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德氏乳杆菌保加利亚亚种CAUH1酸耐受机制的蛋白组学研究及抗酸胁迫基因Ldb0677和pyk的功能分析

摘要第1-6页
Abstract第6-15页
第一章 文献综述第15-25页
   ·乳酸菌过度发酵对于食品品质的影响第15页
   ·德式乳杆菌保加利亚亚种的强耐酸性导致酸奶后酸化第15-17页
     ·酸奶后酸化的形成机制第16页
     ·目前控制后酸化的主要途径第16-17页
   ·乳酸菌酸耐受机制的研究进展第17-21页
     ·酸胁迫及酸耐受反应第17页
     ·乳酸菌酸耐受机制的研究第17-19页
     ·L.bulgaricus酸耐受机制的研究进展第19-21页
   ·酸耐受反应(ATR)中的转录调控第21-23页
     ·转录调控的研究方法第21页
     ·细菌单杂交系统第21-23页
   ·研究目的与内容第23-25页
     ·研究目的及意义第23-24页
     ·研究内容第24页
     ·技术路线第24-25页
第二章 L.bulgaricus酸耐受反应中差异蛋白的分离及鉴定第25-38页
   ·材料与试剂第25-27页
     ·菌株第25页
     ·试剂第25页
     ·试剂的配制第25-26页
     ·仪器设备第26-27页
   ·实验方法第27-31页
     ·酸胁迫处理的致死pH值及亚致死pH值的确定第27页
     ·ATR的酸诱导条件的确定第27页
     ·蛋白质样品的制备第27-28页
     ·蛋白质双向电泳第28-29页
     ·凝胶染色及成像第29页
     ·2-DE数据分析第29-30页
     ·差异蛋白的质谱鉴定第30-31页
     ·数据的统计学处理第31页
   ·结果与分析第31-37页
     ·菌株酸胁迫处理的致死pH值和亚致死pH值第31-32页
     ·ATR的酸诱导条件的确定第32页
     ·L.bulgaricus CAUH1酸胁迫条件下的蛋白质图谱第32-34页
     ·差异蛋白的质谱鉴定及生物信息学分析第34-37页
   ·讨论第37-38页
第三章 RT-qPCR分析抗酸胁迫差异基因转录水平的变化第38-53页
   ·材料与试剂第38-39页
     ·菌株第38页
     ·试剂第38页
     ·试剂的配制第38-39页
     ·仪器设备第39页
   ·实验方法第39-44页
     ·L.bugaricus CAUH1酸胁迫处理样品的制备第39-40页
     ·乳杆菌总RNA的提取及定量第40页
     ·反转录制备cDNA第40-41页
     ·引物的设计及合成第41-43页
     ·普通PCR检测引物特异性第43页
     ·实时定量PCR检测基因转录表达差异第43-44页
     ·抗酸胁迫差异基因参与的代谢途径分析第44页
   ·结果与分析第44-50页
     ·总RNA的提取及定量分析第44-45页
     ·差异基因的PCR扩增及测序分析第45-46页
     ·实时定量PCR检测基因转录水平差异第46-50页
   ·讨论第50-53页
     ·碳水化合物代谢及脂肪酸合成第50-51页
     ·氨基酸代谢第51-52页
     ·蛋白质合成第52-53页
第四章 抗酸胁迫差异基因在L.lactis NZ9000中超量表达及功能验证第53-68页
   ·材料与试剂第53-55页
     ·菌株和质粒第53页
     ·试剂第53-54页
     ·试剂的配制第54-55页
     ·仪器设备第55页
   ·实验方法第55-60页
     ·乳酸菌基因组DNA的提取第55-56页
     ·抗酸胁迫差异基因的PCR扩增第56-57页
     ·DNA的回收纯化第57-58页
     ·抗酸胁迫差异基因的超量表达载体的构建第58页
     ·重组载体电转化L.lactis NZ9000第58-59页
     ·重组载体的测序分析第59页
     ·重组菌株的抗酸胁迫能力评价第59页
     ·Ldb0677和Pyk的SDS-PAGE检测第59-60页
     ·重组菌株NZ0677和NZpyk对于其他胁迫的耐受能力评价第60页
   ·结果与分析第60-66页
     ·L.bulgaricus CAUH1的基因组提取第60-61页
     ·抗酸胁迫差异基因的PCR扩增第61页
     ·抗酸胁迫差异基因的超量表达载体的构建第61-62页
     ·重组菌株的抗酸胁迫能力评价第62-63页
     ·SDS-PAGE分析Ldb0677和Pyk的超量表达第63-64页
     ·重组菌株NZ0677和NZpyk对于其他胁迫的耐受能力评价第64-66页
   ·讨论第66-68页
第五章 抗酸胁迫反应中转录因子Ldb0677的功能研究第68-88页
   ·材料与试剂第68-72页
     ·菌株和质粒第68页
     ·试剂第68-69页
     ·试剂的配制第69-71页
     ·仪器设备第71-72页
   ·实验方法第72-78页
     ·转录因子Ldb0677的克隆及重组质粒pB1H2-0677的构建第72页
     ·大肠杆菌E.coli US0的电转化方法第72-73页
     ·Western blot检测Omega-0677融合蛋白的表达第73-74页
     ·细菌单杂交筛选转录因子Ldb0677的DNA结合位点第74-75页
     ·生物信息学分析转录因子Ldb0677调控的靶基因第75页
     ·带有His标签的Ldb0677的表达及纯化第75-76页
     ·凝胶迁移实验(EMSA)第76-78页
   ·结果与分析第78-86页
     ·转录因子Ldb0677的克隆及重组质粒pB1H2-0677的构建第78-80页
     ·Western Blot检测Omega-0677融合蛋白的表达第80页
     ·细菌单杂交分析转录因子Ldb0677的DNA结合位点第80-82页
     ·生物信息学分析转录因子Ldb0677调控的靶基因第82-85页
     ·带有His标签的Ldb0677的表达及纯化第85页
     ·EMSA分析Ldb0677的DNA结合特异性第85-86页
   ·讨论第86-88页
第六章 调控抗酸胁迫基因pyk表达的转录因子的分离鉴定第88-106页
   ·材料与试剂第88-90页
     ·菌株和质粒第88页
     ·试剂第88-89页
     ·试剂的配制第89页
     ·仪器设备第89-90页
   ·实验方法第90-97页
     ·5'-RACE法确定pfk-pyk操纵子转录起始位点第90-92页
     ·pfk-pyk操纵子的启动子序列分析第92页
     ·pH3U3-TFBS“诱饵”载体的构建第92-93页
     ·L.bulgaricus CAUH1的转录因子表达文库的构建第93-96页
     ·Western Blot检测转录因子文库的表达情况第96-97页
     ·细菌单杂交筛选调控pyk基因表达的转录因子第97页
   ·结果与分析第97-103页
     ·TRIzol法提取CAUH1总RNA第97-98页
     ·5'-RACE扩增pfk-pyk操纵子5'末端DNA片段第98页
     ·pfk-pyk操纵子的上游启动子序列分析第98-99页
     ·pH3U3-TFBS“诱饵”载体的构建及鉴定第99-101页
     ·L.bulgaricus CAUH1的转录因子表达文库的构建第101页
     ·细菌单杂交筛选调控pyk基因表达的转录因子第101-103页
   ·讨论第103-106页
第七章 全文总结与展望第106-108页
   ·全文总结第106-107页
   ·创新点第107页
   ·展望第107-108页
参考文献第108-116页
致谢第116-117页
附录第117-121页
个人简介第121页

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