基于iTRAQ技术分析胡桃醌对金黄色葡萄球菌的抑菌作用机理
| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 英文缩略词表 | 第12-14页 |
| 1. 前言 | 第14-28页 |
| 1.1 金黄色葡萄球菌危害及其耐药性 | 第14页 |
| 1.2 胡桃醌概述 | 第14-17页 |
| 1.2.1 胡桃醌抗肿瘤活性 | 第14-16页 |
| 1.2.2 胡桃醌抗菌研究进展 | 第16页 |
| 1.2.3 胡桃醌的缺陷 | 第16-17页 |
| 1.3 蛋白质组学常用技术 | 第17-18页 |
| 1.3.1 SDS-PAGE | 第17页 |
| 1.3.2 2-DE | 第17页 |
| 1.3.3 2D-DIGE | 第17-18页 |
| 1.3.4 Label Free | 第18页 |
| 1.3.5 iTRAQ | 第18页 |
| 1.3.6 SILAC | 第18页 |
| 1.4 常用生物信息学体系 | 第18-21页 |
| 1.4.1 数据库的选择 | 第18-19页 |
| 1.4.2 生物信息学分析前的关键—Blast | 第19页 |
| 1.4.3 GO与KEGG | 第19-20页 |
| 1.4.4 蛋白互作网络 | 第20-21页 |
| 1.5 蛋白质组学在抑菌机理研究中的应用 | 第21-23页 |
| 1.6 药物靶点 | 第23-28页 |
| 1.6.1 寻找药物靶点的技术手段 | 第24页 |
| 1.6.2 常见药物靶点 | 第24-28页 |
| 2. 材料与方法 | 第28-34页 |
| 2.1 实验材料 | 第28-29页 |
| 2.1.1 菌株 | 第28页 |
| 2.1.2 试剂 | 第28页 |
| 2.1.3 主要试剂配制 | 第28-29页 |
| 2.2 实验仪器 | 第29页 |
| 2.3 实验方法 | 第29-34页 |
| 2.3.1 菌体沉淀制备 | 第30页 |
| 2.3.2 提取蛋白 | 第30页 |
| 2.3.3 SDS-PAGE电泳 | 第30页 |
| 2.3.4 FASP酶解 | 第30-31页 |
| 2.3.5 iTRAQ标记 | 第31页 |
| 2.3.6 SCX强阳离子色谱分级 | 第31页 |
| 2.3.7 毛细管高效液相色谱 | 第31页 |
| 2.3.8 质谱鉴定 | 第31-32页 |
| 2.3.9 质谱数据分析 | 第32-33页 |
| 2.3.10 生物信息学分析 | 第33页 |
| 2.3.11 药物靶点模型构建 | 第33-34页 |
| 3. 结果与讨论 | 第34-48页 |
| 3.1 蛋白质量评估 | 第34页 |
| 3.2 胡桃醌对金黄色葡萄球菌全蛋白组的影响 | 第34页 |
| 3.3 功能注释与分类 | 第34-40页 |
| 3.3.1 胡桃醌造成的氧化损伤 | 第36-37页 |
| 3.3.2 胡桃醌造成DNA损伤 | 第37页 |
| 3.3.3 胡桃醌激活金黄色葡萄球菌压力应激系统 | 第37-38页 |
| 3.3.4 胡桃醌对蛋白合成的影响 | 第38页 |
| 3.3.5 胡桃醌对细胞膜渗透性的影响 | 第38-39页 |
| 3.3.6 胡桃醌对细胞壁合成与细胞分化的影响 | 第39-40页 |
| 3.4 差异蛋白互作网络 | 第40-41页 |
| 3.5 胡桃醌潜在靶点预测 | 第41-42页 |
| 3.6 金黄色葡萄球菌潜在药物靶点挖掘 | 第42-48页 |
| 4. 总结 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-56页 |
| 致谢 | 第56-57页 |
| 攻读学位论文期间发表文章 | 第57-58页 |
