3.5 窖泥中产芽孢杆菌系统发育分析 | 第87-88页 |
| 5.3.6 科氏梭菌（C. kluyveri）在窖泥中的含量分析 | 第88-90页 |
| 5.4 本章小结 | 第90-91页 |
| 主要结论与展望 | 第91-94页 |
| 主要结论 | 第91-93页 |
| 展望 | 第93-94页 |
| 论文主要创新点 | 第94-95页 |
| 致谢 | 第95-96页 |
| 参考文献 | 第96-109页 |
| 附录：作者攻读博士学位期间发表的文章 | 第109-110页 |
| 附表 | 第110-112页 |
| 附图 | 第112-113页 |
