摘要 | 第3-8页 |
ABSTRACT | 第8-12页 |
第一章 绪论 | 第16-33页 |
1.1 群体感应 | 第16-27页 |
1.1.1 群体感应的定义 | 第16-17页 |
1.1.2 群体感应类型 | 第17-18页 |
1.1.3 AHLs介导的群体感应系统 | 第18-21页 |
1.1.4 AI-2介导的群体感应系统 | 第21-24页 |
1.1.5 DKPs介导的群体感应系统 | 第24-26页 |
1.1.6 其它信号分子介导的群体感应系统 | 第26-27页 |
1.2 群体感应与食品腐败菌 | 第27-29页 |
1.2.1 奶类制品中腐败菌的群体感应 | 第27-28页 |
1.2.2 肉制品中腐败菌的群体感应 | 第28页 |
1.2.3 水产品中腐败菌的群体感应 | 第28-29页 |
1.2.4 果蔬中腐败菌的群体感应 | 第29页 |
1.3 群体感应与食源性细菌生物被膜形成 | 第29-31页 |
1.3.1 细菌生物被膜的定义 | 第29页 |
1.3.2 生物被膜的形成步骤 | 第29-30页 |
1.3.3 食源性细菌生物被膜与群体感应的联系 | 第30-31页 |
1.4 本课题的研究目的、意义和内容 | 第31-33页 |
第二章 S. baltica群体感应相关蛋白LuxR和LuxS生物信息学分析 | 第33-50页 |
2.1 前言 | 第33页 |
2.2 材料与设备 | 第33-35页 |
2.2.1 菌种及培养条件 | 第33-34页 |
2.2.2 试剂 | 第34页 |
2.2.3 主要仪器设备 | 第34-35页 |
2.3 实验方法 | 第35-38页 |
2.3.1 信号分子的提取 | 第35页 |
2.3.2 生物报告菌检测信号分子 | 第35页 |
2.3.3 LC-MS/MS检测AHLs信号分子 | 第35-36页 |
2.3.4 V.harveyi BB170生物报告菌法检测AI-2活性 | 第36页 |
2.3.5 气相色谱法检测S.baltica SB11上清液中DKPs信号分子 | 第36页 |
2.3.6 两个luxR及luxS基因PCR扩增及序列分析 | 第36-37页 |
2.3.7 S.baltica SB11中luxR和luxS基因的分析 | 第37页 |
2.3.8 S.baltica SB11中LuxR和LuxS蛋白序列分析及进化树构建 | 第37-38页 |
2.3.9 S.baltica SB11中LuxS蛋白结构模拟 | 第38页 |
2.4 结果与分析 | 第38-48页 |
2.4.1 S.baltica SB11上清中QS信号分子的活性 | 第38-40页 |
2.4.2 S.baltica BA175中LuxR家族同源蛋白分析 | 第40-42页 |
2.4.3 S.baltica BA175中LuxR家族同源蛋白进化树分析 | 第42-43页 |
2.4.4 S.baltica可能的LuxR solo蛋白氨基酸和功能预测分析 | 第43-44页 |
2.4.5 S.baltica SB11中luxS基因扩增及蛋白序列分析 | 第44-48页 |
2.5 讨论与分析 | 第48-50页 |
第三章 luxS基因缺失对S.baltica生物被膜和致腐表型的影响 | 第50-71页 |
3.1 前言 | 第50页 |
3.2 材料与设备 | 第50-51页 |
3.2.1 细菌及培养条件 | 第50页 |
3.2.2 培养基和主要试剂 | 第50-51页 |
3.2.3 仪器设备 | 第51页 |
3.3 实验方法 | 第51-56页 |
3.3.1 S.baltica SB11菌株luxS基因扩增与缺失株的构建 | 第51-52页 |
3.3.2 △luxS菌株的AI-2活性检测 | 第52页 |
3.3.3 SB11与△luxS的生长曲线的绘制 | 第52-53页 |
3.3.4 SB11与△luxS生物被膜测定 | 第53页 |
3.3.5 珠涡流法测定粘附能力及荧光显微镜观察 | 第53页 |
3.3.6 SB11与△luxS胞外多糖含量测定 | 第53-54页 |
3.3.7 SB11与△luxS泳动性测定 | 第54页 |
3.3.8 SB11与△luxS蛋白酶活性测定 | 第54页 |
3.3.9 SB11与△luxS TMA含量测定 | 第54页 |
3.3.10 SB11与△luxS腐胺含量测定 | 第54-55页 |
3.3.11 SB11与△luxS在大黄鱼灭菌鱼汁中腐败能力测定 | 第55-56页 |
3.3.12 SDS-PAGE电泳检测总蛋白 | 第56页 |
3.4 数据处理和制图 | 第56页 |
3.5 结果与分析 | 第56-68页 |
3.5.1 缺失株luxS基因缺失验证 | 第56-58页 |
3.5.2 luxS基因缺失对S.baltica生长的影响 | 第58-59页 |
3.5.3 luxS缺失对S.baltica生物被膜的影响 | 第59-60页 |
3.5.4 luxS基因缺失对S.baltica粘附能力的影响 | 第60-62页 |
3.5.5 luxS基因缺失对S.baltica泳动能力的影响 | 第62-63页 |
3.5.6 luxS基因缺失对S.baltica水溶性胞外多糖含量的影响 | 第63页 |
3.5.7 luxS基因缺失对S.baltica胞外蛋白酶活性的影响 | 第63-64页 |
3.5.8 luxS基因缺失对S.baltica三甲胺形成的影响 | 第64-65页 |
3.5.9 luxS缺失对S.baltica腐胺形成的影响 | 第65-66页 |
3.5.10 luxS缺失对S.baltica在鱼汁中生长和TVB-N积累的影响 | 第66-67页 |
3.5.11 luxS缺失对S.baltica总蛋白表达差异的影响 | 第67-68页 |
3.6 讨论 | 第68-71页 |
第四章 基于转录组学分析二酮哌嗪类信号分子cyclo-(L-Pro-L-Leu)对S.baltica致腐的调控作用 | 第71-97页 |
4.1 前言 | 第71页 |
4.2 材料与仪器 | 第71-72页 |
4.2.1 主要试剂和培养基 | 第71-72页 |
4.2.2 主要仪器 | 第72页 |
4.3 实验方法 | 第72-77页 |
4.3.1 信号分子的配置 | 第72页 |
4.3.2 生长曲线的绘制 | 第72页 |
4.3.3 结晶紫法测定生物被膜形成量 | 第72-73页 |
4.3.4 粘附能力 | 第73页 |
4.3.5 泳动能力的测定 | 第73页 |
4.3.6 脂肪酶活性的测定 | 第73页 |
4.3.7 三甲胺形成能力测定 | 第73页 |
4.3.8 TVB-N形成能力测定 | 第73-74页 |
4.3.9 转录组学测序 | 第74-75页 |
4.3.10 荧光定量PCR验证 | 第75-77页 |
4.4 数据处理和分析 | 第77页 |
4.5 结果与分析 | 第77-92页 |
4.5.1 外源cyclo-(L-Pro-L-Leu)添加对S.baltica SB11表型的影响 | 第77-82页 |
4.5.2 Cyclo-(L-Pro-L-Leu)刺激下S.baltica的转录组学分析 | 第82-90页 |
4.5.3 荧光定量PCR验证 | 第90-92页 |
4.6 讨论 | 第92-97页 |
第五章 总结、展望和创新点 | 第97-99页 |
5.1 总结 | 第97-98页 |
5.2 创新点 | 第98页 |
5.3 展望 | 第98-99页 |
参考文献 | 第99-107页 |
致谢 | 第107-108页 |
附录Ⅰ 英文缩略词对照表 | 第108-109页 |
附录Ⅱ 攻读硕士学位期间主要研究成果 | 第109-110页 |