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‘海沃德猕猴桃后熟期转录组测序及抗坏血酸降解分析

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第1章 文献综述第11-21页
    1.1 '海沃德'猕猴桃概述第11页
    1.2 AsA的生物学功能第11-13页
        1.2.1 AsA的抗氧化和逆境抗胁迫作用第12页
        1.2.2 AsA作为酶的辅助因子第12页
        1.2.3 AsA调节果实的生长发育第12-13页
    1.3 AsA的合成代谢途径第13-16页
        1.3.1 AsA的生物合成第13-14页
        1.3.2 AsA的氧化还原及降解过程第14-16页
    1.4 植物AsA生物氧化关键酶的研究进展第16-17页
        1.4.1 抗坏血酸氧化酶的研究第16-17页
        1.4.2 漆酶的研究第17页
    1.5 转录组研究概述第17-19页
        1.5.1 转录组及转录组测序(RNA-Seq)第17-18页
        1.5.2 RNA-Seq在果实发育、后熟期生理及贮藏品质研究中的应用第18-19页
    1.6 本研究的目的和意义及内容第19-21页
        1.6.1 本研究的目的意义第19页
        1.6.2 本研究的主要内容第19-21页
第2章 '海沃德'猕猴桃后熟期转录组测序分析第21-41页
    2.1 材料与方法第21-22页
        2.1.1 '海沃德'猕猴桃果实第21-22页
    2.2 狲猴桃RNA-Seq测序方法第22-25页
        2.2.1 cDNA文库构建和测序第22页
        2.2.2 转录组测序质量评估第22-23页
        2.2.3 参考基因组比对和新转录组预测第23-24页
        2.2.4 差异剪接基因和差异表达基因检测及SNP分析第24页
        2.2.5 差异表达基因层次聚类分析级GO和Pathway功能分析第24-25页
    2.3 结果与分析第25-32页
        2.3.1 Reads质量分析第25页
        2.3.2 RNA-Seq质量分析第25-27页
        2.3.3 不同时期转录本的SNP分析结果第27页
        2.3.4 参考基因组比对和新转录本预测结果第27-28页
        2.3.5 差异表达基因检测结果第28-32页
            2.3.5.1 差异表达的基因统计和GO功能分析第28-31页
            2.3.5.2 差异基因的pathway功能分析第31-32页
    2.4 '海沃德'果实后熟期五大激素通路的差异表达基因第32-39页
        2.4.1 '海沃德'果实后熟期ABA差异表达基因的分析第33-34页
        2.4.2 '海沃德'果实后熟期GB差异表达基因的分析第34-35页
        2.4.3 '海沃德'果实后熟期CK差异表达基因的分析第35-36页
        2.4.4 '海沃德'果实后熟期AUX差异表达基因的分析第36-37页
        2.4.5 '海沃德'果实后熟期ET差异表达基因的分析第37-39页
    2.5 小结第39-41页
第3章 '海沃德,猕猴桃后熟期AsA降解通路相关基因的表达及进化分析第41-55页
    3.1 材料与方法第41-42页
        3.1.1 转录组数据第41页
        3.1.2 AsA降解通路相关基因表达差异分析第41页
        3.1.3 AsA通路差异表达基因分析第41-42页
    3.2 结果与分析第42-52页
        3.2.1 '海沃德'后熟期AsA降解通路相关基因差异表达分析第42-49页
        3.2.2 AsA降解关键基因进化分析第49-52页
    3.3 讨论第52-53页
    3.4 小结第53-55页
第4章 '海沃德'猕猴桃后熟期AsA降解通路关键基因表达差异的验证第55-65页
    4.1 材料与设备第55-56页
        4.1.1 试验材料第55页
        4.1.2 试验试剂第55-56页
        4.1.3 试验设备与仪器第56页
    4.2 试验方法第56-58页
        4.2.1 '海沃德'猕猴桃果实后熟期总RNA的提取和cDNA的合成第56页
        4.2.2 定量引物设计与检测第56-57页
        4.2.3 荧光定量PCR检测第57-58页
        4.2.4 溶解曲线分析第58页
    4.3 结果与分析第58-62页
        4.3.1 '海沃德'猕猴桃后熟期RNA质量及浓度检测第58-59页
        4.3.2 候选基因的引物特异性第59-60页
        4.3.3 '海沃德'猕猴桃果实后熟期AsA降解候选基因表达差异第60-62页
    4.4 讨论第62-63页
        4.4.1 '海沃德'猕猴桃果实后熟期AO基因差异表达分析第62-63页
        4.4.2 '海沃德'猕猴桃果实后熟期Laccase基因差异表达分析第63页
    4.5 小结第63-65页
第5章 '海沃德'猕猴桃后熟期AsA含量及AO、Laccase酶活变化第65-73页
    5.1 材料与设备第65-66页
        5.1.1 试验材料第65页
        5.1.2 试验试剂第65页
        5.1.3 试验设备与仪器第65-66页
    5.2 试验方法第66-69页
        5.2.1 '海沃德'猕猴桃果实后熟期AsA含量测定第66-67页
        5.2.2 '海沃德'猕猴桃果实后熟期AO活性测定第67-68页
        5.2.3 '海沃德'猕猴桃果实后熟期Laccase活性测定第68-69页
    5.3 结果与分析第69-71页
        5.3.1 '海沃德'猕猴桃果实后熟期T-AsA、AsA和DHA含量变化第69页
        5.3.2 '海沃德'猕猴桃后熟期AO酶活性的变化第69-70页
        5.3.3 '海沃德'猕猴桃果实后熟期Laccase酶活性的变化第70-71页
    5.4 讨论第71-72页
    5.5 小结第72-73页
第6章 结论、创新点与展望第73-77页
    6.1 结论第73-74页
    6.2 创新点第74页
    6.3 展望第74-77页
参考文献第77-85页
致谢第85-87页
攻读硕士学位期间的研究成果第87页

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