| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第14-39页 |
| 1.1 肠杆菌科细菌的生物学特性 | 第14-15页 |
| 1.2 肠杆菌科的检测方法进展 | 第15-16页 |
| 1.3 数值鉴定系统 | 第16-29页 |
| 1.3.1 细菌数值鉴定法的建立 | 第16-17页 |
| 1.3.2 细菌数值鉴定法中的可信度 | 第17-23页 |
| 1.3.3 细菌数值鉴定中生化试验的选择与编码 | 第23-28页 |
| 1.3.4 细菌数值鉴定系统的应用及存在问题 | 第28-29页 |
| 1.4 肠杆菌科细菌的耐药性 | 第29-35页 |
| 1.4.1 肠杆菌科细菌的耐药性 | 第29-31页 |
| 1.4.2 超广谱 β-内酰胺酶（ESBL） | 第31-34页 |
| 1.4.3 质粒介导AmpC酶 | 第34-35页 |
| 1.4.4 整合子与质粒介导的耐药性传播 | 第35页 |
| 1.5 本课题的主要内容与意义 | 第35-39页 |
| 第二章 食源性致病菌肠杆菌科细菌数值鉴定系统理论分析及软件设计 | 第39-58页 |
| 2.1 实验材料 | 第39-40页 |
| 2.2 实验方法 | 第40页 |
| 2.3 结果 | 第40-55页 |
| 2.3.1 数值鉴定系统的理论建模 | 第40-48页 |
| 2.3.2 数值鉴定系统软件的编制 | 第48-55页 |
| 2.3.3 数值鉴定系统生化反应鉴定条 | 第55页 |
| 2.4 讨论 | 第55-57页 |
| 2.5 本章小结 | 第57-58页 |
| 第三章 食源性致病菌肠杆菌科细菌数值鉴定系统的应用 | 第58-79页 |
| 3.1 实验材料 | 第58-59页 |
| 3.1.1 菌株来源 | 第58页 |
| 3.1.2 实验仪器 | 第58页 |
| 3.1.3 主要试剂 | 第58-59页 |
| 3.2 实验方法 | 第59-61页 |
| 3.2.1 广州食品与珠江水样肠杆菌科细菌的分离 | 第59-60页 |
| 3.2.2 标准菌株与实际样品分离株的验证 | 第60页 |
| 3.2.3 肠杆菌科细菌PCR鉴定 | 第60-61页 |
| 3.2.4 肠杆菌科细菌 16S rRNA基因测序 | 第61页 |
| 3.3 结果 | 第61-76页 |
| 3.3.1 标准菌株的验证 | 第61-62页 |
| 3.3.2 实际样本分离株的验证 | 第62-69页 |
| 3.3.3 广州食品与珠江水样肠杆菌科细菌的分离鉴定 | 第69-76页 |
| 3.4 讨论 | 第76-78页 |
| 3.5 本章小结 | 第78-79页 |
| 第四章 食源性小肠结肠炎耶尔森菌的耐药性及遗传多样性研究 | 第79-98页 |
| 4.1 实验材料 | 第79-80页 |
| 4.1.1 菌株来源 | 第79页 |
| 4.1.2 实验仪器 | 第79-80页 |
| 4.1.3 主要试剂 | 第80页 |
| 4.2 实验方法 | 第80-83页 |
| 4.2.1 生物型与血清型的检测 | 第80-81页 |
| 4.2.2 毒力基因的检测 | 第81-82页 |
| 4.2.3 耐药表型的检测 | 第82页 |
| 4.2.4 耐药基因的PCR检测 | 第82-83页 |
| 4.2.5 ERIC分型 | 第83页 |
| 4.2.6 遗传多样性分析 | 第83页 |
| 4.3 结果 | 第83-94页 |
| 4.3.1 生物型与血清型的检测 | 第83-88页 |
| 4.3.2 毒力基因的检测 | 第88-89页 |
| 4.3.3 耐药性分析 | 第89-91页 |
| 4.3.4 耐药基因的检测 | 第91页 |
| 4.3.5 ERIC分型 | 第91-94页 |
| 4.4 讨论 | 第94-97页 |
| 4.5 本章小结 | 第97-98页 |
| 第五章 广州食品与珠江水中肠杆菌科细菌的耐药性研究 | 第98-121页 |
| 5.1 实验材料 | 第98-99页 |
| 5.1.1 菌株来源 | 第98页 |
| 5.1.2 实验仪器 | 第98-99页 |
| 5.1.3 主要试剂 | 第99页 |
| 5.2 实验方法 | 第99-102页 |
| 5.2.1 抗生素敏感性实验 | 第99页 |
| 5.2.2 超广谱 β-内酰胺酶（ESBL）表型初筛与确证 | 第99-100页 |
| 5.2.3 AmpC表型初筛与确证 | 第100页 |
| 5.2.4 β-内酰胺酶基因的检测 | 第100-102页 |
| 5.2.5 整合子的检测 | 第102页 |
| 5.2.6 质粒接合实验与接合子检测 | 第102页 |
| 5.3 结果 | 第102-117页 |
| 5.3.1 耐药性分析 | 第102-107页 |
| 5.3.2 ESBL与AmpC的分离率及其分布 | 第107-109页 |
| 5.3.3 ESBL与AmpC阳性菌株耐药性分析 | 第109-111页 |
| 5.3.4 β-内酰胺酶基因的检测与序列分析 | 第111-116页 |
| 5.3.5 整合子基因的检测 | 第116页 |
| 5.3.6 质粒接合实验与接合子的检测 | 第116-117页 |
| 5.4 讨论 | 第117-120页 |
| 5.5 本章小结 | 第120-121页 |
| 第六章 产ESBL酶的肠杆菌科细菌全国食品分离株的耐药性研究 | 第121-136页 |
| 6.1 实验材料 | 第121-122页 |
| 6.1.1 菌株来源 | 第121页 |
| 6.1.2 实验仪器 | 第121-122页 |
| 6.1.3 主要试剂 | 第122页 |
| 6.2 实验方法 | 第122-123页 |
| 6.2.1 ESBL表型的初筛 | 第122页 |
| 6.2.2 ESBL分离株耐药表型的检测 | 第122页 |
| 6.2.3 β-内酰胺酶基因的检测 | 第122-123页 |
| 6.2.4 整合子基因的检测 | 第123页 |
| 6.2.5 质粒接合实验与接合子检测 | 第123页 |
| 6.3 结果 | 第123-133页 |
| 6.3.1 ESBL阳性的分离率及其分布 | 第123-125页 |
| 6.3.2 ESBL肠杆菌科的耐药性分析 | 第125-127页 |
| 6.3.3 β-内酰胺酶基因的检测 | 第127-131页 |
| 6.3.4 整合子基因的检测 | 第131页 |
| 6.3.5 ESBL阳性菌的质粒接合实验与接合子检测 | 第131-133页 |
| 6.4 讨论 | 第133-135页 |
| 6.5 本章小结 | 第135-136页 |
| 结论与展望 | 第136-139页 |
| 参考文献 | 第139-160页 |
| 附录 | 第160-178页 |
| 攻读博士学位期间取得的研究成果 | 第178-180页 |
| 致谢 | 第180-181页 |
| 附表 | 第181页 |
