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酸土脂环酸芽孢杆菌耐热关键蛋白筛选及互作网络分析

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 文献综述第11-25页
    1.1 酸土脂环酸芽孢杆菌第11-16页
        1.1.1 脂环酸芽孢杆菌的发现与命名第11页
        1.1.2 脂环酸芽孢杆菌的耐热性第11-12页
        1.1.3 酸土脂环酸芽孢杆菌的生理生化特性第12-13页
        1.1.4 酸土脂环酸芽孢杆菌的危害第13页
        1.1.5 酸土脂环酸芽孢杆菌的检测第13-14页
        1.1.6 酸土脂环酸芽孢杆菌的控制第14-16页
    1.2 非标记定量蛋白组学第16-17页
    1.3 生物信息学第17-18页
        1.3.1 生物信息学简介第17页
        1.3.2 生物信息学的应用第17-18页
    1.4 蛋白质相互作用网络第18-19页
        1.4.1 蛋白质的相互作用第18页
        1.4.2 蛋白质相互作用网络第18-19页
        1.4.3 蛋白互作网络在生物学中的应用第19页
    1.5 酵母双杂交第19-21页
        1.5.1 酵母双杂交原理第19-20页
        1.5.2 酵母双杂交的应用第20-21页
        1.5.3 酵母双杂交的发展第21页
    1.6 研究目的与意义第21-22页
    1.7 研究内容与技术路线第22-25页
        1.7.1 研究内容第22页
        1.7.2 技术路线第22-25页
第二章 Lable-free技术筛选酸土脂环酸芽孢杆菌DSM3922~T热应激关键蛋白第25-39页
    2.1 引言第25-26页
    2.2 试验方法第26-28页
        2.2.1 菌种与培养基第26页
        2.2.2 酸土脂环酸芽孢杆菌的培养和热胁迫处理第26页
        2.2.3 扫描电子显微镜检测酸土脂环酸芽孢杆菌形态第26页
        2.2.4 酸土脂环酸芽孢杆菌总蛋白提取和酶解第26-27页
        2.2.5 酶解产物的LC-ESI-MS/MS分析第27页
        2.2.6 GO分析和KEGG分析第27-28页
        2.2.7 Quantitative Real-time PCR验证主要通路中的关键蛋白第28页
        2.2.8 数据分析第28页
    2.3 结果与分析第28-34页
        2.3.1 热胁迫对酸土脂环酸芽孢杆菌存活率和菌体形态的影响第28-30页
        2.3.2 LC-ESI-MS/MS分析热应激下的差异表达蛋白第30页
        2.3.3 热应激相关蛋白的生物信息学分析第30-33页
        2.3.4 差异表达蛋白的mRNA水平验证第33-34页
    2.4 讨论第34-37页
    2.5 结论第37-39页
第三章 热应激关键蛋白互作网络预测与分析第39-55页
    3.1 引言第39页
    3.2 试验方法第39-40页
        3.2.1 热应激蛋白靶点信息的获取第39-40页
        3.2.2 热应激关键蛋白互作网络的构建第40页
        3.2.3 网络模块分析及GO注释第40页
    3.3 结果与分析第40-50页
        3.3.1 热应激关键蛋白靶点信息第40-43页
        3.3.2 热应激关键蛋白互作网络的构建第43-44页
        3.3.3 网络模块识别与分析第44-50页
    3.4 讨论第50-54页
    3.5 结论第54-55页
第四章 热应激关键蛋白酵母双杂交cDNA文库的构建第55-63页
    4.1 引言第55页
    4.2 试验方法第55-58页
        4.2.1 热应激关键蛋白总RNA提取第55-56页
        4.2.2 mRNA的分离第56页
        4.2.3 双链cDNA的合成与纯化第56-57页
        4.2.4 酵母双杂交cDNA文库构建第57页
        4.2.5 文库库容和cDNA插入片段检测第57-58页
    4.3 结果分析第58-60页
        4.3.1 总RNA的提取第58页
        4.3.2 双链cDNA的合成与纯化第58-59页
        4.3.3 均一化酵母双杂交cDNA文库的构建及质量评价第59-60页
    4.4 讨论第60-61页
    4.5 结论第61-63页
第五章 结论及创新点第63-65页
    5.1 主要结论第63页
    5.2 创新点第63-65页
参考文献第65-75页
致谢第75-77页
攻读硕士期间取得的研究成果第77页

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