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肉牛肌内脂肪和相关功能基因集相互关系的生物信息学分析

摘要第9-11页
ABSTRACT第11-13页
缩写符号第14-15页
前言第15-16页
文献综述第16-48页
    1 优质牛肉的特点和消费现状第16-18页
        1.1 我国优质牛肉的生产消费现状第16页
        1.2 优质牛肉的分级参考第16-17页
        1.3 优质牛肉的特点第17-18页
    2 肌内脂肪概述第18-23页
        2.1 肌内脂肪的定义第18-19页
        2.2 肌内脂肪含量和肉质的关系第19-20页
        2.3 肌内脂肪细胞的代谢特点第20-21页
        2.4 肌内脂肪含量与胴体脂肪以及肌纤维类型的关系第21-22页
        2.5 动物沉积肌内脂肪能力的代谢指标第22-23页
    3 评估和预测肌内脂肪含量的方法第23-26页
        3.1 评估肌内脂肪水平的常用方法第23-24页
            3.1.1 近红外第24页
            3.1.2 超声波第24页
        3.2 预测肌内脂肪的方法第24-26页
            3.2.1 遗传标记第24-25页
            3.2.2 基因表达第25页
            3.2.3 蛋白组学第25-26页
    4 骨骼肌主要细胞和组织的发育第26-32页
        4.1 骨骼肌发育第27-28页
        4.2 脂肪细胞和脂肪组织的发育第28-30页
            4.2.1 概述第28-29页
            4.2.2 调控脂肪生成的机制第29-30页
        4.3 结缔组织的发育第30-31页
            4.3.1 结缔组织的发育与肉品嫩度的关系第30页
            4.3.2 调控纤维生成的机制第30-31页
        4.4 脂肪细胞和成纤维细胞具有共同的祖先细胞第31-32页
    5 研究目的和意义第32-33页
    参考文献第33-48页
第一章 利用表达谱筛选与肉牛肌内脂肪含量相关的基因第48-72页
    1 材料与方法第48-53页
        1.1 数据集第49-52页
        1.2 统计和生物信息学分析第52-53页
    2 结果与讨论第53-67页
        2.1 牛和羊中与肌内脂肪相关的通用基因第53-59页
        2.2 综合分析筛选与肌内脂肪含量相关的较小基因集第59-61页
        2.3 IMF 5 gene set的确定和验证第61-62页
        2.4 利用多个基因的表达水平评估不同动物之间肌内脂肪含量的不同第62-67页
    3 本章小结第67-68页
    参考文献第68-72页
第二章 根据基因表达建立肉牛肌内脂肪含量预测模型第72-86页
    1 材料与方法第73-76页
        1.1 试验动物第73-74页
        1.2 qPCR引物设计和实验条件第74-75页
        1.3 统计第75-76页
    2 结果和讨论第76-82页
        2.1 IMF5 gene set中的单个基因与肌内脂肪含量的相关性第76-77页
        2.2 IMF5 gene set拟合的表达量与肌内脂肪含量的相关性第77-79页
        2.3 胴体重,肌内脂肪含量和IMF 5 gene set基因表达之间的相互关系第79-81页
        2.4 基于基因表达的肌内脂肪预测模型的应用前景第81-82页
    3 本章小结第82页
    参考文献第82-86页
第三章 分析表达谱寻找与肉牛骨骼肌生长相关的基因和细胞群体第86-112页
    1 材料与方法第87-89页
        1.1 基因表达数据集第87-88页
        1.2 统计与生物信息学分析第88-89页
    2 结果和讨论第89-106页
        2.1 基因表达和平均日增重间的相关性第89页
        2.2 优化基因筛选条件第89-90页
        2.3 多基因拟合第90页
        2.4 细胞周期相关基因在发育过程中的表达模式第90-93页
        2.5 卫星细胞标记基因在发育过程的表达模式第93-94页
        2.6 合成细胞外基质的细胞群体是细胞周期基因的主要来源第94-102页
        2.7 牛骨骼肌中基因表达和细胞群体的联系第102-103页
        2.8 成纤维细胞和脂肪细胞家族可能是细胞周期基因的主要来源第103页
        2.9 细胞周期基因表达模式的变化与肌内脂肪生成的关系第103-105页
        2.10 激素生长促进剂对牛背最长肌生长中关键过程的影响第105-106页
    3 本章小结第106页
    参考文献第106-112页
全文结论第112-114页
创新说明第114-116页
工作展望第116-118页
致谢第118-120页
在读期间文章发表情况第120-121页

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