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基于转录组学的草莓色泽劣变相关基因的研究

摘要第9-11页
ABSTRACT第11-12页
缩略词第14-16页
第一章 绪论第16-26页
    1 研究背景第16-24页
        1.1 研究问题的由来第16-17页
        1.2 影响果实色泽的内部因子第17-21页
            1.2.1 花色素苷与果实色泽第17-19页
            1.2.2 酚类物质代谢与果实色泽第19-21页
        1.3 影响果实色泽的外部因子第21-22页
            1.3.1 温度第21页
            1.3.2 光照第21页
            1.3.3 pH第21-22页
            1.3.4 金属离子第22页
        1.4 UGTs第22-23页
            1.4.1 UGTs简介第22页
            1.4.2 UGTs的生理功能第22页
            1.4.3 UGTs的催化特性第22-23页
            1.4.4 UF3GTs第23页
        1.5 转录组测序技术第23-24页
            1.5.1 转录组测序技术简介第23页
            1.5.2 在植物中的应用研究第23-24页
    2 研究内容、目的及意义第24-26页
        2.1 内容第24-25页
        2.2 目的及意义第25-26页
第二章 高温条件下采后草莓果实色泽相关差异基因分析第26-45页
    1 引言第26页
    2 材料与方法第26-31页
        2.1 试验材料第26页
        2.2 酶及生化试剂第26-27页
        2.3 主要仪器与设备第27页
        2.4 实验方法第27-31页
            2.4.1 转录组文库构建及测序第27页
            2.4.2 转录组信息分析第27-28页
            2.4.3 果实色泽劣变相关差异基因表达筛选第28页
            2.4.4 差异基因的qPCR验证第28-31页
    3 结果与分析第31-40页
        3.1 不同贮藏温度下草莓果实的基因表达概况第31-32页
        3.2 不同贮藏温度下草莓果实的基因差异表达分析第32-35页
            3.2.1 差异基因表达概况分析第32-33页
            3.2.2 差异基因的GO功能分类分析第33页
            3.2.3 差异基因的KEGG功能显著性富集分析第33-35页
        3.3 色泽相关基因的差异表达分析第35-39页
            3.3.1 花色素苷合成途径中的转录因子的差异表达分析第35页
            3.3.2 花色素苷合成途径中的结构基因的差异表达分析第35-36页
            3.3.3 花色素苷转运相关基因的差异表达分析第36-37页
            3.3.4 酚类物质代谢相关酶基因的差异表达分析第37-39页
        3.4 色泽劣变相关差异基因的qPCR验证第39-40页
    4 讨论第40-43页
        4.1 花色素苷的生物合成第40-41页
        4.2 花色素苷的转运第41-42页
        4.3 酚类物质代谢相关酶第42-43页
    5 小结第43-45页
第三章 UF3GT3的克隆及其生物信息学分析第45-59页
    1 引言第45页
    2 材料与方法第45-51页
        2.1 试验材料第45页
        2.2 菌种和质粒第45-46页
        2.3 酶及生化试剂第46页
        2.4 培养基及溶液配制第46页
        2.5 主要仪器与设备第46-47页
        2.6 实验方法第47-51页
            2.6.1 草莓果实基因组DNA的提取第47页
            2.6.2 总RNA的提取第47页
            2.6.3 cDNA的合成第47页
            2.6.4 UF3GT3基因cDNA全长、DNA全长的扩增第47-48页
            2.6.5 PCR扩增产物的纯化第48-49页
            2.6.6 回收产物连接pEASY-BluntSimpleCloningVector第49页
            2.6.7 连接产物转化大肠杆菌第49-50页
            2.6.8 阳性菌落筛选及序列鉴定第50页
            2.6.9 UF3GT3基因的生物信息学分析第50-51页
    3 结果与分析第51-56页
        3.1 UF3GT3基因cDNA、DNA全长的克隆第51-52页
        3.2 UF3GT3基因及其启动子序列的生物信息学分析第52-56页
            3.2.1 UF3GT3基因序列与氨基酸序列的分析第52页
            3.2.2 UF3GT3系统进化树的建立第52-53页
            3.2.3 UF3GT3蛋白的理化性质分析第53页
            3.2.4 UF3GT3蛋白的分子结构分析第53-54页
            3.2.5 UF3GT3蛋白的亲疏水性分析第54页
            3.2.6 UF3GT3蛋白的保守结构域分析第54-55页
            3.2.7 UF3GT3基因启动子的顺式作用元件分析第55-56页
    4 讨论第56-57页
        4.1 UF3GT3的编码区全长第56-57页
        4.2 UF3GT3的基因同源性第57页
        4.3 UF3GT3的启动子功能预测第57页
    5 小结第57-59页
第四章 UF3GT3基因的功能初探第59-74页
    1 引言第59页
    2 材料与方法第59-65页
        2.1 试验材料第59页
        2.2 菌种和质粒第59-60页
        2.3 酶及生化试剂第60-61页
        2.4 培养基及溶液配制第61页
        2.5 主要设备及仪器第61-62页
        2.6 实验方法第62-65页
            2.6.1 引物设计第62页
            2.6.2 目的片段克隆第62页
            2.6.3 过表达载体的构建第62-63页
            2.6.4 干扰载体的构建第63页
            2.6.5 农杆菌的转化及瞬时转染第63-64页
            2.6.6 EGFP的显微观察第64页
            2.6.7 qPCR鉴定瞬时转染草莓果实的基因表达变化第64页
            2.6.8 花色素苷、总黄酮、总酚含量的变化第64-65页
    3 结果与分析第65-70页
        3.1 UF3GT3植物表达载体的构建第65-66页
        3.2 UF3GT3植物干扰载体的构建第66-67页
        3.3 EGFP的显微鉴定第67-68页
        3.4 基因表达变化的qPCR鉴定第68-69页
        3.5 酚类物质含量变化鉴定第69-70页
    4 讨论第70-72页
        4.1 植物过表达载体与干扰载体探讨第70-71页
            4.1.1 表达载体第70页
            4.1.2 干涉载体第70-71页
        4.2 农杆菌介导草莓果实的瞬时转染探讨第71-72页
            4.2.1 瞬时转染的效果探讨第71页
            4.2.2 转染条件的探讨第71-72页
        4.3 UF3GTs对酚类物质代谢的影响第72页
    5 小结第72-74页
第五章 结论与展望第74-75页
    1 结论第74页
    2 展望第74-75页
参考文献第75-86页
附录第86-87页
致谢第87页

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