| 摘要 | 第11-13页 |
| ABSTRACT | 第13-15页 |
| 第一章 前言 | 第16-32页 |
| 1.1 传统发酵蔬菜与乳酸菌 | 第16-20页 |
| 1.2 乳酸菌多样性分析 | 第20-24页 |
| 1.2.1 DNA的指纹图谱技术 | 第21-22页 |
| 1.2.2 核酸的G+C%含量计算法(G+C%content) | 第22-23页 |
| 1.2.3 核酸杂交技术 | 第23-24页 |
| 1.3 乳酸菌菌种的鉴定分析 | 第24-26页 |
| 1.4 宏基因组学的应用 | 第26-28页 |
| 1.5 焦磷酸测序技术应用 | 第28-29页 |
| 1.6 试验背景和意义 | 第29-31页 |
| 1.7 试验研究内容 | 第31-32页 |
| 第二章 自然发酵酸菜中乳酸菌菌群结构随时间变化的规律 | 第32-63页 |
| 2.1 实验材料与仪器 | 第33-35页 |
| 2.1.1 材料与处理 | 第33页 |
| 2.1.2 仪器及设备 | 第33页 |
| 2.1.3 实验试剂 | 第33-35页 |
| 2.2 试验方法 | 第35-45页 |
| 2.2.1 细菌总数和乳酸菌数的动态变化 | 第35页 |
| 2.2.2 pH值的动态变化 | 第35页 |
| 2.2.3 样品中总酸的动态变化 | 第35-36页 |
| 2.2.4 亚硝酸盐含量的动态变化 | 第36-37页 |
| 2.2.5 可溶性蛋白含量的动态变化 | 第37-39页 |
| 2.2.6 还原糖含量的的动态变化 | 第39-40页 |
| 2.2.7 氨基酸态氮含量的动态变化 | 第40-41页 |
| 2.2.8 样品总DNA的提取 | 第41页 |
| 2.2.9 PCR扩增 | 第41-42页 |
| 2.2.10 变性梯度凝胶电泳(DGGE)与条带测序 | 第42-43页 |
| 2.2.11 克隆 | 第43-45页 |
| 2.3 结果与分析 | 第45-59页 |
| 2.3.1 细菌总数的时间变化规律 | 第45-46页 |
| 2.3.2 乳酸菌数量的时间变化规律 | 第46页 |
| 2.3.3 pH值的时间变化规律 | 第46-47页 |
| 2.3.4 总酸含量的时间变化规律 | 第47-48页 |
| 2.3.5 亚硝酸盐含量的时间变化规律 | 第48-50页 |
| 2.3.6 可溶性蛋白含量的时间变化规律 | 第50-51页 |
| 2.3.7 还原糖含量的时间变化规律 | 第51-52页 |
| 2.3.8 氨基酸态氮含量的时间变化规律 | 第52页 |
| 2.3.9 16S rDNA的V3区的PCR扩增结果 | 第52-53页 |
| 2.3.10 DGGE图谱分析 | 第53-55页 |
| 2.3.11 菌群多样性指数分析 | 第55-56页 |
| 2.3.12 DGGE指纹图谱聚类分析 | 第56页 |
| 2.3.13 DGGE条带测序结果分析 | 第56-59页 |
| 2.4 讨论 | 第59-61页 |
| 2.5 本章小结 | 第61-63页 |
| 第三章 东北地区自然发酵酸菜中细菌群落结构随空间变化的规律 | 第63-93页 |
| 3.1 实验材料与仪器 | 第64-67页 |
| 3.1.1 实验材料与处理 | 第64-66页 |
| 3.1.2 实验主要仪器 | 第66页 |
| 3.1.3 主要实验试剂 | 第66-67页 |
| 3.2 试验方法 | 第67-69页 |
| 3.2.1 乳酸菌活菌数的测定 | 第67页 |
| 3.2.2 pH值的测定 | 第67-68页 |
| 3.2.3 DNA的提取纯化和细菌16S rDNA V3-V4区的扩增 | 第68页 |
| 3.2.4 宏基因组测序流程 | 第68-69页 |
| 3.3 序列生物信息学分析 | 第69页 |
| 3.4 结果与分析 | 第69-90页 |
| 3.4.1 乳酸菌数量、pH值与样品纬度之间的关系 | 第69-71页 |
| 3.4.2 优质序列的统计分析 | 第71-73页 |
| 3.4.3 物种丰度分析 | 第73-79页 |
| 3.4.4 热图分析 | 第79-82页 |
| 3.4.5 物种群落结构图 | 第82-83页 |
| 3.4.6 基于群落结构的分析 | 第83-87页 |
| 3.4.7 功能基因KEGG统计 | 第87-90页 |
| 3.5 讨论 | 第90-91页 |
| 3.6 本章小结 | 第91-93页 |
| 第四章 研究创新点、总结与展望 | 第93-97页 |
| 4.1 研究创新点 | 第93页 |
| 4.2 总结 | 第93-94页 |
| 4.3 展望 | 第94-97页 |
| 参考文献 | 第97-107页 |
| 致谢 | 第107-109页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第109-110页 |
