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大黄鱼源Shewanella baltica群体感应LuxS蛋白及cyclo-(L-Pro-L-Leu)信号分子功能研究

摘要第3-8页
ABSTRACT第8-12页
第一章 绪论第16-33页
    1.1 群体感应第16-27页
        1.1.1 群体感应的定义第16-17页
        1.1.2 群体感应类型第17-18页
        1.1.3 AHLs介导的群体感应系统第18-21页
        1.1.4 AI-2介导的群体感应系统第21-24页
        1.1.5 DKPs介导的群体感应系统第24-26页
        1.1.6 其它信号分子介导的群体感应系统第26-27页
    1.2 群体感应与食品腐败菌第27-29页
        1.2.1 奶类制品中腐败菌的群体感应第27-28页
        1.2.2 肉制品中腐败菌的群体感应第28页
        1.2.3 水产品中腐败菌的群体感应第28-29页
        1.2.4 果蔬中腐败菌的群体感应第29页
    1.3 群体感应与食源性细菌生物被膜形成第29-31页
        1.3.1 细菌生物被膜的定义第29页
        1.3.2 生物被膜的形成步骤第29-30页
        1.3.3 食源性细菌生物被膜与群体感应的联系第30-31页
    1.4 本课题的研究目的、意义和内容第31-33页
第二章 S. baltica群体感应相关蛋白LuxR和LuxS生物信息学分析第33-50页
    2.1 前言第33页
    2.2 材料与设备第33-35页
        2.2.1 菌种及培养条件第33-34页
        2.2.2 试剂第34页
        2.2.3 主要仪器设备第34-35页
    2.3 实验方法第35-38页
        2.3.1 信号分子的提取第35页
        2.3.2 生物报告菌检测信号分子第35页
        2.3.3 LC-MS/MS检测AHLs信号分子第35-36页
        2.3.4 V.harveyi BB170生物报告菌法检测AI-2活性第36页
        2.3.5 气相色谱法检测S.baltica SB11上清液中DKPs信号分子第36页
        2.3.6 两个luxR及luxS基因PCR扩增及序列分析第36-37页
        2.3.7 S.baltica SB11中luxR和luxS基因的分析第37页
        2.3.8 S.baltica SB11中LuxR和LuxS蛋白序列分析及进化树构建第37-38页
        2.3.9 S.baltica SB11中LuxS蛋白结构模拟第38页
    2.4 结果与分析第38-48页
        2.4.1 S.baltica SB11上清中QS信号分子的活性第38-40页
        2.4.2 S.baltica BA175中LuxR家族同源蛋白分析第40-42页
        2.4.3 S.baltica BA175中LuxR家族同源蛋白进化树分析第42-43页
        2.4.4 S.baltica可能的LuxR solo蛋白氨基酸和功能预测分析第43-44页
        2.4.5 S.baltica SB11中luxS基因扩增及蛋白序列分析第44-48页
    2.5 讨论与分析第48-50页
第三章 luxS基因缺失对S.baltica生物被膜和致腐表型的影响第50-71页
    3.1 前言第50页
    3.2 材料与设备第50-51页
        3.2.1 细菌及培养条件第50页
        3.2.2 培养基和主要试剂第50-51页
        3.2.3 仪器设备第51页
    3.3 实验方法第51-56页
        3.3.1 S.baltica SB11菌株luxS基因扩增与缺失株的构建第51-52页
        3.3.2 △luxS菌株的AI-2活性检测第52页
        3.3.3 SB11与△luxS的生长曲线的绘制第52-53页
        3.3.4 SB11与△luxS生物被膜测定第53页
        3.3.5 珠涡流法测定粘附能力及荧光显微镜观察第53页
        3.3.6 SB11与△luxS胞外多糖含量测定第53-54页
        3.3.7 SB11与△luxS泳动性测定第54页
        3.3.8 SB11与△luxS蛋白酶活性测定第54页
        3.3.9 SB11与△luxS TMA含量测定第54页
        3.3.10 SB11与△luxS腐胺含量测定第54-55页
        3.3.11 SB11与△luxS在大黄鱼灭菌鱼汁中腐败能力测定第55-56页
        3.3.12 SDS-PAGE电泳检测总蛋白第56页
    3.4 数据处理和制图第56页
    3.5 结果与分析第56-68页
        3.5.1 缺失株luxS基因缺失验证第56-58页
        3.5.2 luxS基因缺失对S.baltica生长的影响第58-59页
        3.5.3 luxS缺失对S.baltica生物被膜的影响第59-60页
        3.5.4 luxS基因缺失对S.baltica粘附能力的影响第60-62页
        3.5.5 luxS基因缺失对S.baltica泳动能力的影响第62-63页
        3.5.6 luxS基因缺失对S.baltica水溶性胞外多糖含量的影响第63页
        3.5.7 luxS基因缺失对S.baltica胞外蛋白酶活性的影响第63-64页
        3.5.8 luxS基因缺失对S.baltica三甲胺形成的影响第64-65页
        3.5.9 luxS缺失对S.baltica腐胺形成的影响第65-66页
        3.5.10 luxS缺失对S.baltica在鱼汁中生长和TVB-N积累的影响第66-67页
        3.5.11 luxS缺失对S.baltica总蛋白表达差异的影响第67-68页
    3.6 讨论第68-71页
第四章 基于转录组学分析二酮哌嗪类信号分子cyclo-(L-Pro-L-Leu)对S.baltica致腐的调控作用第71-97页
    4.1 前言第71页
    4.2 材料与仪器第71-72页
        4.2.1 主要试剂和培养基第71-72页
        4.2.2 主要仪器第72页
    4.3 实验方法第72-77页
        4.3.1 信号分子的配置第72页
        4.3.2 生长曲线的绘制第72页
        4.3.3 结晶紫法测定生物被膜形成量第72-73页
        4.3.4 粘附能力第73页
        4.3.5 泳动能力的测定第73页
        4.3.6 脂肪酶活性的测定第73页
        4.3.7 三甲胺形成能力测定第73页
        4.3.8 TVB-N形成能力测定第73-74页
        4.3.9 转录组学测序第74-75页
        4.3.10 荧光定量PCR验证第75-77页
    4.4 数据处理和分析第77页
    4.5 结果与分析第77-92页
        4.5.1 外源cyclo-(L-Pro-L-Leu)添加对S.baltica SB11表型的影响第77-82页
        4.5.2 Cyclo-(L-Pro-L-Leu)刺激下S.baltica的转录组学分析第82-90页
        4.5.3 荧光定量PCR验证第90-92页
    4.6 讨论第92-97页
第五章 总结、展望和创新点第97-99页
    5.1 总结第97-98页
    5.2 创新点第98页
    5.3 展望第98-99页
参考文献第99-107页
致谢第107-108页
附录Ⅰ 英文缩略词对照表第108-109页
附录Ⅱ 攻读硕士学位期间主要研究成果第109-110页

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