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酿酒酵母硫化氢合成的转录组学研究

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-9页
第一章 文献综述第13-30页
    1.1 低产H_2S菌株的筛选第13-14页
    1.2 酿酒酵母H_2S的形成机制第14-15页
    1.3 影响H_2S产生的因素第15-18页
        1.3.1 菌株遗传背景第15-16页
        1.3.2 葡萄汁中的营养物质第16-18页
        1.3.3 发酵条件第18页
    1.4 H_2S的检测方法第18-21页
        1.4.1 定性方法第18-19页
        1.4.2 定量方法第19-21页
    1.5 酿酒酵母H_2S代谢的基因调控机制第21-24页
        1.5.1 硫酸盐代谢途径中相关酶的基因调控第21-22页
        1.5.2 转录因子的调控第22-24页
    1.6 酿酒酵母硫代谢中的组学研究第24-25页
    1.7 RNA-Seq数据分析中的相关概念和算法第25-28页
    1.8 本研究的意义及研究内容第28-30页
第二章 不同产H_2S特性菌株的筛选第30-39页
    2.1 材料与方法第30-32页
        2.1.1 材料第30-31页
            2.1.1.1 酵母菌株第30页
            2.1.1.2 主要试剂第30页
            2.1.1.3 培养基第30-31页
            2.1.1.4 仪器设备第31页
        2.1.2 方法第31-32页
            2.1.2.1 BIGGY琼脂培养基显色第31页
            2.1.2.2 Triple M模拟汁发酵第31-32页
    2.2 结果与分析第32-38页
        2.2.1 BIGGY琼脂培养基筛选第32-35页
        2.2.2 Triple M模拟汁发酵第35-38页
            2.2.2.1 不产H_2S菌株发酵特点及产H_2S情况第36页
            2.2.2.2 低产H_2S菌株发酵特点及产H_2S情况第36-37页
            2.2.2.3 中产H_2S菌株发酵特点及产H_2S情况第37页
            2.2.2.4 高产H_2S菌株发酵特点及产H_2S情况第37-38页
    2.3 讨论第38-39页
        2.3.1 BIGGY琼脂和Triple M模拟汁发酵在H_2S检测中的比较分析第38页
        2.3.2 H_2S产量的菌株依赖性和随发酵时间的变化特性第38-39页
第三章 RNA-Seq样品的制备及RNA-Seq测序第39-49页
    3.1 材料与方法第39-43页
        3.1.1 材料第39页
            3.1.1.1 酵母菌株第39页
            3.1.1.2 主要试剂及耗材第39页
            3.1.1.3 仪器设备第39页
        3.1.2 方法第39-43页
            3.1.2.1 Triple M模拟汁发酵第39-40页
            3.1.2.2 酵酿酒酵母总RNA的提取第40-41页
            3.1.2.3 RNA-Seq测序第41页
            3.1.2.4 RNA-Seq测序数据分析第41-42页
            3.1.2.5 差异表达基因分析第42-43页
            3.1.2.6 差异表达基因的GO功能富集分析第43页
            3.1.2.7 差异表达基因的Pathway富集分析第43页
    3.2 结果与分析第43-48页
        3.2.1 Triple M模拟汁发酵特性第43-44页
        3.2.2 RNA的检测第44页
        3.2.3 RNA-Seq测序数据分析第44-45页
        3.2.4 差异表达基因第45页
        3.2.5 差异表达基因的GO功能富集分析第45-47页
        3.2.6 差异表达基因的Pathway富集分析第47-48页
    3.3 讨论第48-49页
第四章 硫代谢途径中的差异表达基因第49-64页
    4.1 材料与方法第49页
        4.1.1 材料第49页
            4.1.1.1 数据来源第49页
        4.1.2 方法第49页
            4.1.2.1 差异表达基因在硫代谢途径中的富集分析第49页
            4.1.2.2 与H_2S合成有关的差异表达基因分析第49页
    4.2 结果与分析第49-62页
        4.2.1 差异表达基因在硫代谢途径中的富集第49-59页
        4.2.2 与H_2S合成有关的差异表达基因第59-62页
    4.3 讨论第62-64页
第五章 结论第64-65页
参考文献第65-71页
附录第71-89页
致谢第89-90页
作者简介第90页
发表论文情况第90页

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