| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 1 引言 | 第8-20页 |
| 1.1 胡椒产品及其加工现状 | 第8-9页 |
| 1.2 胡椒生物脱皮方法概况 | 第9-11页 |
| 1.2.1 传统脱皮法 | 第10页 |
| 1.2.2 酶法脱皮 | 第10-11页 |
| 1.2.3 液态发酵脱皮法 | 第11页 |
| 1.2.4 固态发酵脱皮法 | 第11页 |
| 1.3 微生物菌相的研究 | 第11-17页 |
| 1.3.1 DGGE法的发展及应用 | 第12页 |
| 1.3.2 高通量测序技术的发展 | 第12-16页 |
| 1.3.3 宏基因组学数据的分析 | 第16-17页 |
| 1.4 本研究的目的、意义、内容及创新点 | 第17-20页 |
| 1.4.1 研究的目的及意义 | 第17-18页 |
| 1.4.2 主要研究内容 | 第18-19页 |
| 1.4.3 创新点 | 第19-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-30页 |
| 2.1 原料与仪器 | 第20-24页 |
| 2.1.1 样品来源 | 第20-21页 |
| 2.1.2 本试验采用的菌株及扩增引物 | 第21-23页 |
| 2.1.3 本研究采用的试剂盒及常用试剂 | 第23页 |
| 2.1.4 仪器及设备 | 第23-24页 |
| 2.2 试验方法 | 第24-30页 |
| 2.2.1 麸皮曲的制备 | 第24页 |
| 2.2.2 胡椒脱皮样品的采集及保存 | 第24页 |
| 2.2.3 胡椒脱皮样品中宏基因组DNA的提取 | 第24页 |
| 2.2.4 细菌16s rRNA V3-V4可变区扩增 | 第24-25页 |
| 2.2.5 真菌ITS间隔区扩增 | 第25-26页 |
| 2.2.6 PCR产物纯化、平衡及测序 | 第26-27页 |
| 2.2.7 高质量序列的提取 | 第27页 |
| 2.2.8 测序结果的生物信息学处理 | 第27-28页 |
| 2.2.9 胡椒传统浸泡脱皮过程中核心菌属荧光定量(q-PCR) | 第28页 |
| 2.2.10 液态发酵脱皮过程中关键酶酶活力的测定 | 第28-29页 |
| 2.2.11 数据的统计分析及图表绘制 | 第29页 |
| 2.2.12 核酸序列登录号 | 第29-30页 |
| 3 结果与分析 | 第30-47页 |
| 3.1 胡椒传统浸泡脱皮过程中菌群结构及功能基因的变化 | 第30-37页 |
| 3.1.1 传统浸泡脱皮过程中样品测序深度及样品测序量的说明 | 第30-31页 |
| 3.1.2 传统浸泡脱皮过程中菌群结构的变化 | 第31-34页 |
| 3.1.3 传统浸泡脱皮过程中的核心微生物 | 第34-35页 |
| 3.1.4 传统浸泡脱皮过程中微生物功能特征的变化 | 第35-36页 |
| 3.1.5 微生物菌群结构和功能特征的一致性 | 第36-37页 |
| 3.2 胡椒固态发酵脱皮过程中菌群结构及功能基因的变化 | 第37-47页 |
| 3.2.1 固态发酵脱皮过程中样品测序深度及测序量说明 | 第37-39页 |
| 3.2.2 固态发酵脱皮过程中微生物菌群构成 | 第39-40页 |
| 3.2.3 固态发酵脱皮过程中菌群变化分析 | 第40-44页 |
| 3.2.4 固态发酵脱皮过程中核心微生物 | 第44-47页 |
| 4 讨论 | 第47-50页 |
| 4.1 胡椒传统浸泡脱皮过程中菌群的研究 | 第47-48页 |
| 4.2 胡椒固态发酵脱皮过程中菌群的研究 | 第48-50页 |
| 5 结论 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-59页 |
| 缩略语表 | 第59-60页 |
| 附录 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61页 |
