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基于DKP-LuxR的群体感应系统对Shewanella baltica腐败能力以及菌膜形成的调控研究

摘要第3-5页
ABSTRACT第5-6页
第一章 前言第10-17页
    1.1 海产品腐败第10-11页
        1.1.1 不同海产品的主要腐败微生物第10页
        1.1.2 海产品主要腐败代谢产物第10-11页
    1.2 细菌群体感应系统第11-15页
        1.2.1 群体感应分子互作机制第12-13页
        1.2.2 群体感应与食品腐败第13页
        1.2.3 群体感应与菌膜形成第13-15页
        1.2.4 群体感应淬灭第15页
    1.3 本课题研究的目的和意义第15-17页
        1.3.1 研究目的第15-16页
        1.3.2 研究意义第16-17页
第二章 特定腐败菌Shewanella baltica群体感应系统的确认第17-29页
    2.1 前言第17页
    2.2 实验材料第17-18页
        2.2.1 实验菌株及保藏第17页
        2.2.2 实验试剂第17-18页
        2.2.3 实验仪器第18页
    2.3 实验方法第18-23页
        2.3.1 菌株的活化及培养第18-19页
        2.3.2 群体感应自我诱导实验第19页
        2.3.3 总RNA提取和纯度测定第19-20页
        2.3.4 基因组DNA的去除以及cDNA的合成第20页
        2.3.5 qRT-PCR特异性引物合成第20-21页
        2.3.6 荧光定量PCR (qRT-PCR)第21页
        2.3.7 数据处理与分析第21-22页
        2.3.8 S.baltica 73以及大黄鱼中AHLs和DKPs的提取第22页
        2.3.9 AHLs和DKPs标准溶液的配制第22页
        2.3.10 UPLC-MS/MS检测AHLs和DKPs第22-23页
    2.4 结果与讨论第23-27页
        2.4.1 S.baltica 73自培养对数末期提取物对luxR-type基因表达的影响第23-24页
        2.4.2 S. baltica 73以及腐败大黄鱼中AHLs和DKPs的定性定量检测第24-27页
    2.5 本章小结第27-29页
第三章 LuxR家族受体蛋白与AHLs和DKPs的特异性识别以及其对致腐能力和菌膜形成的调控第29-56页
    3.1 前言第29页
    3.2 实验材料第29-32页
        3.2.1 实验菌株及质粒第29-30页
        3.2.2 实验试剂第30-31页
        3.2.3 实验仪器第31-32页
    3.3 实验方法第32-45页
        3.3.1 菌株的活化及培养第32页
        3.3.2 总RNA提取和纯度测定第32页
        3.3.3 基因组DNA的去除以及cDNA的合成第32页
        3.3.4 特异性引物合成第32-34页
        3.3.5 细菌基因组DNA的提取第34-35页
        3.3.6 高保真PCR扩增第35-36页
        3.3.7 目的蛋白表达与分离纯化第36-41页
        3.3.8 LuxR家族蛋白与AHLs和DKPs的体外结合实验第41-42页
        3.3.9 UPLC-MS/MS检测LuxR家族蛋白结合的AHLs和DKPs第42页
        3.3.10 luxR家族基因以及菌膜相关基因bfp缺失株构建第42-43页
        3.3.11 三甲胺(TMA)测定第43-44页
        3.3.12 生物胺(腐胺)测定第44页
        3.3.13 菌膜测定第44-45页
    3.4 结果与讨论第45-54页
        3.4.1 LuxR家族蛋白表达与分离纯化第45-47页
        3.4.2 LuxR家族蛋白与AHLs和DKPs的特异性识别第47-49页
        3.4.3 luxR家族基因以及菌膜相关基因bfp缺失株构建第49-51页
        3.4.4 S. baltica 73各基因缺失株与野生株腐败能力比较第51-52页
        3.4.5 S.baltica 73各基因缺失株与野生株菌膜形成能力比较第52-54页
    3.5 本章小结第54-56页
第四章 S. baltica 73中DKP-LuxR型QS系统调控其致腐能力及菌膜形成的通路挖掘第56-67页
    4.1 前言第56页
    4.2 实验材料第56-57页
        4.2.1 实验菌株及保藏第56页
        4.2.2 实验试剂第56-57页
        4.2.3 实验仪器第57页
    4.3 实验方法第57-60页
        4.3.1 菌株的活化及培养第57-58页
        4.3.2 总RNA提取和纯度测定第58页
        4.3.3 原核链特异性转录组分析第58-59页
        4.3.4 荧光定量PCR特异性引物合成第59页
        4.3.5 荧光定量PCR(qRT-PCR)第59页
        4.3.6 数据处理与分析第59-60页
        4.3.7 外源添加cyclo- (L-Pro-L-Phe)后三甲胺、腐胺及菌膜测定第60页
    4.4 结果与讨论第60-66页
        4.4.1 原核链特异性转录组分析第60-62页
        4.4.2 荧光定量PCR验证第62-64页
        4.4.3 外源cyclo-(L-Pro-L-Phe)对S.baltica 73野生株与缺失株SB7301和SB7302腐败能力的影响第64-65页
        4.4.4 外源cyclo-(L-Pro-L-Phe)对S.baltica 73野生株与缺失株SB7301和SB7302菌膜形成的影响第65-66页
    4.5 本章小结第66-67页
第五章 结论、创新点及展望第67-69页
    5.1 结论第67-68页
    5.2 创新点第68页
    5.3 展望第68-69页
参考文献第69-75页
致谢第75-76页

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