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PCR-DGGE技术分析传统发酵蔬菜中微生物群落结构

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
1 文献综述第11-19页
   ·DGGE定义第11页
   ·PCR-DGGE技术的基本原理第11-12页
   ·PCR-DGGE技术在微生物生态中的应用第12-15页
     ·研究微生物类群的多样性第12-13页
     ·微生物变化的动态监测第13页
     ·检测微生物的富集与分离第13-14页
     ·DNA提取方法的比较第14-15页
     ·对功能基因多样性的研究第15页
   ·PCR-DGGE技术在发酵食品微生物研究中的应用进展第15-17页
     ·食品中微生物的分离与鉴定第15-16页
     ·发酵过程中微生物的动态监测第16页
     ·食品质量监测与控制第16-17页
     ·检测食源性致病微生物第17页
   ·PCR-DGGE在发酵蔬菜中的应用第17-18页
   ·立题的目的与意义第18-19页
2 材料与方法第19-31页
   ·实验材料第19-20页
   ·主要实验设备及试剂第20页
   ·总DNA的提取第20-21页
   ·PCR扩增第21-24页
     ·细菌16S rDNA的V3区段用于DGGE分析第21-23页
     ·真菌ITS区段用于DGGE分析第23-24页
     ·PCR产物检测第24页
   ·PCR产物的变性梯度凝胶电泳(DGGE)第24-26页
     ·浓度梯度的确定第24-25页
     ·灌胶第25页
     ·电泳第25-26页
     ·染色(银染)第26页
     ·银染回收第26页
   ·克隆第26-30页
     ·PCR扩增第26-27页
     ·PCR产物的纯化第27-28页
     ·感受态细胞的制备第28页
     ·构建克隆质粒第28-29页
     ·转化至感受态细胞第29页
     ·检测第29-30页
     ·测序第30页
   ·数据处理第30-31页
     ·DGGE指纹图谱的生物信息学分析第30页
     ·相似性分析及细菌系统进化分析第30-31页
3 结果与分析第31-48页
   ·总DNA的提取第31页
   ·PCR扩增第31-33页
     ·16S rDNA的V3区的PCR扩增第31-32页
     ·真菌ITS区的PCR扩增第32-33页
   ·克隆第33-34页
     ·阳性克隆的鉴定第33-34页
   ·泡菜DGGE结果第34-41页
     ·细菌16S rDNA PCR扩增产物DGGE图谱分析第34-39页
     ·真菌ITS区域PCR扩增产物DGGE图谱分析第39-41页
   ·芽菜和冬菜DGGE结果第41-48页
     ·芽菜和冬菜中细菌DGGE图谱第41-46页
     ·芽菜冬菜中真菌DGGE图谱第46-48页
4 讨论第48-54页
   ·泡菜中微生物群落结构多样性第48-50页
   ·芽菜和冬菜中微生物群落结构多样性第50-51页
   ·两类发酵蔬菜中微生物比较第51页
   ·酵母菌在发酵蔬菜中的地位第51-52页
   ·PCR-DGGE对此实验的影响第52-54页
     ·巢式PCR第52页
     ·细菌引物的选择第52-53页
     ·真菌引物的选择第53页
     ·银染对后续工作的影响第53页
     ·实验改进及展望第53-54页
5 结论第54-56页
参考文献第56-64页
致谢第64-65页
攻读学位期间发表的学术论文第65页

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