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东北地区自然发酵酸菜中乳酸菌时空分布规律的研究

摘要第11-13页
ABSTRACT第13-15页
第一章 前言第16-32页
    1.1 传统发酵蔬菜与乳酸菌第16-20页
    1.2 乳酸菌多样性分析第20-24页
        1.2.1 DNA的指纹图谱技术第21-22页
        1.2.2 核酸的G+C%含量计算法(G+C%content)第22-23页
        1.2.3 核酸杂交技术第23-24页
    1.3 乳酸菌菌种的鉴定分析第24-26页
    1.4 宏基因组学的应用第26-28页
    1.5 焦磷酸测序技术应用第28-29页
    1.6 试验背景和意义第29-31页
    1.7 试验研究内容第31-32页
第二章 自然发酵酸菜中乳酸菌菌群结构随时间变化的规律第32-63页
    2.1 实验材料与仪器第33-35页
        2.1.1 材料与处理第33页
        2.1.2 仪器及设备第33页
        2.1.3 实验试剂第33-35页
    2.2 试验方法第35-45页
        2.2.1 细菌总数和乳酸菌数的动态变化第35页
        2.2.2 pH值的动态变化第35页
        2.2.3 样品中总酸的动态变化第35-36页
        2.2.4 亚硝酸盐含量的动态变化第36-37页
        2.2.5 可溶性蛋白含量的动态变化第37-39页
        2.2.6 还原糖含量的的动态变化第39-40页
        2.2.7 氨基酸态氮含量的动态变化第40-41页
        2.2.8 样品总DNA的提取第41页
        2.2.9 PCR扩增第41-42页
        2.2.10 变性梯度凝胶电泳(DGGE)与条带测序第42-43页
        2.2.11 克隆第43-45页
    2.3 结果与分析第45-59页
        2.3.1 细菌总数的时间变化规律第45-46页
        2.3.2 乳酸菌数量的时间变化规律第46页
        2.3.3 pH值的时间变化规律第46-47页
        2.3.4 总酸含量的时间变化规律第47-48页
        2.3.5 亚硝酸盐含量的时间变化规律第48-50页
        2.3.6 可溶性蛋白含量的时间变化规律第50-51页
        2.3.7 还原糖含量的时间变化规律第51-52页
        2.3.8 氨基酸态氮含量的时间变化规律第52页
        2.3.9 16S rDNA的V3区的PCR扩增结果第52-53页
        2.3.10 DGGE图谱分析第53-55页
        2.3.11 菌群多样性指数分析第55-56页
        2.3.12 DGGE指纹图谱聚类分析第56页
        2.3.13 DGGE条带测序结果分析第56-59页
    2.4 讨论第59-61页
    2.5 本章小结第61-63页
第三章 东北地区自然发酵酸菜中细菌群落结构随空间变化的规律第63-93页
    3.1 实验材料与仪器第64-67页
        3.1.1 实验材料与处理第64-66页
        3.1.2 实验主要仪器第66页
        3.1.3 主要实验试剂第66-67页
    3.2 试验方法第67-69页
        3.2.1 乳酸菌活菌数的测定第67页
        3.2.2 pH值的测定第67-68页
        3.2.3 DNA的提取纯化和细菌16S rDNA V3-V4区的扩增第68页
        3.2.4 宏基因组测序流程第68-69页
    3.3 序列生物信息学分析第69页
    3.4 结果与分析第69-90页
        3.4.1 乳酸菌数量、pH值与样品纬度之间的关系第69-71页
        3.4.2 优质序列的统计分析第71-73页
        3.4.3 物种丰度分析第73-79页
        3.4.4 热图分析第79-82页
        3.4.5 物种群落结构图第82-83页
        3.4.6 基于群落结构的分析第83-87页
        3.4.7 功能基因KEGG统计第87-90页
    3.5 讨论第90-91页
    3.6 本章小结第91-93页
第四章 研究创新点、总结与展望第93-97页
    4.1 研究创新点第93页
    4.2 总结第93-94页
    4.3 展望第94-97页
参考文献第97-107页
致谢第107-109页
攻读学位期间发表的学术论文目录第109-110页

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