| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-26页 |
| ·番茄果实成熟研究进展 | 第12-16页 |
| ·植物激素与番茄果实成熟 | 第12-14页 |
| ·转录水平调控与番茄果实成熟 | 第14-15页 |
| ·表观遗传学调控与番茄果实成熟 | 第15-16页 |
| ·转录因子LeMADS-RIN研究进展 | 第16-18页 |
| ·miRNA研究进展 | 第18-24页 |
| ·miRNA简介 | 第18页 |
| ·植物中miRNA生物合成 | 第18-19页 |
| ·miRNA分类及作用机理 | 第19-20页 |
| ·miRNA的生物学功能 | 第20-24页 |
| ·番茄果实中miRNA研究进展 | 第24-25页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第25-26页 |
| 第二章 AC和rin突变体花及果实转录组表达分析 | 第26-43页 |
| 摘要 | 第26-27页 |
| ·材料与方法 | 第27-29页 |
| ·番茄果实材料的选取 | 第27页 |
| ·实验方法 | 第27-29页 |
| ·结果与分析 | 第29-41页 |
| ·RNA-seq测序数据统计分析 | 第29-30页 |
| ·差异基因筛选 | 第30-31页 |
| ·筛选RIN调控的果实成熟相关的靶基因 | 第31-35页 |
| ·RIN调控的果实成熟相关新靶基因启动子分析 | 第35-41页 |
| ·讨论 | 第41-43页 |
| 第三章 AC和rin突变体花及果实中miRNAs分离鉴定及表达分析 | 第43-72页 |
| 摘要 | 第43-44页 |
| ·材料与方法 | 第44-50页 |
| ·番茄果实材料的选取 | 第44页 |
| ·实验仪器、试剂和分析软件 | 第44-45页 |
| ·实验方法 | 第45-50页 |
| ·结果与分析 | 第50-69页 |
| ·番茄果实不同成熟时期small RNAs比对到基因组情况 | 第50-51页 |
| ·10个样品中small RNAs的序列长度分布 | 第51-52页 |
| ·番茄果实不同成熟期中small RNAs的分类 | 第52-53页 |
| ·全基因组水平鉴定番茄中保守miRNAs和特异miRNAs | 第53-59页 |
| ·番茄果实中新miRNAs鉴定 | 第59-64页 |
| ·番茄果实中miRNAs及其前体基因表达分析 | 第64-68页 |
| ·miRNA乙烯响应性分析 | 第68-69页 |
| ·讨论 | 第69-72页 |
| ·野生型番茄和rin突变体番茄深度测序reads分布分析 | 第69-70页 |
| ·miRNA差异表达可能是造成rin突变体果实不成熟的原因 | 第70-71页 |
| ·乙烯和miRNA相互作用调控番茄果实成熟 | 第71-72页 |
| 第四章 番茄果实降解组测序大规模寻找miRNAs靶基因 | 第72-84页 |
| 摘要 | 第72-74页 |
| ·材料与方法 | 第74-75页 |
| ·番茄果实材料的选取 | 第74页 |
| ·番茄果实材料RNA的提取 | 第74页 |
| ·降解组测序数据分析 | 第74页 |
| ·qRT-PCR检测靶基因表达 | 第74-75页 |
| ·结果与分析 | 第75-82页 |
| ·降解组文库reads基本统计分析 | 第75-76页 |
| ·降解组分析鉴定miRNA靶基因 | 第76-81页 |
| ·miRNA和其靶基因表达相关性分析 | 第81-82页 |
| ·讨论 | 第82-84页 |
| 第五章 转录因子RIN对miRNA前体基因表达调控研究 | 第84-105页 |
| 摘要 | 第84-85页 |
| ·材料与方法 | 第85-96页 |
| ·实验材料 | 第85页 |
| ·实验方法 | 第85-96页 |
| ·结果与分析 | 第96-102页 |
| ·PET-30a-RIN和PET-30a-tRIN原核表达载体构建 | 第96页 |
| ·RIN蛋白原核表达 | 第96-97页 |
| ·抗体制备及效价测定 | 第97-98页 |
| ·miRNA启动子分析 | 第98-101页 |
| ·CHIP筛选RIN靶基因 | 第101页 |
| ·EMSA实验证明RIN蛋白与MIR172a启动子结合 | 第101-102页 |
| ·讨论 | 第102-105页 |
| 第六章 结论与展望 | 第105-107页 |
| ·主要结论 | 第105页 |
| ·主要创新点 | 第105-106页 |
| ·展望 | 第106-107页 |
| 参考文献 | 第107-114页 |
| 附录 | 第114-118页 |
| 致谢 | 第118-119页 |
| 作者简介 | 第119页 |
