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极端嗜盐古菌Halogranum amylolyticum TNN58合成PHBV的研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 绪论第11-30页
    1.1 PHA的简介第11-13页
    1.2 细菌合成PHA第13-14页
    1.3 嗜盐菌合成PHA第14-18页
        1.3.1 嗜盐菌简介第14-15页
        1.3.2 极端嗜盐古菌合成PHA第15-16页
        1.3.3 嗜盐细菌合成PHA第16-18页
    1.4 PHA的合成途径第18-23页
        1.4.1 细菌中PHA合成途径第18-21页
        1.4.2 细菌天然PHA合成途径中的相关酶第21-22页
        1.4.3 极端嗜盐古菌PHA合成途径第22-23页
    1.5 PHA合成的关键酶——PHA合酶第23-27页
        1.5.1 PHA的一级结构第23-24页
        1.5.2 PHA合酶的分类第24-25页
        1.5.3 PHA合酶基因编码的组织形式第25-26页
        1.5.4 PHA合酶的分类二级结构和四级结构第26-27页
    1.6 PHA的降解第27-28页
        1.6.1 PHA的胞内降解第27页
        1.6.2 PHA的胞外降解第27-28页
    1.7 论文的工作内容、目的及意义第28-30页
第二章 Halogranum amylolyticum TNN58胞内颗粒状物质的鉴定第30-38页
    2.1 引言第30页
    2.2 材料与方法第30-32页
        2.2.1 菌种第30页
        2.2.2 培养基及培养条件第30-31页
        2.2.3 胞内颗粒物的初步判断第31页
        2.2.4 GC分析第31页
        2.2.5 PHBV的提取方法第31页
        2.2.6 GC-MS第31-32页
        2.2.7 NMR第32页
        2.2.8 电镜观察第32页
    2.3 实验结果第32-37页
        2.3.1 电镜观察第32-33页
        2.3.2 胞内颗粒物的初步鉴定第33-34页
        2.3.3 GC鉴定第34-35页
        2.3.4 PHA的提取和纯化第35页
        2.3.5 GC-MS鉴定第35页
        2.3.6 NMR鉴定第35-37页
    2.4 结论第37-38页
第三章 H.amylolyticum TNN58产PHBV的发酵条件优化第38-53页
    3.1 引言第38页
    3.2 材料与方法第38-43页
        3.2.1 培养基第38-39页
        3.2.2 生物量测定方法第39页
        3.2.3 发酵液残糖测定方法第39页
        3.2.4 PHBV定量分析方法第39页
        3.2.5 基础培养基确定的方法第39页
        3.2.6 考察不同NaCl浓度对H.amylolyticum TNN58积累PHBV产量的影响第39-40页
        3.2.7 考察不同碳源对H.amylolyticum TNN58积累PHBV影响第40页
        3.2.8 考察不同浓度葡萄糖对于积累PHBV影响第40页
        3.2.9 考察不同氮源对积累PHBV影响第40-41页
        3.2.10 考察不同氮源浓度对积累PHBV的影响第41页
        3.2.11 考察不同浓度KCl对积累PHBV的影响第41页
        3.2.12 考察KH_2PO_4浓度对积累PHBV的影响第41页
        3.2.13 正交实验考察最佳发酵条件第41-42页
        3.2.14 摇瓶发酵中PHBV积累与菌体生长曲线的测定第42页
        3.2.15 丙酸添加PHBV发酵的影响第42页
        3.2.16 发酵罐分批发酵第42页
        3.2.17 分批补料发酵第42-43页
    3.3 实验结果第43-52页
        3.3.1 Na Cl浓度对葡萄糖浓度测定的影响第43页
        3.3.2 基础培养基确定第43-44页
        3.3.3 不同碳源对H.amylolyticum TNN58积累PHBV影响第44页
        3.3.4 不同 NaCl 浓度对菌体生长的影响第44-45页
        3.3.5 不同浓度葡萄糖对于积累PHBV影响第45-46页
        3.3.6 不同氮源对H.amylolyticum TNN58积累PHBV影响第46页
        3.3.7 谷氨酸钠浓度对H.amylolyticum TNN58积累PHBV影响第46-47页
        3.3.8 KCl浓度对H.amylolyticum TNN58积累PHBV影响第47-48页
        3.3.9 KH_2PO_4浓度对H.amylolyticum TNN58积累PHBV的影响第48页
        3.3.10 发酵条件的优化第48-49页
        3.3.11 摇瓶发酵中PHBV积累与菌体生长曲线第49-50页
        3.3.12 丙酸添加对PHBV发酵的影响第50-51页
        3.3.13 发酵罐分批发酵第51页
        3.3.14 发酵罐分批补料发酵第51-52页
    3.4 结论第52-53页
第四章 R. eutropha H16和H.amylolyticum TNN58产PHBV材料学性能分析第53-64页
    4.1 引言第53页
    4.2 材料与方法第53-56页
        4.2.1 菌种第53页
        4.2.2 培养基及培养条件第53-54页
        4.2.3 PHBV纯化第54页
        4.2.4 膜的制备方法第54页
        4.2.5 热力学参数测定第54页
        4.2.6 分子量测定第54-55页
        4.2.7 机械性能测定第55页
        4.2.8 SEM分析第55页
        4.2.9 AFM测定第55页
        4.2.10 接触角和表面自由能测定第55页
        4.2.11 血液相容性测定第55-56页
    4.3 实验结果第56-62页
        4.3.1 PHBV-HA和PHBV-RE的制备第56-57页
        4.3.2 PHBV聚合物的物理特性表征第57-60页
        4.3.3 PHBV膜的表面特征第60-61页
        4.3.4 PHBV膜的生物相容性第61-62页
    4.4 小结第62-64页
第五章 Halogranum amylolyticum TNN58PHA合酶的克隆及鉴定第64-82页
    5.1 引言第64页
    5.2 材料与方法第64-72页
        5.2.1 菌株第64页
        5.2.2 质粒第64页
        5.2.3 引物第64-65页
        5.2.4 常用酶第65页
        5.2.5 hiTail-PCR第65-66页
        5.2.6 载体构建第66-67页
        5.2.7 H. hispanica PHB-1 转化试剂和方法第67-69页
            5.2.7.1 试剂的配制第67-68页
            5.2.7.2 转化方法第68-69页
        5.2.8 质粒的提取第69页
            5.2.8.1 大肠杆菌质粒提取第69页
            5.2.8.2 极端嗜盐古菌质粒提取第69页
        5.2.9 极端嗜盐古菌RNA的提取第69页
        5.2.10 RT-PCR第69-71页
            5.2.10.1 蛋白的诱导表达第70页
            5.2.10.2 蛋白的纯化第70-71页
        5.2.11 抗体的制备第71页
        5.2.12 Western blot分析第71-72页
    5.3 实验结果第72-81页
        5.3.1 pha E和pha C的扩增第72-75页
        5.3.2 扩增片段的初步分析第75-76页
        5.3.3 扩增片段的初步分析第76-77页
        5.3.4 H.hispanica PHB-1/p WL102-pha EC的构建第77-78页
        5.3.5 pha E和pha C基因转录分析第78-79页
        5.3.6 pha E和pha C蛋白的Western blot分析第79-80页
        5.3.7 H. hispanica PHB-1 中PHA合酶互补实验第80-81页
    5.4 结论第81-82页
第六章 H.amylolyticum TNN58全基因组测序及PHBV相关碳代谢途径分析第82-94页
    6.1 引言第82页
    6.2 材料与方法第82-83页
        6.2.1 菌株第82页
        6.2.2 基因组测序第82页
        6.2.3 基因组注释第82页
        6.2.4 PHA合酶分析第82页
        6.2.5 PHBV前体供应途径分析第82页
        6.2.6 PHBV降解酶分析第82-83页
        6.2.7 乙醛酸和天冬氨酸分析第83页
    6.3 实验结果第83-93页
        6.3.1 基因组测序第83-84页
        6.3.2 基因组测序初步分析第84页
        6.3.3 基因功能分析第84页
        6.3.4 丙酰CoA合成途径分析第84-89页
        6.3.5 PHA合酶分析第89页
        6.3.6 PHBV合成途径分析第89-90页
        6.3.7 乙醛酸循环和天冬氨酸循环分析第90-91页
        6.3.8 PHA降解分析第91-93页
    6.4 结论第93-94页
主要结论与展望第94-96页
论文主要创新点第96-97页
致谢第97-99页
参考文献第99-104页
附录I 核酸序列第104-119页
附录II 博士期间发表的论文第119页

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