| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 1 引言 | 第9-15页 |
| 1.1 米酒和米曲简介 | 第9-10页 |
| 1.2 微生物多样性 | 第10页 |
| 1.3 米酒中的微生物多样性 | 第10页 |
| 1.4 米曲微生物群落结构研究手段 | 第10-11页 |
| 1.5 第三代测序技术及其应用 | 第11-14页 |
| 1.5.1 SMRT技术 | 第11-12页 |
| 1.5.2 Oxford Nanopore纳米孔单分子技术 | 第12页 |
| 1.5.3 tSMS技术 | 第12-13页 |
| 1.5.4 第三代测序的应用 | 第13-14页 |
| 1.6 研究目的与意义 | 第14-15页 |
| 2 材料与方法 | 第15-20页 |
| 2.1 试验材料 | 第15页 |
| 2.1.1 样品来源 | 第15页 |
| 2.1.2 本研究采用的试剂盒及常用试剂 | 第15页 |
| 2.1.3 仪器设备 | 第15页 |
| 2.2 试验方法 | 第15-20页 |
| 2.2.1 日本米曲样品前处理 | 第15-16页 |
| 2.2.2 日本米曲中细菌宏基因组DNA的提取 | 第16页 |
| 2.2.3 细菌16S rRNA基因序列全长扩增 | 第16-17页 |
| 2.2.4 真菌ITS区间、18S rRNA基因序列全长扩增 | 第17页 |
| 2.2.5 PCR反应体系及反应条件 | 第17-18页 |
| 2.2.6 PacBio SMRT测序及序列分析 | 第18页 |
| 2.2.7 高质量序列的提取 | 第18-19页 |
| 2.2.8 测序结果的生物信息学处理 | 第19页 |
| 2.2.9 数据的统计分析及图表绘制 | 第19页 |
| 2.2.10 核酸序列登录号 | 第19-20页 |
| 3 结果分析及讨论 | 第20-32页 |
| 3.1 测序质量分析及样品测序量说明 | 第20-24页 |
| 3.2 日本米曲细菌菌群组成分析 | 第24-28页 |
| 3.2.1 日本米曲细菌菌群在门水平上的构成分析 | 第24-25页 |
| 3.2.2 日本米曲细菌菌群在属水平上的构成分析 | 第25-26页 |
| 3.2.3 日本米曲细菌菌群在种水平上的构成分析 | 第26-28页 |
| 3.3 日本米曲真菌菌群组成分析 | 第28-32页 |
| 3.3.1 日本米曲真菌菌群在门水平上的构成分析 | 第28-29页 |
| 3.3.2 日本米曲真菌菌落在属水平上的构成分析 | 第29页 |
| 3.3.3 日本米曲真菌菌落在种水平上的构成分析 | 第29-32页 |
| 4 结论 | 第32-33页 |
| 致谢 | 第33-34页 |
| 参考文献 | 第34-39页 |
| 作者简介 | 第39页 |