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产EPA/DHA北极细菌的筛选及其聚酮合酶途径的研究

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
英文缩略表第14-15页
第一章 文献综述第15-27页
    1.1 引言第15页
    1.2 ω-3 VLC-PUFAS简介第15-17页
        1.2.1 ω-3 VLC-PUFAs的结构功能及应用第15-16页
        1.2.2 ω-3 VLC-PUFAs的资源分布与开发第16-17页
    1.3 ω-3 VLC-PUFAS的生物合成途径第17-23页
        1.3.1 脂肪酸的初始合成第17-19页
        1.3.2 延长/去饱和途径第19-21页
        1.3.3 聚酮合酶途径第21-23页
    1.4 极地海洋微生物与ω-3 VLC-PUFAS第23页
    1.5 聚酮酶途径合成ω-3 VLC-PUFAS的研究进展第23-25页
        1.5.1 含有PKS途径的海洋微生物及其分类第23-24页
        1.5.2 工程菌株产ω-3 VLC-PUFAs的研究现状第24-25页
    1.6 研究意义与内容第25-27页
第二章 北极来源产EPA细菌的筛选与鉴定第27-38页
    2.1 引言第27页
    2.2 实验仪器和材料第27-29页
        2.2.1 仪器设备第27页
        2.2.2 菌株与载体第27-28页
        2.2.3 试剂与耗材第28页
        2.2.4 培养基及溶液第28页
        2.2.5 引物序列第28-29页
    2.3 方法和步骤第29-31页
        2.3.1 北极细菌的培养第29页
        2.3.2 TTC显色第29页
        2.3.3 脂肪酸组分测定第29-30页
        2.3.4 产EPA北极细菌的鉴定第30-31页
        2.3.5 不同培养条件对S.baltica 6-42合成EPA的影响第31页
    2.4 结果与分析第31-36页
        2.4.1 产EPA菌株筛选第31-33页
        2.4.2 产EPA菌株的 16S rDNA鉴定第33页
        2.4.3 温度对S.baltica 6-42合成EPA的影响第33-34页
        2.4.4 浅蓝菌素对S.baltica 6-42合成EPA的影响第34-36页
    2.5 讨论第36-38页
第三章 S.baltica 6-42全基因组测序及比较基因组分析第38-50页
    3.1 引言第38页
    3.2 实验仪器和材料第38页
        3.2.1 菌株第38页
        3.2.2 培养基与溶液第38页
    3.3 方法与步骤第38-40页
        3.3.1 S.baltica 6-42的培养与收集第38页
        3.3.2 S.baltica 6-42基因组DNA的提取第38-39页
        3.3.3 运用第三代测序技术对S.baltica 6-42进行全基因组高通量测序第39页
        3.3.4 S.baltica 6-42基因组初步分析第39-40页
        3.3.5 S.baltica 6-42基因组高级分析第40页
    3.4 结果与分析第40-49页
        3.4.1 S.baltica 6-42基因组原始数据质量分析第40-41页
        3.4.2 S.baltica 6-42基因组拼接与组分分析第41-42页
        3.4.3 S.baltica 6-42编码基因功能注释第42-46页
        3.4.4 S.baltica 6-42全基因图谱第46-47页
        3.4.5 共线性分析第47页
        3.4.6 PKS相关基因遗传进化分析第47-49页
    3.5 讨论第49-50页
第四章 Colwellia psychrerythraea 34H合成DHA关键基因的克隆和功能验证第50-58页
    4.1 引言第50页
    4.2 实验仪器和材料第50-51页
        4.2.1 菌株与载体第50-51页
        4.2.2 试剂与耗材第51页
        4.2.3 培养基及溶液第51页
        4.2.4 引物序列第51页
    4.3 方法与步骤第51-54页
        4.3.1 合成DHA相关PKS基因的查找与分析第51-52页
        4.3.2 C. psychrerythraea 34H的培养和收集第52页
        4.3.3 合成DHA相关PKS基因的克隆第52-53页
        4.3.4 重组菌株的构建第53页
        4.3.5 含PKS基因重组菌株的培养第53-54页
        4.3.6 脂肪酸组分测定第54页
    4.4 结果与分析第54-57页
        4.4.1 合成DHA相关PKS基因簇的鉴定第54-55页
        4.4.2 PKS基因簇的克隆第55页
        4.4.3 功能验证第55-56页
        4.4.4 不同宿主菌对PKS基因簇合成DHA的影响第56-57页
    4.5 讨论第57-58页
第五章 不同来源pfaE对DHA合成量及脂肪酸谱的影响第58-70页
    5.1 引言第58页
    5.2 实验仪器和材料第58-59页
        5.2.1 仪器设备第58页
        5.2.2 菌株与质粒第58页
        5.2.3 试剂与耗材第58-59页
        5.2.4 引物序列第59页
    5.3 方法与步骤第59-61页
        5.3.1 不同来源pfaE的获取第59页
        5.3.2 不同来源pfaE的克隆第59-60页
        5.3.3 重组菌株的构建第60页
        5.3.4 PKS 基因簇在大肠杆菌 DH5α中异源表达第60页
        5.3.5 荧光定量分析不同重组菌株中五个pfa基因的转录水平第60页
        5.3.6 不同培养条件对重组菌株合成DHA的影响第60-61页
        5.3.7 脂肪酸组分测定第61页
    5.4 结果与分析第61-67页
        5.4.1 不同来源pfaE的查找与分析第61-62页
        5.4.2 含PKS重组菌株的构建第62页
        5.4.3 不同来源的pfaE与C. psychrerythraea34H的pfaABCD共表达第62-63页
        5.4.4 不同重组菌株中五个pfa基因的转录水平第63-64页
        5.4.5 温度对重组菌株合成DHA的影响第64-66页
        5.4.6 浅蓝菌素对重组菌株合成EPA的影响第66-67页
    5.5 讨论第67-70页
第六章 全文总结及创新点第70-72页
    6.1 全文总结第70-71页
    6.2 创新点第71-72页
参考文献第72-77页
附录第77-78页
致谢第78-79页
作者简介第79页

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