| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 英文缩写词表 | 第10-12页 |
| 目录 | 第12-17页 |
| 第一章 绪论 | 第17-42页 |
| 1.1 食品工业中微生物安全问题 | 第17-18页 |
| 1.2 单核细胞增生李斯特菌食物中毒及流行病学特征 | 第18-23页 |
| 1.2.1 单增李斯特菌的生物学特性 | 第19页 |
| 1.2.2 L. monocytogenes 的致病力 | 第19-20页 |
| 1.2.3 L. monocytogenes 的耐药现状 | 第20-21页 |
| 1.2.4 L. monocytogenes 的流行情况 | 第21-23页 |
| 1.3 L. MONOCYTOGENES 污染源追溯的方法 | 第23-30页 |
| 1.3.1 用于 L. monocytogenes 的分型技术的研究进展 | 第23-24页 |
| 1.3.2 PFGE 分型技术 | 第24-27页 |
| 1.3.3 脂肪酸甲酯指纹图谱技术 | 第27-30页 |
| 1.4 微生物免疫防御系统——CRISPR/CAS 系统 | 第30-40页 |
| 1.4.1 CASS 系统的基本结构 | 第31-34页 |
| 1.4.2 CASS 系统的分类 | 第34-35页 |
| 1.4.3 CASS 系统的作用机制及生物学功能 | 第35-38页 |
| 1.4.4 CASS 系统的应用 | 第38-40页 |
| 1.4.5 L. monocytogenes CRISPR 领域的研究进展 | 第40页 |
| 1.5 本课题的研究意义及主要内容 | 第40-42页 |
| 第二章 我国食品中 L. MONOCYTOGENES 的污染现状及致病能力 | 第42-63页 |
| 2.1 引言 | 第42页 |
| 2.2 实验材料 | 第42-46页 |
| 2.2.1 菌株来源 | 第42-44页 |
| 2.2.2 实验仪器 | 第44页 |
| 2.2.3 主要试剂 | 第44-45页 |
| 2.2.4 培养基和溶液配制 | 第45-46页 |
| 2.3 实验方法 | 第46-50页 |
| 2.3.1 我国常见食品中食源性致病菌污染情况分析 | 第46-47页 |
| 2.3.2 L. monocytogenes 血清型及进化谱系分析 | 第47-50页 |
| 2.3.3 统计分析 | 第50页 |
| 2.4 实验结果与讨论 | 第50-61页 |
| 2.4.1 我国常见零售食品中主要食源性致病菌的污染情况 | 第50-53页 |
| 2.4.2 不同地区 L. monocytogenes 污染情况比较 | 第53-55页 |
| 2.4.3 不同种类的食品中 L. monocytogenes 污染情况比较 | 第55-57页 |
| 2.4.4 L. monocytogenes 食品分离株的血清型及谱系分析 | 第57-61页 |
| 2.5 本章小结 | 第61-63页 |
| 第三章 L. MONOCYTOGENES 耐药表型及分子机制的研究 | 第63-80页 |
| 3.1 引言 | 第63-64页 |
| 3.2 实验材料 | 第64-66页 |
| 3.2.1 实验菌株 | 第64页 |
| 3.2.2 质控菌株 | 第64页 |
| 3.2.3 实验仪器 | 第64页 |
| 3.2.4 主要试剂及药敏纸片 | 第64-65页 |
| 3.2.5 培养基及溶液配制 | 第65-66页 |
| 3.3 实验方法 | 第66-73页 |
| 3.3.1 耐药表型检测 | 第66-71页 |
| 3.3.2 耐药基因的检测 | 第71-73页 |
| 3.4 实验结果与讨论 | 第73-79页 |
| 3.4.1 抗生素的选择 | 第73-74页 |
| 3.4.2 药敏实验结果 | 第74-76页 |
| 3.4.3 耐药性与食品来源的相关性分析 | 第76-77页 |
| 3.4.4 耐药性与血清型的相关性分析 | 第77-78页 |
| 3.4.5 耐药基因检测结果与分析 | 第78-79页 |
| 3.5 本章小结 | 第79-80页 |
| 第四章 L.MONOCYTOGENES 的基因指纹图谱分析 | 第80-94页 |
| 4.1 引言 | 第80页 |
| 4.2 实验材料 | 第80-83页 |
| 4.2.1 实验菌株 | 第80页 |
| 4.2.2 实验仪器 | 第80-81页 |
| 4.2.3 主要试剂 | 第81-82页 |
| 4.2.4 培养基和溶液配制 | 第82-83页 |
| 4.3 实验流程 | 第83-84页 |
| 4.4 实验方法 | 第84-88页 |
| 4.4.1 胶块的制备 | 第84-85页 |
| 4.4.2 细胞的裂解 | 第85页 |
| 4.4.3 洗胶块 | 第85-86页 |
| 4.4.4 胶块内 DNA 的酶切 | 第86页 |
| 4.4.5 制备 SKG 琼脂糖大胶、上样 | 第86-87页 |
| 4.4.6 电泳 | 第87页 |
| 4.4.7 染色及图像保存 | 第87-88页 |
| 4.4.8 结果分析 | 第88页 |
| 4.5 实验结果与分析 | 第88-93页 |
| 4.5.1 限制性内切酶的选择 | 第88页 |
| 4.5.2 L. monocytogenes 食品分离株的同源性分析 | 第88-91页 |
| 4.5.3 PFGE 型别与菌株来源的关系 | 第91-92页 |
| 4.5.4 四环素耐药株同源性分析 | 第92-93页 |
| 4.6 本章小结 | 第93-94页 |
| 第五章 L. MONOCYTOGENES 脂肪酸分析 | 第94-108页 |
| 5.1 引言 | 第94页 |
| 5.2 实验材料 | 第94-97页 |
| 5.2.1 实验菌株 | 第94页 |
| 5.2.2 实验仪器 | 第94-95页 |
| 5.2.3 主要试剂 | 第95页 |
| 5.2.4 培养基和主要试剂配制 | 第95-97页 |
| 5.3 实验流程 | 第97页 |
| 5.4 实验方法 | 第97-99页 |
| 5.4.1 脂肪酸的提取 | 第97-98页 |
| 5.4.2 脂肪酸的检测——气象色谱 | 第98-99页 |
| 5.4.3 数据分析 | 第99页 |
| 5.5 实验结果 | 第99-104页 |
| 5.5.1 脂肪酸分析方法在种水平上对 LM 的判别能力 | 第99页 |
| 5.5.2 L.monocytogenes 的脂肪酸成分 | 第99页 |
| 5.5.3 不同血清型的菌株间各脂肪酸组分含量水平的比较 | 第99-101页 |
| 5.5.4 聚类分析 | 第101-104页 |
| 5.6 讨论 | 第104-106页 |
| 5.7 本章小结 | 第106-108页 |
| 第六章 L. MONOCYTOGENES CRISPR 系统的解析 | 第108-148页 |
| 6.1 引言 | 第108-109页 |
| 6.2 实验材料 | 第109-113页 |
| 6.2.1 实验菌株 | 第109-110页 |
| 6.2.2 实验仪器 | 第110页 |
| 6.2.3 主要试剂 | 第110-111页 |
| 6.2.4 培养基和溶液配制 | 第111-113页 |
| 6.3 实验方法 | 第113-123页 |
| 6.3.1 基因组及 CRISPR 的获得 | 第113页 |
| 6.3.2 CRISPR 结构基因座位的确定 | 第113-114页 |
| 6.3.3 DNA 模板的制备(CTAB 法) | 第114页 |
| 6.3.4 CRISPR loci 序列的 PCR 扩增 | 第114-116页 |
| 6.3.5 将 PCR 扩增的 CRISPR loci 片段插入质粒载体 | 第116-119页 |
| 6.3.6 CRISPR loci 序列的测定 | 第119-121页 |
| 6.3.7 CRISPR loc 序列拼接 | 第121-122页 |
| 6.3.8 生物信息学分析 | 第122页 |
| 6.3.9 统计分析 | 第122-123页 |
| 6.4 实验结果与讨论 | 第123-146页 |
| 6.4.1 L. monocytogenes CRISPR-Cas 系统的基因座位 | 第123-125页 |
| 6.4.2 河北省食品分离株 CRISPR 位点的 PCR 检测 | 第125-126页 |
| 6.4.3 L. monocytogenes CRISPR 基本结构特征及活力 | 第126-130页 |
| 6.4.4 repeat-spacer 阵列排布及菌株趋异进化 | 第130-134页 |
| 6.4.5 L. monocytogenes CRISPR 结构的谱系特异性与基因分型 | 第134-136页 |
| 6.4.6 L.monocytogenes CRISPR-Cas 系统的功能 | 第136-141页 |
| 6.4.7 不同菌株 CRISPR LMb 位点的异同 | 第141-146页 |
| 6.5 本章小结 | 第146-148页 |
| 结论与展望 | 第148-150页 |
| 结论 | 第148-149页 |
| 创新之处 | 第149页 |
| 展望 | 第149-150页 |
| 参考文献 | 第150-170页 |
| 附录 | 第170-192页 |
| 攻读博士学位期间取得的研究成果 | 第192-194页 |
| 致谢 | 第194-195页 |
| 附件 | 第195页 |
