| 英汉缩略语名词对照 | 第3-5页 |
| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-21页 |
| 1 羊乳 | 第11页 |
| 2 乳酸菌概述 | 第11-13页 |
| 2.1 乳酸菌的定义 | 第11-12页 |
| 2.2 乳酸菌的分类 | 第12页 |
| 2.3 乳酸菌特性 | 第12-13页 |
| 3 乳酸菌的鉴定方法 | 第13-15页 |
| 3.1 表型特征鉴定 | 第13页 |
| 3.2 分子生物学鉴定 | 第13-15页 |
| 3.2.1 分子标记技术 | 第13-14页 |
| 3.2.2 16S rRNA基因序列分析 | 第14-15页 |
| 4 高通量测序在微生物多样性的应用 | 第15-19页 |
| 4.1 高通量测序技术 | 第16页 |
| 4.2 基于宏基因组学的微生物多样性分析 | 第16-18页 |
| 4.3 生物信息学在微生物生态学中的应用 | 第18-19页 |
| 5 本课题研究目的意义及内容 | 第19-21页 |
| 5.1 本课题研究目的与意义 | 第19页 |
| 5.2 研究内容 | 第19页 |
| 5.3 创新点 | 第19-21页 |
| 第二章 羊乳中乳酸菌的分离与鉴定 | 第21-35页 |
| 2.1 材料与方法 | 第21-24页 |
| 2.1.1 羊乳 | 第21页 |
| 2.1.2 试剂及仪器 | 第21-22页 |
| 2.1.3 羊乳样品细菌和乳酸菌组成分析 | 第22页 |
| 2.1.4 乳酸菌的分离与纯化 | 第22-23页 |
| 2.1.5 乳酸菌的保存 | 第23页 |
| 2.1.6 乳酸菌DNA提取及纯度测定 | 第23页 |
| 2.1.7 16S rRNA基因序列的PCR扩增 | 第23-24页 |
| 2.3 结果与分析 | 第24-32页 |
| 2.3.1 羊乳中乳酸菌和细菌的组成 | 第24-26页 |
| 2.3.2 羊乳中乳酸菌的表型鉴定 | 第26-28页 |
| 2.3.3 羊乳中乳酸菌的分子鉴定 | 第28-32页 |
| 2.4 讨论 | 第32-35页 |
| 2.4.1 乳酸菌的分离与鉴定 | 第32-33页 |
| 2.4.2 海氏肠球菌(E.hirae) | 第33-35页 |
| 第三章 羊乳中细菌多样性 | 第35-59页 |
| 3.1 材料与方法 | 第35-36页 |
| 3.1.1 羊乳 | 第35页 |
| 3.1.2 试剂及仪器 | 第35-36页 |
| 3.2 试验方法 | 第36-39页 |
| 3.2.1 羊乳中总DNA提取及纯度测定 | 第36页 |
| 3.2.2 16S rRNA基因的V3-V4区特异性扩增 | 第36-37页 |
| 3.2.3 PCR产物的混样和纯化及测序 | 第37页 |
| 3.2.4 高序列质量控制 | 第37-38页 |
| 3.2.5 序列生物信息学分析 | 第38-39页 |
| 3.3 结果与分析 | 第39-56页 |
| 3.3.1 羊乳样品总DNA的提取结果 | 第39页 |
| 3.3.2 DNA的16S rRNA基因的V3-V4区扩增 | 第39-40页 |
| 3.3.3 测序深度及样品测序量说明 | 第40-41页 |
| 3.3.4 OTU聚类及物种注释概况 | 第41-45页 |
| 3.3.5 样品复杂度分析—Alpha多样性 | 第45-49页 |
| 3.3.6 多样品比较分析 | 第49-52页 |
| 3.3.7 羊乳中微生物群落构成 | 第52-56页 |
| 3.4 讨论 | 第56-59页 |
| 3.4.1 原料乳中的微生物多样性 | 第56-57页 |
| 3.4.2 羊乳中有益菌及有害菌 | 第57-59页 |
| 第四章 结论 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-73页 |
| 致谢 | 第73-75页 |
| 攻读学位期间研究成果 | 第75页 |