| 致谢 | 第1-8页 |
| 摘要 | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-19页 |
| ·冷冻贮藏食品 | 第9-11页 |
| ·速冻食品简介 | 第9页 |
| ·速冻食品发展历程 | 第9-10页 |
| ·冷藏食品微生物安全 | 第10-11页 |
| ·食品冷冻贮藏中的金黄色葡萄球菌 | 第11-12页 |
| ·金黄色葡萄球菌简介 | 第11-12页 |
| ·金黄色葡萄球菌对冷冻类食品的危害 | 第12页 |
| ·亚致死致病菌 | 第12-13页 |
| ·亚致死致病菌的定义 | 第12页 |
| ·亚致死致病菌的特征和危害 | 第12-13页 |
| ·冷冻胁迫下的亚致死金黄色葡萄球菌 | 第13页 |
| ·转录组测序 | 第13-17页 |
| ·高通量测序技术的发展 | 第13-14页 |
| ·高通量测序技术在转录组学的应用（RNA-seq） | 第14-15页 |
| ·细菌转录组测序技术 | 第15-17页 |
| ·细菌转录组测序技术流程 | 第15-16页 |
| ·细菌转录组测序的应用 | 第16-17页 |
| ·研究意义和内容 | 第17-19页 |
| ·研究意义和目的 | 第17-18页 |
| ·研究主要内容 | 第18-19页 |
| 第二章：-18℃不同冷冻时间下金黄色葡萄球菌的亚致死和失活规律及其生理指标变化 | 第19-26页 |
| ·前言 | 第19-20页 |
| ·材料与方法 | 第20-22页 |
| ·材料与试剂 | 第20页 |
| ·仪器设备 | 第20页 |
| ·试验方法 | 第20-22页 |
| ·样品制备 | 第20页 |
| ·总活性细胞数和未受损细胞数的测定 | 第20-21页 |
| ·亚致死率的测定 | 第21页 |
| ·菌液电导率的测定 | 第21页 |
| ·细胞蛋白泄漏量的测定 | 第21页 |
| ·菌液可溶性总糖的测定 | 第21页 |
| ·细胞膜完整性的测定 | 第21-22页 |
| ·结果与分析 | 第22-24页 |
| ·-18 ℃下金黄色葡萄球菌总活菌数，未受损活菌数和亚致死率的变化 | 第22-23页 |
| ·-18 ℃下金黄色葡萄球菌电导率和蛋白泄漏量的变化 | 第23页 |
| ·-18℃下金黄色葡萄球菌总还原糖含量的变化 | 第23-24页 |
| ·-18 ℃下金黄色葡萄球菌细胞膜破损率的变化 | 第24页 |
| ·小结 | 第24-26页 |
| 第三章：-18 ℃冻藏条件下亚致死金黄色葡萄球菌转录组测序分析 | 第26-59页 |
| ·前言 | 第26-27页 |
| ·材料与方法 | 第27-36页 |
| ·主要试剂与耗材 | 第27-28页 |
| ·主要仪器设备 | 第28页 |
| ·试验方法 | 第28-36页 |
| ·样品制备 | 第28页 |
| ·总 RNA 提取 | 第28-29页 |
| ·总 RNA 琼脂糖凝胶电泳 | 第29页 |
| ·总 RNA 质量检测 | 第29-30页 |
| ·反转录 cDNA | 第30-31页 |
| ·cDNA 文库制备流程 | 第31-32页 |
| ·数据分析流程 | 第32页 |
| ·Real time-PCR 验证 | 第32-36页 |
| ·测序结果与分析 | 第36-57页 |
| ·测序结果统计 | 第36页 |
| ·组装结果统计 | 第36-38页 |
| ·基因结构注释统计结果 | 第38-39页 |
| ·ORF 预测 | 第38页 |
| ·SSR 分析 | 第38-39页 |
| ·SNP 分析 | 第39页 |
| ·基因表达注释与差异分析结果 | 第39-41页 |
| ·Unigenes 的表达定量分析 | 第39页 |
| ·差异表达分析 | 第39-41页 |
| ·基因功能注释 | 第41-54页 |
| ·Unigenes 注释 | 第41-42页 |
| ·差异基因表达注释 | 第42-54页 |
| ·差异表达基因 GO 分类 | 第42-49页 |
| ·差异基因表达 COG 注释 | 第49-51页 |
| ·差异表达基因 KEGG 注释 | 第51-53页 |
| ·差异基因 NR 、NT 注释 | 第53-54页 |
| ·差异基因 Real time-PCR 验证结果 | 第54-57页 |
| ·小结 | 第57-59页 |
| 第四章：结论与展望 | 第59-61页 |
| ·全文总结 | 第59页 |
| ·创新点与展望 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-68页 |
| ABSTRACT | 第68-69页 |
