| 摘要 | 第4-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-22页 |
| 1.1 动物源性肠杆菌科细菌耐药性与食品安全 | 第12-14页 |
| 1.2 动物源性肠杆菌科细菌耐药性的研究进展 | 第14-18页 |
| 1.2.1 常见的肠杆菌科细菌 | 第14页 |
| 1.2.2 动物源性肠杆菌科细菌耐药性的来源和传播 | 第14-16页 |
| 1.2.3 动物源性细菌的耐药机制 | 第16-18页 |
| 1.3 质粒和染色体介导的耐药机制 | 第18-19页 |
| 1.3.1 质粒介导的耐药机制 | 第18页 |
| 1.3.2 染色体遗传基因介导的耐药机制 | 第18-19页 |
| 1.4 测序和生物信息学分析在细菌耐药性研究中的应用 | 第19-20页 |
| 1.4.1 测序技术与应用 | 第19-20页 |
| 1.4.2 生物信息学技术与应用 | 第20页 |
| 1.4.3 测序技术和生物信息学技术结合应用于耐药性研究 | 第20页 |
| 1.5 研究内容及意义 | 第20-22页 |
| 1.5.1 研究内容 | 第20-21页 |
| 1.5.2 意义 | 第21-22页 |
| 第二章 四株动物源性肠杆菌科细菌的多药耐药性研究 | 第22-40页 |
| 2.1 前言 | 第22-23页 |
| 2.2 材料 | 第23-25页 |
| 2.2.1 菌株来源 | 第23页 |
| 2.2.2 仪器与设备 | 第23-24页 |
| 2.2.3 试剂与培养基 | 第24-25页 |
| 2.3 方法 | 第25-34页 |
| 2.3.1 耐药菌株的分离与鉴定 | 第25-26页 |
| 2.3.2 纸片扩散法测定药物敏感性 | 第26页 |
| 2.3.3 改良CarbaNP法检测碳青霉烯酶活性 | 第26-28页 |
| 2.3.4 耐药基因筛查 | 第28-30页 |
| 2.3.5 质粒接合转移 | 第30-31页 |
| 2.3.6 稀释法测定药物敏感性 | 第31-32页 |
| 2.3.7 从接合子中提取质粒DNA | 第32页 |
| 2.3.8 NexteraMatePair大片段文库构建 | 第32-33页 |
| 2.3.9 质粒测序与生物信息学分析 | 第33-34页 |
| 2.4 结果 | 第34-38页 |
| 2.4.1 四株动物源性分离株的鉴定 | 第34-35页 |
| 2.4.2 碳青霉烯酶活性测定 | 第35页 |
| 2.4.3 耐药基因筛查 | 第35-36页 |
| 2.4.4 质粒接合转移 | 第36-37页 |
| 2.4.5 稀释法测定药物敏感性 | 第37-38页 |
| 2.5 讨论 | 第38-40页 |
| 第三章 IncI型复合群质粒的测序和比较基因组分析 | 第40-52页 |
| 3.1 前言 | 第40-41页 |
| 3.2 材料 | 第41页 |
| 3.3 方法 | 第41页 |
| 3.4 结果 | 第41-51页 |
| 3.4.1 相关试验菌株获得及耐药表型与遗传背景分析 | 第41-46页 |
| 3.4.2 IncI型复合群质粒进化和比较基因组学分析 | 第46-51页 |
| 3.5 讨论 | 第51-52页 |
| 第四章 总结、创新点和展望 | 第52-54页 |
| 4.1 总结 | 第52-53页 |
| 4.1.1 四株动物源性肠杆菌科病原菌的耐药性研究 | 第52页 |
| 4.1.2 IncI型复合群质粒的进化和比较基因组学分析 | 第52-53页 |
| 4.2 创新点和展望 | 第53-54页 |
| 4.2.1 创新点 | 第53页 |
| 4.2.2 展望 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-61页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
