| 中文摘要 | 第3-4页 |
| ABSTRACT | 第4-5页 |
| 缩略语 | 第9-11页 |
| 在线数据库及使用软件 | 第11-12页 |
| 1 引言 | 第12-22页 |
| 1.1 乳酸菌 | 第12页 |
| 1.1.1 乳酸菌及其分类 | 第12页 |
| 1.1.2 保加利亚乳杆菌 | 第12页 |
| 1.2 乳酸菌的应用及保健作用 | 第12-14页 |
| 1.2.1 乳酸菌在酸奶发酵中的应用 | 第12-13页 |
| 1.2.2 乳酸菌的益生保健作用 | 第13页 |
| 1.2.3 乳酸菌在发挥益生作用中所面临的胁迫 | 第13-14页 |
| 1.3 乳酸菌酸耐受机制的国内外研究进展 | 第14-19页 |
| 1.3.1 乳酸菌耐酸机制的国内外研究进展 | 第14-17页 |
| 1.3.2 保加利亚乳杆菌酸耐受机制的研究进展 | 第17-19页 |
| 1.4 基于全基因组学技术研究乳酸菌酸耐受机制 | 第19-20页 |
| 1.4.1 微生物基因组学 | 第19页 |
| 1.4.2 微生物的比较基因组学 | 第19-20页 |
| 1.5 本文研究目的及意义 | 第20-22页 |
| 2 实验材料与方法 | 第22-34页 |
| 2.1 实验材料 | 第22-24页 |
| 2.1.1 菌种来源 | 第22页 |
| 2.1.2 主要工具酶及试剂 | 第22-23页 |
| 2.1.3 主要培养基及溶液的配制 | 第23页 |
| 2.1.4 主要仪器与设备 | 第23-24页 |
| 2.2 方法 | 第24-34页 |
| 2.2.1 保加利亚乳杆菌的分离与鉴定 | 第24-26页 |
| 2.2.2 不同保加利亚乳杆菌的特性研究 | 第26-27页 |
| 2.2.3 Lactobacillus bulgaricus LJJ的全基因组测序 | 第27-30页 |
| 2.2.4 Lactobacillus bulgaricus LJJ和模式菌株ATCC11842的比较基因组学研究 | 第30-32页 |
| 2.2.5 Lactobacillus bulgaricus LJJ耐酸相关基因的统计分析验证 | 第32-34页 |
| 3 结果与分析 | 第34-62页 |
| 3.1 不同保加利亚乳杆菌的分离鉴定及发酵特性研究 | 第34-38页 |
| 3.1.1 不同保加利亚乳杆菌的分离及分子生物学鉴定 | 第34-35页 |
| 3.1.2 不同保加利亚乳杆菌生长曲线的测定 | 第35-36页 |
| 3.1.3 不同保加利亚乳杆菌的产酸特性研究 | 第36-37页 |
| 3.1.4 不同保加利亚乳杆菌发酵后酸化的测定 | 第37页 |
| 3.1.5 不同保加利亚乳杆菌的耐酸特性 | 第37-38页 |
| 3.2 Lactobacillus bulgaricus LJJ的全基因组测序 | 第38-44页 |
| 3.2.1 Lactobacillus bulgaricus LJJ基因组测序的基本信息 | 第38-39页 |
| 3.2.2 Lactobacillus bulgaricus LJJ基因组测序组装结果 | 第39页 |
| 3.2.3 Lactobacillus bulgaricus LJJ基因预测 | 第39-40页 |
| 3.2.4 基因功能注释 | 第40-42页 |
| 3.2.5 代谢通路分析 | 第42-43页 |
| 3.2.6 全基因组圈图的绘制 | 第43-44页 |
| 3.3 Lactobacillus bulgaricus LJJ和ATCC11842的比较基因组学分析及耐酸相关基因的挖掘 | 第44-50页 |
| 3.3.1 Lactobacillus bulgaricus LJJ与ATCC11842基因组序列及基本特征比较分析 | 第44-45页 |
| 3.3.2 L.bulgaricusLJJ和L.bulgaricusATCC11842基因的同源性比较分析 | 第45-46页 |
| 3.3.3 L.bulgaricusLJJ和ATCC11842基因组的共线性分析 | 第46-47页 |
| 3.3.4 L.bulgaricusLJJ与ATCC11842特有基因的GO注释比较分析 | 第47-48页 |
| 3.3.5 L.bulgaricusLJJ与ATCC11842的特有基因的COG分类比较分析 | 第48-49页 |
| 3.3.6 保加利亚乳杆菌LJJ酸耐受相关基因的初步筛选 | 第49-50页 |
| 3.4 应用统计学方法筛选验证相关耐酸基因验证 | 第50-62页 |
| 3.4.1 扩增相关耐耐酸基因的引物设计 | 第50-52页 |
| 3.4.2 耐酸相关基因的PCR扩增及测序 | 第52-54页 |
| 3.4.3 保加利亚乳杆菌耐酸基因的测序结果统计分析与耐酸关键基因筛选 | 第54-56页 |
| 3.4.4 耐酸关键基因的序列比对分析 | 第56-57页 |
| 3.4.5 保加利亚乳杆菌LJJ耐酸关键基因相关代谢调控分析 | 第57-62页 |
| 4 讨论 | 第62-64页 |
| 5 结论 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-70页 |
| 在学期间的研究成果 | 第70-72页 |
| 致谢 | 第72页 |
