| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-11页 |
| 第一章：引言 | 第11-22页 |
| ·中华绒螯蟹简介 | 第11页 |
| ·肠道细菌研究背景 | 第11-14页 |
| ·人体肠道微生物研究 | 第11-13页 |
| ·水产动物肠道微生物研究 | 第13-14页 |
| ·益生菌在水产中的应用 | 第14-17页 |
| ·对有害菌的抑制 | 第15页 |
| ·提高机体免疫力 | 第15页 |
| ·改善机体的营养与代谢情况 | 第15-16页 |
| ·改善水体环境 | 第16页 |
| ·改善肉质 | 第16-17页 |
| ·中华绒螯蟹肠道结构 | 第17页 |
| ·肠道菌群多样性的研究方法 | 第17-20页 |
| ·梯度稀释涂布培养 | 第17-18页 |
| ·显微技术 | 第18页 |
| ·指纹图谱技术 | 第18-19页 |
| ·测序技术 | 第19-20页 |
| ·研究内容及思路图 | 第20-22页 |
| 第二章：细菌 16S rRNA基因V3 区引物的特异性评价分析 | 第22-35页 |
| ·研究背景 | 第22-23页 |
| ·材料与方法 | 第23-26页 |
| ·样品的采集与处理 | 第23页 |
| ·总DNA提取 | 第23页 |
| ·引物合成和PCR | 第23-24页 |
| ·DGGE分析 | 第24-25页 |
| ·宏基因组测序分析验证引物 | 第25页 |
| ·序列分析 | 第25-26页 |
| ·结果与分析 | 第26-33页 |
| ·DGGE结果 | 第26-28页 |
| ·DGGE割胶测序结果 | 第28-30页 |
| ·V3 区和V4 区引物宏基因组测序结果 | 第30-31页 |
| ·引物筛选 | 第31-33页 |
| ·讨论 | 第33-34页 |
| ·小结 | 第34-35页 |
| 第三章：中华绒螯蟹肠道细菌多样性研究 | 第35-50页 |
| ·研究背景 | 第35-36页 |
| ·材料与方法 | 第36-39页 |
| ·螃蟹样品的采集 | 第36页 |
| ·DGGE分析肠道细菌 | 第36-37页 |
| ·S rRNA宏基因组测序 | 第37页 |
| ·DGGE克隆文库序列分析 | 第37-38页 |
| ·宏基因组数据分析 | 第38页 |
| ·上传序列的登录号 | 第38-39页 |
| ·结果 | 第39-46页 |
| ·DGGE分析肠道核心菌群多样性 | 第39-41页 |
| ·肠道细菌宏基因组研究 | 第41-46页 |
| ·讨论与分析 | 第46-49页 |
| ·潜在的益生菌 | 第46-48页 |
| ·柄基结构和菌毛状结构细菌的潜在作用 | 第48-49页 |
| ·小结 | 第49-50页 |
| 第四章：中华绒螯蟹肠道核心菌群筛选 | 第50-62页 |
| ·材料与方法 | 第50-54页 |
| ·样品采集 | 第50页 |
| ·16SrRNA基因宏基因组测序分析 | 第50-51页 |
| ·宏基因组数据分析 | 第51页 |
| ·荧光定量PCR引物设计 | 第51-52页 |
| ·荧光定量PCR标准品设计 | 第52-53页 |
| ·荧光定量PCR | 第53页 |
| ·荧光定量PCR数据统计分析 | 第53-54页 |
| ·结果与分析 | 第54-60页 |
| ·宏基因组分析结果 | 第54-55页 |
| ·可能的核心菌群 | 第55-56页 |
| ·中华绒螯蟹肠道细菌数量 | 第56-57页 |
| ·不同采样点肠道核心菌的区别 | 第57-59页 |
| ·肠道核心菌可能来源检测 | 第59页 |
| ·肠道核心菌在中后肠分布 | 第59-60页 |
| ·讨论与分析 | 第60-61页 |
| ·中华绒螯蟹核心菌群的确定 | 第60页 |
| ·中华绒螯蟹核心菌群的来源 | 第60-61页 |
| ·qPCR验证中后肠核心菌群差别 | 第61页 |
| ·小结 | 第61-62页 |
| 第五章：全文总结 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-68页 |
| 致谢 | 第68页 |