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屎肠球菌BZ2全基因组测序、分析及细菌素结构基因表达

摘要第3-4页
abstract第4页
1 引言第11-21页
    1.1 乳酸菌第11页
    1.2 LAB细菌素第11-18页
        1.2.1 LAB细菌素的分类第11-12页
        1.2.2 LAB细菌素的生物合成及调控第12-14页
        1.2.3 异源表达LAB细菌素第14-15页
        1.2.4 主要肠球菌细菌素第15-18页
    1.3 高通量全基因组测序技术第18-20页
        1.3.1 肠球菌素基因的挖掘与注释第19-20页
    1.4 本研究目的与意义第20-21页
2 E.faeciumBZ2全基因组测序第21-40页
    2.1 材料与方法第21-23页
        2.1.1 E.faeciumBZ2的培养与基因组DNA的提取第21页
        2.1.2 基因组测序和拼接第21页
        2.1.3 基因组组分预测第21-22页
        2.1.4 基因预测、注释和蛋白质分类第22页
        2.1.5 肠球菌素基因分析及挖掘第22-23页
    2.2 结果与分析第23-38页
        2.2.1 数据产出及质量控制第23-24页
        2.2.2 基因组拼接组装第24-27页
        2.2.3 基因组组分预测第27-29页
        2.2.4 基因功能分析第29-33页
        2.2.5 全基因组图谱第33页
        2.2.6 肠球菌素基因预测和挖掘第33-38页
    2.3 小结第38-40页
3 重组质粒的构建与原核表达第40-65页
    3.1 试验材料第40-42页
        3.1.1 试验菌株与质粒第40-41页
        3.1.2 基因片段设计与合成第41页
        3.1.3 试验所用试剂第41页
        3.1.4 试验所用培养基和溶液配置第41-42页
        3.1.5 主要仪器第42页
    3.2 试验方法第42-51页
        3.2.1 E.faeciumBZ2基因组的提取与目的基因的检测第42-43页
        3.2.2 目的基因entA和entB基因扩增第43-44页
        3.2.3 PCR产物的回收与纯化第44页
        3.2.4 载体的连接第44-45页
        3.2.5 重组质粒的转化第45页
        3.2.6 阳性克隆筛选第45-46页
        3.2.7 重组质粒的提取第46-47页
        3.2.8 pET-28a质粒进行双酶切并纯化第47-48页
        3.2.9 T4连接第48页
        3.2.10 重组蛋白表达与条件的优化第48-49页
        3.2.11 重组蛋白的变性与过滤第49页
        3.2.12 重组蛋白的柱上纯化与复性第49-50页
        3.2.13 重组蛋白的除盐与浓缩第50页
        3.2.14 目的蛋白定量第50页
        3.2.15 抑菌圈测定第50-51页
    3.3 结果与分析第51-64页
        3.3.1 目的基因entA和entB的扩增和酶切第51-52页
        3.3.2 pEasy-T1重组质粒的构建第52-54页
        3.3.3 pET-28a重组质粒的构建第54-57页
        3.3.4 pET-entA-Transetta和pET-entB-Transetta菌株的构建第57-59页
        3.3.5 诱导条件的优化第59-61页
        3.3.6 重组蛋白的纯化及验证第61-64页
    3.4 小结第64-65页
4 讨论第65-67页
5 总结论第67-68页
致谢第68-69页
参考文献第69-87页
附录第87-88页
作者简介第88页

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