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Paraburkholderia Caffeinilytica CF1咖啡因降解关键基因克隆及表达分析

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
第一章 文献综述第10-20页
    1.1 咖啡因简介第10-13页
        1.1.1 咖啡因的生物来源及其化学结构第10-11页
        1.1.2 咖啡因物理化学性质第11页
        1.1.3 咖啡因的功能第11页
        1.1.4 咖啡因的危害第11-12页
        1.1.5 茶叶中营养成分第12-13页
    1.2 咖啡因提取方法第13-15页
        1.2.1 溶剂萃取法第13页
        1.2.2 吸附法第13-14页
        1.2.3 升华法第14页
        1.2.4 沉淀法第14页
        1.2.5 微波提取法第14页
        1.2.6 超临界二氧化碳提取法(SFE法)第14-15页
    1.3 咖啡因降解菌的研究动态第15-16页
    1.4 咖啡因在微生物中的代谢途径第16-17页
        1.4.1 N-脱甲基—茶碱途径第17页
        1.4.2 N-脱甲基—可可碱途径第17页
        1.4.3 氧化途径第17页
        1.4.4 黄嘌呤氧化酶途径第17页
    1.5 脱甲基酶的研究第17-18页
    1.6 Paraburkholderia属的研究现状第18页
    1.7 本课题研究目的与意义第18-19页
    1.8 本论文研究内容第19-20页
第二章 咖啡因降解途径功能基因的确定第20-30页
    2.1 差异转录组测序分析第20页
    2.2 实时荧光定量PCR第20-26页
        2.2.1 实验材料第20-22页
            2.2.1.1 菌株来源第20页
            2.2.1.2 培养基第20-21页
            2.2.1.3 主要试剂第21-22页
            2.2.1.4 实验仪器第22页
        2.2.2 引物设计第22-23页
        2.2.3 RNA提取及质量检测第23-24页
            2.2.3.1 RNA提取第23-24页
            2.2.3.2 RNA质量检测第24页
        2.2.4 RNA反转录第24页
        2.2.5 逆转录PCR第24-25页
        2.2.6 实时荧光定量PCR第25-26页
    2.3 实验结果分析第26-28页
        2.3.1 转录组测序第26-27页
        2.3.2 实时荧光定量PCR第27-28页
    2.4 本章小结第28-30页
第三章 cdnA和cdnC基因克隆第30-42页
    3.1 引言第30页
    3.2 材料第30-33页
        3.2.1 菌株、质粒第30页
        3.2.2 仪器第30-31页
        3.2.3 药品与试剂第31-33页
            3.2.3.1 药品第31-32页
            3.2.3.2 培养基第32页
            3.2.3.3 分子实验相关试剂和试剂盒第32-33页
    3.3 方法第33-39页
        3.3.1 提取菌体基因组DNA第33-34页
        3.3.2 目的基因cdnA、cdnC的体外扩增第34-36页
            3.3.2.1 设计引物,扩增目的基因片段第34-35页
            3.3.2.2 琼脂糖凝胶电泳检测及胶回收第35-36页
        3.3.3 克隆质粒构建第36页
        3.3.4 转化第36-37页
            3.3.4.1 超级感受态制备第36-37页
            3.3.4.2 快转第37页
        3.3.5 菌液PCR进行克隆检测第37-38页
        3.3.6 质粒的提取(碱裂解法)第38页
        3.3.7 测序第38-39页
    3.4 实验结果与分析第39-41页
    3.5 本章小结第41-42页
第四章 原核表达系统的构建第42-61页
    4.1 引言第42页
    4.2 材料第42-44页
        4.2.1 菌株和质粒第42页
        4.2.2 仪器第42-43页
        4.2.3 试剂与药品第43-44页
    4.3 诱导蛋白CdnA和CdnC表达及检测活性第44-49页
        4.3.1 原核表达系统构建第44-46页
            4.3.1.1 表达载体pET32a-cdnA和pET32a-cdnC的构建第44-45页
            4.3.1.2 制备表达宿主感受态第45-46页
            4.3.1.3 构建表达菌株第46页
        4.3.2 SDS-PAGE检测表达菌株的目的蛋白表达情况第46-47页
            4.3.2.1 表达菌株诱导第46-47页
        4.3.3 目的蛋白诱导表达条件优化第47-48页
        4.3.4 表达蛋白活性检测第48-49页
    4.4 实验结果与分析第49-60页
        4.4.1 原核表达载体pET32a-cdnA和pET32a-cdnC的构建第49-52页
        4.4.2 目的蛋白诱导表达条件优化第52-55页
        4.4.3 表达蛋白活性检测第55-60页
    4.5 本章小结第60-61页
第五章 结论与展望第61-62页
参考文献第62-65页
致谢第65页

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