摘要 | 第8-10页 |
英文摘要 | 第10-11页 |
1 前言 | 第12-24页 |
1.1 活性氧与氧化应激 | 第12-13页 |
1.1.1 活性氧与氧化应激的定义 | 第12页 |
1.1.2 氧化应激的危害 | 第12-13页 |
1.2 抗氧化防御系统 | 第13-15页 |
1.2.1 酶类抗氧化物 | 第13-14页 |
1.2.2 非酶类抗氧化物 | 第14-15页 |
1.3 乳酸菌抗氧化作用的研究 | 第15-20页 |
1.3.1 乳酸菌简介 | 第15-16页 |
1.3.2 乳酸菌的多种益生功能 | 第16页 |
1.3.3 乳酸菌抗氧化机理的研究进展 | 第16-20页 |
1.4 乳酸菌调控宿主信号通路的研究方法 | 第20-22页 |
1.4.1 基因芯片 | 第21页 |
1.4.2 转录组测序技术 | 第21-22页 |
1.5 本研究的目的与意义 | 第22页 |
1.6 研究内容 | 第22-24页 |
2 材料与方法 | 第24-33页 |
2.1 材料与仪器 | 第24-26页 |
2.1.1 试验菌株和细胞 | 第24页 |
2.1.2 主要试验试剂 | 第24-25页 |
2.1.3 培养液和常用储备液的配制 | 第25-26页 |
2.1.4 主要仪器与设备 | 第26页 |
2.2 试验菌株及细胞的培养 | 第26-27页 |
2.2.1 试验菌株的培养 | 第26-27页 |
2.2.2 试验细胞的培养 | 第27页 |
2.3 乳酸菌清除自由基能力比较 | 第27-28页 |
2.3.1 清除羟自由基能力比较 | 第27页 |
2.3.2 清除超氧阴离子自由基能力比较 | 第27页 |
2.3.3 清除DPPH自由基能力比较 | 第27-28页 |
2.4 乳酸菌缓解Caco-2 细胞氧化损伤能力比较 | 第28-29页 |
2.4.1 Caco-2 细胞氧化损伤模型的构建 | 第28页 |
2.4.2 试验细胞分组 | 第28页 |
2.4.3 抗氧化酶活性的测定 | 第28-29页 |
2.5 DGE测序 | 第29-31页 |
2.5.1 样品分组及处理方法 | 第29页 |
2.5.2 Caco-2 细胞RNA的提取 | 第29页 |
2.5.3 RNA样品质量及完整性检测 | 第29页 |
2.5.4 DGE文库构建及测序 | 第29-30页 |
2.5.5 生物信息分析 | 第30-31页 |
2.6 Real Time PCR验证关键差异基因表达 | 第31-32页 |
2.6.1 反转录 | 第31页 |
2.6.2 Real-time PCR检测基因表达 | 第31-32页 |
2.7 数据处理 | 第32-33页 |
3 结果与分析 | 第33-62页 |
3.1 自由基清除能力 | 第33-35页 |
3.1.1 羟自由基清除能力 | 第33-34页 |
3.1.2 超氧阴离子自由基清除能力 | 第34页 |
3.1.3 DPPH自由基清除能力 | 第34-35页 |
3.2 缓解Caco-2 细胞氧化损伤能力评价 | 第35-37页 |
3.2.1 过氧化氢浓度的选择 | 第35-36页 |
3.2.2 抗氧化酶活性的测定 | 第36-37页 |
3.3 DGE测序及生物信息分析 | 第37-59页 |
3.3.1 RNA质量检测 | 第37-39页 |
3.3.2 测序数据质量评估 | 第39-44页 |
3.3.3 参考序列比对分析 | 第44-46页 |
3.3.4 基因表达水平分析 | 第46-48页 |
3.3.5 差异表达分析 | 第48-51页 |
3.3.6 差异基因GO富集分析 | 第51-54页 |
3.3.7 差异基因KEGG富集分析 | 第54-59页 |
3.4 DGE测序结果验证及关键差异基因表达分析 | 第59-62页 |
4 讨论 | 第62-67页 |
4.1 自由基清除能力 | 第62-63页 |
4.2 缓解Caco-2 细胞抗氧化酶活性损伤 | 第63-64页 |
4.3 调控宿主抗氧化相关信号通路 | 第64-67页 |
5 结论 | 第67-68页 |
致谢 | 第68-69页 |
参考文献 | 第69-77页 |
攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第77页 |