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Rhodothermus marinus源UDP-木糖合成通路相关酶的重组表达、酶学特性及应用研究

摘要第8-11页
ABSTRACT第11-13页
缩写符号第14-16页
第一章 文献综述第16-30页
    1 生命体中的糖类物质简介第16-18页
        1.1 糖类物质的性质及分类第16-17页
        1.2 糖类物质在生命体系中的基本功能第17-18页
    2 生物体内糖链的合成机制的研究与应用第18-19页
    3 糖核苷酸的生物功能及其合成机制第19-20页
        3.1 糖核苷酸的种类与功能第19-20页
        3.2 糖核苷酸的生物合成途径第20页
    4 木糖(Xyl)与UDP-木糖(UDP-Xyl)第20-22页
        4.1 木糖(Xyl)的生物学功能第20-21页
        4.2 UDP-木糖(UDP-Xyl)的生物合成途径与功能第21-22页
            4.2.1 UDP-GlcA的生物合成与功能第21-22页
            4.2.2 UDP-Xyl的生物合成与功能第22页
    5 UDP-葡萄糖脱氢酶(UGD)和UDP-葡萄糖醛酸脱羧酶(UXS)第22-27页
        5.1 UGD的生化功能与研究进展第22-24页
        5.2 UXS的生化功能与研究进展第24-26页
        5.3 酶法合成UDP-GlcA、UDP-Xyl及其寡糖化合物的研究进展第26-27页
    6 嗜热菌Rhodothermus marinus及相关研究简介第27-28页
    7 本文立项依据与研究内容第28-30页
第二章 RmUGD1、RmUGD2与RmUXS的克隆表达与序列分析第30-48页
    1 材料与方法第30-38页
        1.1 材料第30-31页
            1.1.1 菌种第30页
            1.1.2 主要试剂第30-31页
            1.1.3 培养基第31页
            1.1.4 主要仪器设备第31页
        1.2 方法第31-38页
            1.2.1 细菌基因组DNA的提取第31-32页
            1.2.2 PCR引物第32页
            1.2.3 PCR反应体系与程序第32页
            1.2.4 PCR产物回收与纯化第32-33页
            1.2.5 DNA产物与PGH测序载体的连接第33-34页
            1.2.6 连接产物的转化第34-35页
            1.2.7 重组质粒的提取与外源DNA插入片段的检测第35-36页
            1.2.8 重组质粒的测序验证第36页
            1.2.9 DNA酶切第36页
            1.2.10 酶切后的DNA片段和pET-30a质粒的回收与纯化第36页
            1.2.11 DNA连接第36-37页
            1.2.12 重组表达质粒的转化第37页
            1.2.13 重组表达质粒的再测序第37-38页
            1.2.14 蛋白质序列结构与进化关系的生物信息学预测分析第38页
    2 结果与分析第38-47页
        2.1 RmUGD1、RmUGD2和RmUXS的PCR扩增与表达载体构建第38-40页
        2.2 RmUGD1、RmUGD2和RmUXS的序列同源比对和结构分析第40-47页
    3 本章小结第47-48页
第三章 RmUGD1、RmUGD2和RmUXS的原核重组表达及其重组酶活性的检测第48-64页
    1 材料与方法第48-55页
        1.1 材料第48-49页
            1.1.1 菌种第48页
            1.1.2 试剂第48页
            1.1.3 培养基第48-49页
            1.1.4 主要仪器设备第49页
        1.2 方法第49-55页
            1.2.1 质粒的提取第49页
            1.2.2 质粒的转化第49-50页
            1.2.3 重组蛋白质的体外表达与纯化第50-51页
            1.2.4 重组蛋白质的SDS-PAGE电泳检测第51-52页
            1.2.5 蛋白酶纯化后的脱盐处理和冻干第52页
            1.2.6 酶活测试的反应体系第52-53页
            1.2.7 酶反应产物的UPLC检测分析第53页
            1.2.8 RmUXS反应过程的原位核磁共振(in situ NMR)检测分析第53-54页
            1.2.9 RmUXS酶反应产物的MALDI-TOF质谱分析第54页
            1.2.10 Bradford法蛋白定量试验第54-55页
    2 结果与分析第55-62页
        2.1 RmUGD1和RmUGD2的体外表达与纯化第55-56页
        2.2 UPLC方法验证RmUGD1和RmUGD2的酶活性第56页
        2.3 RmUXS的体外表达与纯化第56-57页
        2.4 UPLC方法验证RmUXS的酶活性第57-58页
        2.5 原位核磁共振(in situ NMR)对RmUXS反应过程的实时检测第58-60页
        2.6 MALDI-TOF质谱测定RmUXS反应产物UDP-Xy1第60-61页
        2.7 RmUGD1和RmUXS的蛋白质定量第61-62页
    3 讨论第62-63页
    4 本章小结第63-64页
第四章 原核重组表达RmUGD1和RmUXS的酶生化特性测定第64-78页
    1 材料与方法第64-67页
        1.1 材料第64-65页
            1.1.1 试剂第64页
            1.1.2 主要仪器设备第64-65页
        1.2 方法第65-67页
            1.2.1 最适酶反应pH的测定第65页
            1.2.2 最适酶反应温度的测定第65-66页
            1.2.3 金属离子对酶活性的影响测定第66页
            1.2.4 UDP-Xy1对RmUGD1的抑制效果测定第66页
            1.2.5 酶的耐盐性测定第66页
            1.2.6 其他相关因子对酶活性的影响测定第66页
            1.2.7 酶的热稳定性测定第66页
            1.2.8 酶的Km、最大反应速度与酶活力等反应参数的测定第66-67页
            1.2.9 酶反应产物的UPLC分析第67页
    2 结果与分析第67-74页
        2.1 酶最适反应pH的测定第67-68页
        2.2 最适反应温度的测定第68-69页
        2.3 金属离子对酶活性的影响第69-70页
        2.4 UDP-Xy1对RmUGD1的抑制效果测定第70-71页
        2.5 酶的耐盐性的测定第71-72页
        2.6 辅酶和底物类似物等对酶活的影响第72页
        2.7 酶的热稳定性研究第72-73页
        2.8 酶的Km值、最大反应速率与酶活力等第73-74页
    3 讨论第74-77页
    4 本章小结第77-78页
第五章 一釜法合成(one pot synthesis) UDP-Xy1第78-88页
    1 材料与方法第78-81页
        1.1 材料第78页
            1.1.1 试剂第78页
            1.1.2 主要仪器设备第78页
        1.2 方法第78-81页
            1.2.1 一釜法以UDP-Glc合成UDP-Xy1的预试验检测第78-79页
            1.2.2 一釜法体系中RmUGD1与RmUXS间最佳用量比的测定第79页
            1.2.3 一釜法反应的最适pH值的测定第79页
            1.2.4 一釜法反应的最适温度的测定第79页
            1.2.5 一釜法合成体系的正交试验优化第79-80页
            1.2.6 酶反应产物的UPLC分析第80-81页
    2 结果与分析第81-85页
        2.1 一釜法合成UDP-Xy1的预试验检测第81-82页
        2.2 一釜法反应中RmUGD1和RmUXS的最佳用量比测定第82-83页
        2.3 一釜法反应的最适pH值的测定第83页
        2.4 一釜法反应的最适温度的测定第83-84页
        2.5 一釜法反应体系的正交试验优化第84-85页
    3 讨论第85-86页
    4 本章小结第86-88页
全文结论第88-90页
论文创新点第90-92页
参考文献第92-102页
攻读博士期间发表论文情况第102-104页
致谢第104-105页

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