摘要 | 第4-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
第一章 文献综述 | 第11-25页 |
1.1 酸土脂环酸芽孢杆菌 | 第11-16页 |
1.1.1 脂环酸芽孢杆菌的发现与命名 | 第11页 |
1.1.2 脂环酸芽孢杆菌的耐热性 | 第11-12页 |
1.1.3 酸土脂环酸芽孢杆菌的生理生化特性 | 第12-13页 |
1.1.4 酸土脂环酸芽孢杆菌的危害 | 第13页 |
1.1.5 酸土脂环酸芽孢杆菌的检测 | 第13-14页 |
1.1.6 酸土脂环酸芽孢杆菌的控制 | 第14-16页 |
1.2 非标记定量蛋白组学 | 第16-17页 |
1.3 生物信息学 | 第17-18页 |
1.3.1 生物信息学简介 | 第17页 |
1.3.2 生物信息学的应用 | 第17-18页 |
1.4 蛋白质相互作用网络 | 第18-19页 |
1.4.1 蛋白质的相互作用 | 第18页 |
1.4.2 蛋白质相互作用网络 | 第18-19页 |
1.4.3 蛋白互作网络在生物学中的应用 | 第19页 |
1.5 酵母双杂交 | 第19-21页 |
1.5.1 酵母双杂交原理 | 第19-20页 |
1.5.2 酵母双杂交的应用 | 第20-21页 |
1.5.3 酵母双杂交的发展 | 第21页 |
1.6 研究目的与意义 | 第21-22页 |
1.7 研究内容与技术路线 | 第22-25页 |
1.7.1 研究内容 | 第22页 |
1.7.2 技术路线 | 第22-25页 |
第二章 Lable-free技术筛选酸土脂环酸芽孢杆菌DSM3922~T热应激关键蛋白 | 第25-39页 |
2.1 引言 | 第25-26页 |
2.2 试验方法 | 第26-28页 |
2.2.1 菌种与培养基 | 第26页 |
2.2.2 酸土脂环酸芽孢杆菌的培养和热胁迫处理 | 第26页 |
2.2.3 扫描电子显微镜检测酸土脂环酸芽孢杆菌形态 | 第26页 |
2.2.4 酸土脂环酸芽孢杆菌总蛋白提取和酶解 | 第26-27页 |
2.2.5 酶解产物的LC-ESI-MS/MS分析 | 第27页 |
2.2.6 GO分析和KEGG分析 | 第27-28页 |
2.2.7 Quantitative Real-time PCR验证主要通路中的关键蛋白 | 第28页 |
2.2.8 数据分析 | 第28页 |
2.3 结果与分析 | 第28-34页 |
2.3.1 热胁迫对酸土脂环酸芽孢杆菌存活率和菌体形态的影响 | 第28-30页 |
2.3.2 LC-ESI-MS/MS分析热应激下的差异表达蛋白 | 第30页 |
2.3.3 热应激相关蛋白的生物信息学分析 | 第30-33页 |
2.3.4 差异表达蛋白的mRNA水平验证 | 第33-34页 |
2.4 讨论 | 第34-37页 |
2.5 结论 | 第37-39页 |
第三章 热应激关键蛋白互作网络预测与分析 | 第39-55页 |
3.1 引言 | 第39页 |
3.2 试验方法 | 第39-40页 |
3.2.1 热应激蛋白靶点信息的获取 | 第39-40页 |
3.2.2 热应激关键蛋白互作网络的构建 | 第40页 |
3.2.3 网络模块分析及GO注释 | 第40页 |
3.3 结果与分析 | 第40-50页 |
3.3.1 热应激关键蛋白靶点信息 | 第40-43页 |
3.3.2 热应激关键蛋白互作网络的构建 | 第43-44页 |
3.3.3 网络模块识别与分析 | 第44-50页 |
3.4 讨论 | 第50-54页 |
3.5 结论 | 第54-55页 |
第四章 热应激关键蛋白酵母双杂交cDNA文库的构建 | 第55-63页 |
4.1 引言 | 第55页 |
4.2 试验方法 | 第55-58页 |
4.2.1 热应激关键蛋白总RNA提取 | 第55-56页 |
4.2.2 mRNA的分离 | 第56页 |
4.2.3 双链cDNA的合成与纯化 | 第56-57页 |
4.2.4 酵母双杂交cDNA文库构建 | 第57页 |
4.2.5 文库库容和cDNA插入片段检测 | 第57-58页 |
4.3 结果分析 | 第58-60页 |
4.3.1 总RNA的提取 | 第58页 |
4.3.2 双链cDNA的合成与纯化 | 第58-59页 |
4.3.3 均一化酵母双杂交cDNA文库的构建及质量评价 | 第59-60页 |
4.4 讨论 | 第60-61页 |
4.5 结论 | 第61-63页 |
第五章 结论及创新点 | 第63-65页 |
5.1 主要结论 | 第63页 |
5.2 创新点 | 第63-65页 |
参考文献 | 第65-75页 |
致谢 | 第75-77页 |
攻读硕士期间取得的研究成果 | 第77页 |