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酿酒酵母中β-香树脂醇合成途径的构建与调控

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
前言第14-15页
第1章 绪论第15-35页
    1.1 β-香树脂醇概述第15-20页
        1.1.1 β-香树脂醇的结构与性质第15页
        1.1.2 β-香树脂醇的生物活性与用途第15-16页
        1.1.3 β-香树脂醇的来源第16-18页
        1.1.4 β-香树脂醇的生物合成途径及在三萜合成中的地位第18-20页
    1.2 工程化微生物细胞合成萜类化合物第20-26页
        1.2.1 工程化大肠杆菌合成萜类化合物第20-22页
        1.2.2 工程化酿酒酵母合成萜类化合物第22-25页
        1.2.3 酿酒酵母合成 β-香树脂醇的研究现状第25-26页
    1.3 酿酒酵母中人工途径的组装与调控第26-34页
        1.3.1 DNA与途径组装技术第26-29页
        1.3.2 酶表达水平的调控第29-31页
        1.3.3 代谢途径酶的空间定位第31页
        1.3.4 基于Cre/LoxP系统的基因敲除第31-32页
        1.3.5 ZENs和TALENs基因组编辑技术第32-33页
        1.3.6 CRISPR/ Cas介导的基因组编辑技术第33-34页
    1.4 本课题研究的内容和意义第34-35页
第2章 β-香树脂醇合成途径在酿酒酵母中的构建第35-55页
    引言第35页
    2.1 材料第35-39页
        2.1.1 菌种与质粒第35-37页
        2.1.2 药品及试剂第37-38页
        2.1.3 仪器第38-39页
        2.1.4 培养基第39页
    2.2 方法第39-49页
        2.2.1 酿酒酵母的培养第39-40页
        2.2.2 酵母基因组的提取第40页
        2.2.3 目标片段的扩增与基因表达盒构建第40-42页
        2.2.4 质粒的线性化第42页
        2.2.5 DNA与质粒的组装第42-43页
        2.2.6 酵母总RNA的提取及反转录第43-44页
        2.2.7 基因表达水平检测第44-46页
        2.2.8 菌体生物量的测定第46-47页
        2.2.9 β-香树脂醇及其它代谢物的提取与测定第47-49页
    2.3 结果与讨论第49-53页
        2.3.1 β-香树脂醇合成途径在酿酒酵母中的构建第49-50页
        2.3.2 β-香树脂醇合酶在酿酒酵母中的转录情况第50-51页
        2.3.3 酿酒酵母工程菌SpKb发酵产物的鉴定第51-52页
        2.3.4 不同表达载体对 β-香树脂醇合成的影响第52-53页
    2.4 小结第53-55页
第3章 平衡前体物鲨烯代谢提高 β-香树脂醇合成第55-78页
    引言第55-56页
    3.1 材料第56-58页
        3.1.1 菌种与质粒第56-57页
        3.1.2 药品及试剂第57页
        3.1.3 仪器第57页
        3.1.4 培养基第57-58页
    3.2 方法第58-68页
        3.2.1 酵母基因组的提取第58页
        3.2.2 大肠杆菌的基因组提取第58页
        3.2.3 途径的构建与组装方法第58-59页
        3.2.4 过表达鲨烯单加氧酶工程菌株的构建第59-62页
        3.2.5 强化鲨烯合成工程菌的构建第62-64页
        3.2.6 SRE在启动子中的重构与工程菌构建方法第64-66页
        3.2.7 基因表达分析第66页
        3.2.8 绿色荧光蛋白荧光强度检测方法第66-67页
        3.2.9 其他分析方法第67-68页
    3.3 结果与讨论第68-77页
        3.3.1 外源鲨烯单加氧酶的表达与效果第68-70页
        3.3.2 强化鲨烯供应提高 β-香树脂醇合成第70-72页
        3.3.3 利用UPC2结合位点重构启动子增强途径表达效率第72-74页
        3.3.4 过表达UPC2-1 对 β-香树脂醇合成的影响第74-77页
    3.4 小结第77-78页
第4章 CRISPR/d Cas9修饰酵母内源途径优化 β-香树脂醇合成第78-100页
    引言第78-79页
    4.1 材料第79-80页
        4.1.1 菌种与质粒第79页
        4.1.2 药品及试剂第79-80页
        4.1.3 仪器第80页
        4.1.4 培养基第80页
    4.2 方法第80-90页
        4.2.1 目标片段的扩增与基因表达盒构建第80-81页
        4.2.2 途径的构建与组装方法第81页
        4.2.3 表达dCas9蛋白工程菌的构建第81-82页
        4.2.4 CRISPR/dCas9验证系统的构建第82-84页
        4.2.5 乙酰辅酶A合成强化工程菌的构建方法第84-86页
        4.2.6 目标基因gRNA的设计与工程菌构建第86-89页
        4.2.7 基因表达分析第89页
        4.2.8 β-半乳糖苷酶活性的测定第89-90页
        4.2.9 其他分析方法第90页
    4.3 结果与讨论第90-99页
        4.3.1 酿酒酵母中CRISPR/dCas9的设计第90-91页
        4.3.2 dCas9蛋白表达模块的构建第91-92页
        4.3.3 CRISPR/dCas9在酿酒酵母中的功能验证第92-94页
        4.3.4 CRISPR/dCas9下调羊毛甾醇合酶第94-96页
        4.3.5 强化胞质乙酰辅酶A合成第96-97页
        4.3.6 CRISPR/dCas9一步多基因修饰 β-香树脂醇合成途径第97-99页
    4.4 小结第99-100页
第5章 产 β-香树脂醇酿酒酵母的发酵工艺优化第100-108页
    引言第100页
    5.1 材料第100-101页
        5.1.1 菌种第100页
        5.1.2 药品及试剂第100页
        5.1.3 仪器第100-101页
        5.1.4 培养基第101页
    5.2 方法第101-102页
        5.2.1 种子液的制备第101页
        5.2.2 2.5L发酵罐培养第101页
        5.2.3 葡萄糖和乙醇浓度的测定第101-102页
        5.2.4 其他分析方法第102页
    5.3 结果与讨论第102-107页
        5.3.1 基础培养条件的优化第102-104页
        5.3.2 葡萄糖补料发酵第104-105页
        5.3.3 乙醇补料发酵第105-106页
        5.3.4 甲基-β-环糊精对 β-香树脂醇合成的影响第106-107页
    5.4 小结第107-108页
第6章 结论与展望第108-110页
    6.1 结论第108-109页
    6.2 创新点第109页
    6.3 对今后工作的建议与展望第109-110页
参考文献第110-124页
攻读学位期间主要研究成果第124-125页
致谢第125-126页
作者简介第126页

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