摘要 | 第6-8页 |
Abstract | 第8-9页 |
英文缩略表 | 第14-15页 |
第一章 文献综述 | 第15-27页 |
1.1 引言 | 第15页 |
1.2 ω-3 VLC-PUFAS简介 | 第15-17页 |
1.2.1 ω-3 VLC-PUFAs的结构功能及应用 | 第15-16页 |
1.2.2 ω-3 VLC-PUFAs的资源分布与开发 | 第16-17页 |
1.3 ω-3 VLC-PUFAS的生物合成途径 | 第17-23页 |
1.3.1 脂肪酸的初始合成 | 第17-19页 |
1.3.2 延长/去饱和途径 | 第19-21页 |
1.3.3 聚酮合酶途径 | 第21-23页 |
1.4 极地海洋微生物与ω-3 VLC-PUFAS | 第23页 |
1.5 聚酮酶途径合成ω-3 VLC-PUFAS的研究进展 | 第23-25页 |
1.5.1 含有PKS途径的海洋微生物及其分类 | 第23-24页 |
1.5.2 工程菌株产ω-3 VLC-PUFAs的研究现状 | 第24-25页 |
1.6 研究意义与内容 | 第25-27页 |
第二章 北极来源产EPA细菌的筛选与鉴定 | 第27-38页 |
2.1 引言 | 第27页 |
2.2 实验仪器和材料 | 第27-29页 |
2.2.1 仪器设备 | 第27页 |
2.2.2 菌株与载体 | 第27-28页 |
2.2.3 试剂与耗材 | 第28页 |
2.2.4 培养基及溶液 | 第28页 |
2.2.5 引物序列 | 第28-29页 |
2.3 方法和步骤 | 第29-31页 |
2.3.1 北极细菌的培养 | 第29页 |
2.3.2 TTC显色 | 第29页 |
2.3.3 脂肪酸组分测定 | 第29-30页 |
2.3.4 产EPA北极细菌的鉴定 | 第30-31页 |
2.3.5 不同培养条件对S.baltica 6-42合成EPA的影响 | 第31页 |
2.4 结果与分析 | 第31-36页 |
2.4.1 产EPA菌株筛选 | 第31-33页 |
2.4.2 产EPA菌株的 16S rDNA鉴定 | 第33页 |
2.4.3 温度对S.baltica 6-42合成EPA的影响 | 第33-34页 |
2.4.4 浅蓝菌素对S.baltica 6-42合成EPA的影响 | 第34-36页 |
2.5 讨论 | 第36-38页 |
第三章 S.baltica 6-42全基因组测序及比较基因组分析 | 第38-50页 |
3.1 引言 | 第38页 |
3.2 实验仪器和材料 | 第38页 |
3.2.1 菌株 | 第38页 |
3.2.2 培养基与溶液 | 第38页 |
3.3 方法与步骤 | 第38-40页 |
3.3.1 S.baltica 6-42的培养与收集 | 第38页 |
3.3.2 S.baltica 6-42基因组DNA的提取 | 第38-39页 |
3.3.3 运用第三代测序技术对S.baltica 6-42进行全基因组高通量测序 | 第39页 |
3.3.4 S.baltica 6-42基因组初步分析 | 第39-40页 |
3.3.5 S.baltica 6-42基因组高级分析 | 第40页 |
3.4 结果与分析 | 第40-49页 |
3.4.1 S.baltica 6-42基因组原始数据质量分析 | 第40-41页 |
3.4.2 S.baltica 6-42基因组拼接与组分分析 | 第41-42页 |
3.4.3 S.baltica 6-42编码基因功能注释 | 第42-46页 |
3.4.4 S.baltica 6-42全基因图谱 | 第46-47页 |
3.4.5 共线性分析 | 第47页 |
3.4.6 PKS相关基因遗传进化分析 | 第47-49页 |
3.5 讨论 | 第49-50页 |
第四章 Colwellia psychrerythraea 34H合成DHA关键基因的克隆和功能验证 | 第50-58页 |
4.1 引言 | 第50页 |
4.2 实验仪器和材料 | 第50-51页 |
4.2.1 菌株与载体 | 第50-51页 |
4.2.2 试剂与耗材 | 第51页 |
4.2.3 培养基及溶液 | 第51页 |
4.2.4 引物序列 | 第51页 |
4.3 方法与步骤 | 第51-54页 |
4.3.1 合成DHA相关PKS基因的查找与分析 | 第51-52页 |
4.3.2 C. psychrerythraea 34H的培养和收集 | 第52页 |
4.3.3 合成DHA相关PKS基因的克隆 | 第52-53页 |
4.3.4 重组菌株的构建 | 第53页 |
4.3.5 含PKS基因重组菌株的培养 | 第53-54页 |
4.3.6 脂肪酸组分测定 | 第54页 |
4.4 结果与分析 | 第54-57页 |
4.4.1 合成DHA相关PKS基因簇的鉴定 | 第54-55页 |
4.4.2 PKS基因簇的克隆 | 第55页 |
4.4.3 功能验证 | 第55-56页 |
4.4.4 不同宿主菌对PKS基因簇合成DHA的影响 | 第56-57页 |
4.5 讨论 | 第57-58页 |
第五章 不同来源pfaE对DHA合成量及脂肪酸谱的影响 | 第58-70页 |
5.1 引言 | 第58页 |
5.2 实验仪器和材料 | 第58-59页 |
5.2.1 仪器设备 | 第58页 |
5.2.2 菌株与质粒 | 第58页 |
5.2.3 试剂与耗材 | 第58-59页 |
5.2.4 引物序列 | 第59页 |
5.3 方法与步骤 | 第59-61页 |
5.3.1 不同来源pfaE的获取 | 第59页 |
5.3.2 不同来源pfaE的克隆 | 第59-60页 |
5.3.3 重组菌株的构建 | 第60页 |
5.3.4 PKS 基因簇在大肠杆菌 DH5α中异源表达 | 第60页 |
5.3.5 荧光定量分析不同重组菌株中五个pfa基因的转录水平 | 第60页 |
5.3.6 不同培养条件对重组菌株合成DHA的影响 | 第60-61页 |
5.3.7 脂肪酸组分测定 | 第61页 |
5.4 结果与分析 | 第61-67页 |
5.4.1 不同来源pfaE的查找与分析 | 第61-62页 |
5.4.2 含PKS重组菌株的构建 | 第62页 |
5.4.3 不同来源的pfaE与C. psychrerythraea34H的pfaABCD共表达 | 第62-63页 |
5.4.4 不同重组菌株中五个pfa基因的转录水平 | 第63-64页 |
5.4.5 温度对重组菌株合成DHA的影响 | 第64-66页 |
5.4.6 浅蓝菌素对重组菌株合成EPA的影响 | 第66-67页 |
5.5 讨论 | 第67-70页 |
第六章 全文总结及创新点 | 第70-72页 |
6.1 全文总结 | 第70-71页 |
6.2 创新点 | 第71-72页 |
参考文献 | 第72-77页 |
附录 | 第77-78页 |
致谢 | 第78-79页 |
作者简介 | 第79页 |