不同地区自然发酵食品中发酵乳杆菌的多位点序列分型研究
摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4-5页 |
1 引言 | 第9-15页 |
1.1 乳酸菌的简介 | 第9页 |
1.2 乳杆菌属 | 第9页 |
1.3 发酵乳杆菌 | 第9-10页 |
1.3.1 发酵乳杆菌的概述 | 第9-10页 |
1.3.2 发酵乳杆菌的研究进展 | 第10页 |
1.4 多位点序列分型技术及其应用 | 第10-14页 |
1.4.1 多位点序列分型(MLST) | 第10-11页 |
1.4.2 MLST技术在流行病学中的应用 | 第11-12页 |
1.4.3 MLST技术在乳酸菌分型中的应用 | 第12-14页 |
1.5 立题意义与研究内容 | 第14-15页 |
2 材料与方法 | 第15-27页 |
2.1 试验材料 | 第15-23页 |
2.1.1 菌株来源 | 第15-22页 |
2.1.2 主要试剂 | 第22页 |
2.1.3 主要仪器与设备 | 第22-23页 |
2.1.4 数据处理软件 | 第23页 |
2.2 试验方法 | 第23-27页 |
2.2.1 菌株活化与培养 | 第23-24页 |
2.2.2 试验菌株DNA提取 | 第24页 |
2.2.3 看家基因的选择 | 第24页 |
2.2.4 看家基因的引物设计 | 第24-25页 |
2.2.5 扩增体系及扩增条件 | 第25-26页 |
2.2.6 PCR产物检测 | 第26页 |
2.2.7 发酵乳杆菌分离株MLST数据分析 | 第26-27页 |
3 结果分析与讨论 | 第27-45页 |
3.1 菌体DNA检测结果 | 第27页 |
3.2 看家基因扩增结果 | 第27-28页 |
3.3 生物信息学分析结果 | 第28-45页 |
3.3.1 MLST分型结果 | 第28-35页 |
3.3.2 eBURST分析结果 | 第35-37页 |
3.3.3 等位基因多样性分析 | 第37-38页 |
3.3.4 等位基因序列重组分析 | 第38-40页 |
3.3.5 发酵乳杆菌种群结构分析 | 第40-42页 |
3.3.6 最小生成树分析 | 第42-45页 |
4 结论 | 第45-46页 |
致谢 | 第46-47页 |
参考文献 | 第47-53页 |
作者简介 | 第53页 |