| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-21页 |
| 1.1 植物乳杆菌的生物学特性 | 第11-12页 |
| 1.2 氧化胁迫的产生和危害 | 第12-14页 |
| 1.2.1 胞内活性氧的产生及危害 | 第12页 |
| 1.2.2 细胞内活性氧簇的代谢 | 第12-14页 |
| 1.3 乳酸菌氧化胁迫抗性机制的研究进展 | 第14-17页 |
| 1.3.1 ROS解毒酶类 | 第14-15页 |
| 1.3.2 巯基-二硫键氧化还原系统 | 第15-16页 |
| 1.3.3 蛋白质的修复和降解 | 第16-17页 |
| 1.3.4 DNA修复 | 第17页 |
| 1.4 乳酸菌抗氧化胁迫调控机制的研究进展 | 第17-19页 |
| 1.4.1 PerR类转录因子 | 第17页 |
| 1.4.2 FNR类转录因子 | 第17-18页 |
| 1.4.3 Rex类转录因子 | 第18页 |
| 1.4.4 Spx类转录因子 | 第18页 |
| 1.4.5 HypR类转录因子 | 第18-19页 |
| 1.5 研究目的与内容 | 第19-21页 |
| 1.5.1 研究目的及意义 | 第19页 |
| 1.5.2 研究内容 | 第19-20页 |
| 1.5.3 技术路线 | 第20-21页 |
| 第二章 L.plantarum CAUH2的全基因组测序 | 第21-31页 |
| 2.1 材料与试剂 | 第21-22页 |
| 2.1.1 菌株和质粒 | 第21页 |
| 2.1.2 试剂 | 第21页 |
| 2.1.3 试剂的配制 | 第21页 |
| 2.1.4 仪器设备 | 第21-22页 |
| 2.2 实验方法 | 第22-24页 |
| 2.2.1 测序样品的准备 | 第22-23页 |
| 2.2.2 全基因组测序 | 第23页 |
| 2.2.3 基因组的注释及分析方法 | 第23页 |
| 2.2.4 基因组图谱的绘制 | 第23-24页 |
| 2.3 结果与分析 | 第24-28页 |
| 2.3.1 基因组的提取 | 第24页 |
| 2.3.2 质粒的提取 | 第24-25页 |
| 2.3.3 基因组测序结果 | 第25页 |
| 2.3.4 基因组的基本特点 | 第25-26页 |
| 2.3.5 L.plantarum CAUH2蛋白质功能的COG分类 | 第26-27页 |
| 2.3.6 基因组图谱的绘制 | 第27-28页 |
| 2.4 讨论 | 第28-31页 |
| 第三章 L.plantarum CAUH2氧化胁迫应激机制的研究 | 第31-61页 |
| 3.1 材料与试剂 | 第31-33页 |
| 3.1.1 菌株和质粒 | 第31页 |
| 3.1.2 试剂 | 第31-32页 |
| 3.1.3 试剂的配制 | 第32-33页 |
| 3.1.4 仪器设备 | 第33页 |
| 3.2 实验方法 | 第33-40页 |
| 3.2.1 L.plantarum CAUH2氧化胁迫处理条件的确定 | 第33-34页 |
| 3.2.2 L.plantarum CAUH2氧化胁迫条件下转录组的测定 | 第34-35页 |
| 3.2.3 转录组数据的处理 | 第35页 |
| 3.2.4 生物信息学预测L.plantarum CAUH2的氧化胁迫应激机制 | 第35-36页 |
| 3.2.5 基因mdxF突变株的构建及抗氧化功能验证 | 第36-40页 |
| 3.2.6 数据统计分析 | 第40页 |
| 3.3 结果与分析 | 第40-58页 |
| 3.3.1 L.plantarum CAUH2氧化胁迫处理条件的确定 | 第40-41页 |
| 3.3.2 L.plantarum CAUH2总RNA的提取 | 第41页 |
| 3.3.3 转录组测序数据输出与分析 | 第41-49页 |
| 3.3.4 生物信息学预测L.plantarum CAUH2氧化胁迫应激机制 | 第49-56页 |
| 3.3.5 通透酶MdxF的抗氧化功能验证 | 第56-58页 |
| 3.4 讨论 | 第58-61页 |
| 第四章 抗氧化转录因子的筛选及转录因子CopR抗氧化功能研究 | 第61-91页 |
| 4.1 材料与试剂 | 第61-65页 |
| 4.1.1 菌株和质粒 | 第61页 |
| 4.1.2 试剂 | 第61-62页 |
| 4.1.3 试剂的配制 | 第62-64页 |
| 4.1.4 仪器设备 | 第64-65页 |
| 4.2 实验方法 | 第65-77页 |
| 4.2.1 L.plantarum CAUH2中43个转录因子过表达菌株的构建 | 第65-71页 |
| 4.2.2 筛选具有抗氧化功能的转录因子 | 第71页 |
| 4.2.3 copR突变株的构建及抗氧化功能验证 | 第71-72页 |
| 4.2.4 生物信息学预测CopR的靶基因及EMSA验证 | 第72-75页 |
| 4.2.5 靶基因copB突变株的构建及抗氧化功能分析 | 第75-76页 |
| 4.2.6 铜离子耐受实验分析CopB生理功能 | 第76页 |
| 4.2.7 EMSA实验分析转录因子CopR的抗氧化功能机制 | 第76-77页 |
| 4.3 结果与分析 | 第77-86页 |
| 4.3.1 转录因子过表达菌株的构建及蛋白表达的SDS-PAGE检测 | 第77-79页 |
| 4.3.2 筛选具有抗氧化功能的转录因子 | 第79-80页 |
| 4.3.3 copR突变株的构建及抗氧化功能验证 | 第80-82页 |
| 4.3.4 CopR的靶基因预测与验证 | 第82-83页 |
| 4.3.5 靶基因copB突变株的构建及抗氧化功能分析 | 第83-85页 |
| 4.3.6 CopB的铜转运功能分析 | 第85页 |
| 4.3.7 CopR在抗氧化胁迫反应中的调控机制分析 | 第85-86页 |
| 4.4 讨论 | 第86-91页 |
| 第五章 全文总结与展望 | 第91-93页 |
| 5.1 全文总结 | 第91-92页 |
| 5.2 创新点 | 第92页 |
| 5.3 展望 | 第92-93页 |
| 参考文献 | 第93-103页 |
| 致谢 | 第103-105页 |
| 附录 | 第105-111页 |
| 个人简介 | 第111页 |
